Платформа разработки аптамеров

Платформа аптамеров, предоставляемая Alpha Lifetech, включает две категории: платформу синтеза аптамеров и платформу скрининга аптамеров.

СВЯЗАТЬСЯ С НАМИ

Платформа разработки аптамеров

Аптамеры представляют собой одноцепочечные олигонуклеотиды (ДНК, РНК или КНК), обладающие высокой аффинностью и высокой специфичностью, которые специфически связываются с целевыми молекулами, такими как антитела, и широко используются для разработки биосенсоров, диагностики и терапии.

Платформа аптамеров, предоставляемая Alpha Lifetech, включает две категории: платформу синтеза аптамеров, которая в основном включает в себя службу синтеза библиотеки аптамеров SELEX и службу разработки аптамеров (ДНК, РНК или КсНК), и платформу скрининга аптамеров, включающую службы скрининга на основе технологии SELEX для белков, пептидов, клеток, малых молекул, ионов металлов и других целевых молекул, а также службы последующей оптимизации и анализа идентификации аптамеров.

Платформа синтеза аптамеров

Служба синтеза библиотеки аптамеров SELEX

Служба синтеза библиотеки аптамеров SELEX в основном заключается в построении библиотеки, содержащей большое количество случайных одноцепочечных олигонуклеотидных последовательностей путем химического синтеза in vitro в соответствии с целевыми молекулами. Построение библиотеки является отправной точкой технологии SELEX, которая обеспечивает обильные последовательности-кандидаты для последующего процесса скрининга путем построения огромных случайных библиотек и увеличивает возможность скрининга высокоаффинных аптамеров.

Синтез библиотеки в основном делится на следующие этапы:

Шаги	Подробности технологии
Определить целевые молекулы	Определите целевые молекулы, которые необходимо проверить на наличие аптамеров, которыми могут быть белки, нуклеиновые кислоты, малые молекулы, ионы металлов и т. д.
Дизайн случайной последовательности	Длина случайной последовательности, состав оснований и другие параметры были разработаны в соответствии с характеристиками целевых молекул и требованиями скрининга. Обычно случайные последовательности имеют длину от десятков до сотен оснований.
Синтез фиксированных последовательностей	Разрабатываются и синтезируются фрагменты олигонуклеотидов с фиксированными последовательностями (например, последовательностями праймеров ПЦР) на обоих концах, которые будут использоваться в последующем процессе амплификации и скрининга.

Синтезированную библиотеку еще нужно дополнительно обработать для контроля качества. Концентрация библиотеки была определена для обеспечения ее применимости в последующем процессе скрининга. Разнообразие и точность случайных последовательностей в библиотеке были проверены секвенированием и другими методами для обеспечения того, чтобы качество библиотеки соответствовало требованиям скрининга.

С помощью вышеописанных шагов можно синтезировать высококачественную и разнообразную библиотеку аптамеров SELEX, которая может предоставить обширные кандидатные последовательности для последующего процесса скрининга.

Услуги по разработке аптамеров (ДНК, РНК или КсНА)

Аптамеры обычно относятся к аптамерам нуклеиновых кислот. Аптамеры нуклеиновых кислот включают ДНК-аптамеры, РНК-аптамеры и XNA-аптамеры, которые являются химически модифицированными аптамерами нуклеиновых кислот. Метод SELEX широко применяется для разработки аптамеров. Основной рабочий процесс услуг по разработке аптамеров включает создание библиотеки, связывание с мишенью, изоляцию и очистку, амплификацию, несколько раундов скрининга и идентификацию последовательности. В течение многих лет мы фокусируемся на создании библиотеки и богатом опыте в разработке аптамеров. Мы стремимся предоставлять клиентам более качественные услуги.

