Платформа за разработка на аптамери

Платформата за аптамери, предоставяна от Alpha Lifetech, включва две категории: платформа за синтез на аптамери и платформа за скрининг на аптамери.

Заявка за оферта

Платформа за разработка на аптамери

Аптамерите са едноверижни олигонуклеотиди (ДНК, РНК или XNA) със свойството висок афинитет и висока специфичност, които се свързват специфично с целеви молекули като антитела и се използват широко за разработване на биосензори, диагностика и терапия.

Платформата за аптамери, предоставяна от Alpha Lifetech, включва две категории: платформа за синтез на аптамери, която включва главно услуга за синтез на библиотека от аптамери на SELEX и услуга за разработване на аптамери (ДНК, РНК или XNA), и платформа за скрининг на аптамери, включваща услуги за скрининг, базирани на SELEX технология за протеини, пептиди, клетки, малки молекули, метални йони и други целеви молекули, както и услуги за оптимизация и идентификационен анализ на аптамери надолу по веригата.

Платформа за синтез на аптамери

Услуга за синтез на SELEX аптамерна библиотека

Услугата за синтез на SELEX аптамерни библиотеки включва основно изграждането на библиотека, съдържаща голям брой произволни едноверижни олигонуклеотидни последователности чрез in vitro химичен синтез в съответствие с целевите молекули. Изграждането на библиотеки е отправната точка на SELEX технологията, която осигурява изобилие от кандидат-последователности за последващия процес на скрининг чрез изграждане на огромни произволни библиотеки и увеличава възможността за скрининг на аптамери с висок афинитет.

Синтезът на библиотеките се разделя основно на следните стъпки:

Стъпки	Технологични детайли
Идентифицирайте целевите молекули	Идентифицирайте целевите молекули, които трябва да бъдат скринирани за аптамери, които могат да бъдат протеини, нуклеинови киселини, малки молекули, метални йони и др.
Дизайн на случайна последователност	Дължината на произволната последователност, съставът на базите и други параметри бяха проектирани според характеристиките на целевите молекули и изискванията за скрининг. Обикновено произволните последователности са с дължина между десетки и стотици бази.
Синтез на фиксирани последователности	Проектират се и синтезират олигонуклеотидни фрагменти с фиксирани последователности (като PCR праймерни последователности) в двата края, които ще бъдат използвани в последващия процес на амплификация и скрининг.

Синтезираната библиотека все още се нуждае от допълнителна обработка за контрол на качеството. Концентрацията на библиотеката беше определена, за да се гарантира нейната приложимост в последващия процес на скрининг. Разнообразието и точността на случайните последователности в библиотеката бяха проверени чрез секвениране и други методи, за да се гарантира, че качеството на библиотеката отговаря на изискванията за скрининг.

Чрез горните стъпки може да се синтезира висококачествена и разнообразна SELEX аптамерна библиотека, която може да осигури изобилие от кандидат-последователности за последващия процес на скрининг.

Услуги за разработване на аптамери (ДНК, РНК или XNA)

Аптамерите обикновено се отнасят до аптамери на нуклеинови киселини. Аптамерите на нуклеинови киселини включват ДНК аптамери, РНК аптамери и XNA аптамери, които са химически модифицирани аптамери на нуклеинови киселини. SELEX техниката се използва широко за разработване на аптамери. Основният работен процес на услугите за разработване на аптамери включва изграждане на библиотеки, свързване с цел, изолиране и пречистване, амплификация, множество кръгове на скрининг и идентифициране на последователности. В продължение на много години ние се фокусираме върху изграждането на библиотеки и имаме богат опит в разработването на аптамери. Ние сме ангажирани с предоставянето на по-добри услуги на клиентите.

Технологичен процес SELEX

Процесът SELEX се състои от няколко кръга, всеки от които включва следните ключови стъпки:

Библиотечно и целево свързване

Конструираната библиотека от нуклеинови киселини се смесва със специфични целеви молекули (като протеини, нискомолекулни съединения и др.), така че нуклеиново-киселинните последователности в библиотеката да имат възможност да се свържат с целевите молекули.

Изолиране на несвързани молекули

Нуклеиново-киселинните последователности, които не са свързани с целевата молекула, се отделят от сместа чрез специфични методи, като афинитетна хроматография, магнитно разделяне с перли и др.

Амплификация на свързващите молекули

Нуклеиново-киселинната последователност, свързана с целевата молекула, се амплифицира, обикновено с помощта на технологията на полимеразна верижна реакция (PCR). За следващата фаза на скрининг амплифицираните последователности ще бъдат използвани като изходна библиотека.

Фиг. 1: Процес на скрининг на SELEX

Платформа за скрининг на аптамери

Услуга за скрининг на аптамери

Alpha Lifetech предлага разнообразна гама от специализирани услуги за скрининг на аптамери, прилагайки различни SELEX методологии за различни типове молекули:

Видове цели	Технически подробности
Скрининг на протеинови аптамери чрез SELEX	Основната цел на скрининга на протеинови аптамери е да се скринират аптамери, които могат специфично да се свързват с целеви протеинови молекули. Тези аптамери са по-лесни за синтез, по-стабилни и по-малко податливи на фактори на околната среда.
Скрининг на пептидни аптамери чрез SELEX	Пептидните аптамери са клас къси пептидни последователности с висока специфичност и афинитет, които могат специфично да се свързват с целеви вещества и показват широк спектър от потенциал за приложение в биомедицинската област. Чрез специфичен процес на скрининг, пептидните аптамери, които могат специфично да се свързват с целеви молекули, се скринират от голям брой библиотеки със случайни пептидни последователности.
Клетъчно-специфичен скрининг на аптамери (Cell-SELEX)	Като мишени се подготвят целеви клетки или специфични молекули на клетъчната повърхност. Мишените могат да бъдат цели клетки, рецептори на клетъчната мембрана, протеини или други малки молекули.
Скрининг на аптамери с малки молекули чрез Capture SELEX	Capture SELEX е in vitro скринингова техника за скрининг на аптамери с малки молекули, която е вариант на SELEX. Capture SELEX е особено подходящ за скрининг на аптамери на малки молекулни мишени, които обикновено имат по-малко функционални групи и са трудни за имобилизиране директно върху твърдофазни носители.
SELEX услуги, базирани на живи животни	Скринингът с живи животни е експериментална техника, широко използвана в областта на биологичните науки, медицината и биотехнологиите, която използва живи животни като експериментални модели за скрининг и оценка на специфични молекули, лекарствени средства, терапевтични средства или биологични процеси. Услугите са предназначени да симулират физиологичната среда в човешкото тяло, за да се предскаже и оцени по-точно ефикасността и безопасността на експерименталните резултати в човешкото тяло.

Услуга за оптимизация на аптамери

Хидрофилността, високата загуба на афинитет по време на производството и бързото отделяне на аптамерите ограничават тяхното приложение. Понастоящем са изследвани различни методи за оптимизация за подобряване на производителността на аптамерите.

Също така разполагаме с различни начини за оптимизиране на аптамера, състоящи се от отрязване, модификации, конюгиране към подходящата група (тиолова, карбокси, аминна, флуорофорна и др.).

Услуга за анализ на характеристиката на аптамерите

Услугата за анализ на характеристиката на аптамерите се отнася до професионалната услуга за оценка на производителността, разделителна способност на структурата и функционална проверка на получения аптамер, за да се гарантира, че аптамерът отговаря на изискванията за специфична свързваща способност, стабилност и специфичност. Тя включва главно анализ на афинитета и специфичността, оценка на стабилността и проверка на биологичната функция.