خدمة تحسين أبتامر

الأبتامرات هي أوليجونوكليوتيدات أحادية السلسلة، قادرة على الارتباط تحديدًا بالجزيئات المستهدفة. تُشكل هذه الأبتامرات بنية ثلاثية الأبعاد محددة بعد طيّها التكيفي عبر قوى تفاعل متنوعة، مثل الاقتران التكاملي للقواعد النوكليوتيدية، والرابطة الهيدروجينية، وتراكم π-π، والقوة الكهروستاتيكية، وغيرها. ترتبط هذه البنية تحديدًا بالجزيئات المستهدفة عبر القوة بين الجزيئات. تُنتج الأبتامرات عادةً عن طريق فحص SELEX. تُركز طرق تحسين الأبتامرات بشكل رئيسي على تحسين ألفة الأبتامرات وانتقائيتها واستقرارها.

تلتزم ألفا لايف تك بتزويد عملائها بخدمات فحص وتحسين أبتامر الأحماض النووية بدقة وكفاءة. ولا تُعد عملية الفحص والتحسين خطوةً أساسيةً في الحصول على أبتامر عالية الجودة فحسب، بل تُمثل أيضًا أساسًا هامًا لتطوير هذه التطبيقات. وتواصل ألفا لايف تك تقديم أحدث التقنيات وتحسين عمليات الخدمة لضمان ريادة خدماتنا في هذا المجال، وتوفير تجربة فحص وتحسين أبتامر الأحماض النووية أكثر كفاءةً لعملائها.

اختيار SELEX Aptamer

تركز شركة Alpha Lifetech على تطوير أبتامر الأحماض النووية لسنوات عديدة، وتنقسم بشكل أساسي إلى تصميم أبتامر الأحماض النووية، وبناء مكتبة أبتامر الأحماض النووية، وفحص أبتامر الأحماض النووية، وتوليف أبتامر الأحماض النووية.

تقنية فحص سيليكس هي الطريقة الرئيسية لفحص الأبتامرات. لا تقتصر شركة ألفا لايف تيك على اختيار أبتامرات سيليكس فحسب، بل توفر أيضًا طرقًا أخرى قائمة على تقنية سيليكس، مثل سيل-سيليكس، وسي إي-سيليكس، وكابتشر-سيليكس، وغيرها. من خلال فحص الأبتامرات في المختبر، يتم الحصول على أبتامرات قادرة على تحديد الجزيء المستهدف بدقة وتتمتع بألفة عالية تجاهه، ثم يُجرى تسلسل عالي الإنتاجية للأبتامرات التي تم فحصها، وأخيرًا يتم تصنيع الأبتامرات من خلال التخليق الكيميائي في المختبر. بالإضافة إلى ذلك، تستطيع ألفا لايف تيك تحسين الأبتامرات المختارة والتحقق من وظائفها.

مقدمة لتحسين Aptamer

على الرغم من أن الأبتامرات الحمضية النووية التي تم فحصها بواسطة تقنية SELEX تتمتع بتقارب قوي للجزيئات المستهدفة، إلا أنه في التطبيقات العملية، لا تزال الأبتامرات بحاجة إلى التحسين لتحسين خصوصية الأبتامرات وتقاربها واستقرارها بشكل أكبر لتلبية احتياجات سيناريوهات التطبيق المحددة.

تتضمن طرق تحسين الأبتامر الرئيسية الجوانب التالية:

قطع الهيكل

الاختصار: من خلال إزالة أجزاء من تسلسل الأبتامر التي لا تؤثر أو تؤثر بشكل أقل على قدرة ربط الجزيء المستهدف، والحفاظ على منطقة التعرف الأساسية، يمكن تقصير طول الأبتامر، ويمكن تحسين كفاءة تركيبه واستقرار الأبتامر.

بناءً على محاكاة البنية الثانوية والتجربة والخطأ، تم تعريف البنية المحلية العليا للأبتامر (مثل حلقة الجذع، والوصلة الزائفة، ورباعية G، وما إلى ذلك) بشكل مصطنع، وتمت إزالة السلاسل المفردة غير المشكلة أو المزدوجة، وتم تقصير الجذع، وتمت إزالة الحلقات المحدبة الصغيرة، وتم تقليل الحلقات، وما إلى ذلك. يتم استخدام تقنية الالتحام الجزيئي للتنبؤ بالبنية ثلاثية الأبعاد للأبتامر والجزيء المستهدف من أجل تصميم أكثر دقة.

مقدمة عن الطفرة

طفرة عشوائيةباستخدام تقنيات الطفرات (مثل طفرة تفاعل البوليميراز المتسلسل) لإدخال طفرات عشوائية في تسلسل الأبتامر، وإعادة الفرز بتقنية SELEX، يمكن الحصول على طفرات ذات ألفة وانتقائية أعلى. تُمكّن هذه الطريقة من استكشاف تنوع تسلسلات الأبتامر واكتشاف أنماط ارتباط جديدة واتجاهات تحسين جديدة.

طفرة خاصة بالموقعبناءً على التحليل البنيوي وتوقع مواقع الارتباط، تُختار مواقع الطفرات المحتملة لاستبدال قاعدة واحدة أو قواعد متعددة، وذلك لاستكشاف آثار التسلسلات المختلفة على أداء الأبتامر. يمكن للطفرة الخاصة بالموقع التحكم بدقة في التغيرات البنيوية للأبتامر لتحسين أدائه.

التعديل الكيميائي

يتم تعديل الأبتامر كيميائيًا، ويتم إدخال مجموعات التعديل في مواضع مختلفة من الأبتامر (مثل القاعدة، حلقة السكر، مجموعة الفوسفات، إلخ) لتحسين الاستقرار والقدرة المضادة للنوكلياز وتقارب الأبتامر.

الشكل 1: التعديلات الشائعة للأبتامرات. (المصدر المرجعي:كتاب "الأحماض النووية"، فصل "أبتامرات الأحماض النووية"

تشمل التعديلات الشائعة 2'-فلوروريبوز، و2'-أمينو ريبوز، و2'-أو-ميثيل ريبوز، والحمض النووي المقفل (LNA)، والحمض النووي البيورين غير الميثيلي (UNA). يمكن لهذه التعديلات أن تقلل من قدرة النوكليازات على مقاومة التحلل، أو أن تغير خصائص ارتباطها بالجزيئات المستهدفة.

مقدمة عن منطقة الوظيفة

يتمتع الأبتامر بوظائف جديدة، مثل نشاط الإنزيم والقدرة على الإبلاغ عن الفلورسنت. تُدمج منطقة ربط الربيطة مع المنطقة التحفيزية لإنتاج أبتامر ذي نشاط إنزيمي. على سبيل المثال، تُنتج إضافة مناطق ترتبط بالجزيئات المُصدرة للفلورسنت أبتامرًا ذاتي الإبلاغ يُصدر إشارة فلورسنتية بعد نجاح ارتباطه بالهدف.