Технологический процесс SELEX

Процесс SELEX состоит из нескольких раундов, каждый из которых включает следующие ключевые этапы:

Библиотечное и целевое связывание

Сконструированная библиотека нуклеиновых кислот смешивается со специфическими целевыми молекулами (такими как белки, низкомолекулярные соединения и т. д.), так что последовательности нуклеиновых кислот в библиотеке имеют возможность связываться с целевыми молекулами.

Выделение несвязанных молекул

Последовательности нуклеиновых кислот, не связанные с целевой молекулой, отделяются от смеси с помощью специальных методов, таких как аффинная хроматография, разделение магнитными частицами и т. д.

Усиление связывающих молекул

Последовательность нуклеиновой кислоты, связанная с целевой молекулой, амплифицируется, обычно с использованием технологии полимеразной цепной реакции (ПЦР). Для последующей фазы скрининга амплифицированные последовательности будут использоваться в качестве стартовой библиотеки.

Рис. 1: Процесс скрининга SELEX

Платформа скрининга аптамеров

Служба скрининга аптамеров

Alpha Lifetech предлагает широкий спектр специализированных услуг по скринингу аптамеров, применяя различные методики SELEX для разных типов молекул:

Типы целей	Технические подробности
Скрининг белковых аптамеров с помощью SELEX	Основная цель скрининга белковых аптамеров — скрининг аптамеров, которые могут специфически связываться с целевыми молекулами белков. Такие аптамеры проще синтезировать, они более стабильны и менее восприимчивы к факторам окружающей среды.
Скрининг пептидных аптамеров с помощью SELEX	Пептидные аптамеры представляют собой класс коротких пептидных последовательностей с высокой специфичностью и сродством, которые могут специфически связываться с целевыми веществами и демонстрировать широкий спектр потенциала применения в области биомедицины. С помощью специального процесса скрининга пептидные аптамеры, которые могут специфически связываться с целевыми молекулами, отбираются из большого количества случайных библиотек пептидных последовательностей.
Скрининг клеточно-специфических аптамеров (Cell-SELEX)	В качестве мишеней готовятся клетки-мишени или определенные молекулы на поверхности клетки. Мишенями могут быть целые клетки, рецепторы на клеточной мембране, белки или другие малые молекулы.
Скрининг аптамеров малых молекул с помощью Capture SELEX	Capture SELEX — это метод скрининга in vitro для скрининга аптамеров малых молекул, который является вариантом SELEX. Capture SELEX особенно хорошо подходит для скрининга аптамеров малых молекул-мишеней, которые обычно имеют меньше функциональных групп и которые трудно иммобилизовать непосредственно на твердофазных носителях.
Услуги SELEX на основе живых животных	Служба скрининга на основе живых животных — это экспериментальная методика, широко используемая в области биологии, медицины и биотехнологии, которая использует живых животных в качестве экспериментальных моделей для скрининга и оценки определенных молекул, лекарственных средств, терапевтических средств или биологических процессов. Службы предназначены для моделирования физиологической среды в организме человека для более точного прогнозирования и оценки эффективности и безопасности экспериментальных результатов в организме человека.

Служба оптимизации Aptamer

Гидрофильность, высокая потеря сродства во время производства и быстрое выведение аптамеров ограничивают их применение. В настоящее время были исследованы различные методы оптимизации для повышения производительности аптамеров.

У нас также есть множество способов оптимизации аптамера, включающих усечение, модификации, конъюгацию с соответствующей группой (тиол, карбокси, амин, флуорофор и т. д.).

Служба анализа характеристик аптамеров

Служба анализа характеристик аптамеров относится к профессиональным услугам по разрешению структуры оценки производительности и функциональной проверке полученного аптамера для обеспечения соответствия аптамера требованиям специфической связывающей способности, стабильности и специфичности. Она в основном включает анализ сродства и специфичности, оценку стабильности и проверку биологической функции.

Синтез аптамеров

Аптамерный скрининг

Оптимизация аптамера

Аптамерный анализ

Исследование аптамеров

Если у вас возникнут какие-либо вопросы, пожалуйста, обращайтесь к нам в любое время.