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Neuigkeiten | Clustering komplementaritätsbestimmender Regionen kann zu Funktionsstörungen von CAR-T-Zellen führen

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Neuigkeiten | Clustering komplementaritätsbestimmender Regionen kann zu Funktionsstörungen von CAR-T-Zellen führen

09.01.2025
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In einer am 13. August 2023 in Nature Communications veröffentlichten Studie stellte ein Forscherteam fest, dass die Schleife der komplementaritätsbestimmenden Region (CDR) in einem variablen Einzelkettenfragment (scFv) zur CAR-Aggregation führen kann, die wiederum zum Versagen chimärer Antigenrezeptoren (CAR)-T-Zellen, zum Zelltod und zu einer verringerten Reaktivität der Tumorzellen auf die Expression von Zielantigenen führen kann, was wiederum eine antigenunabhängige Aktivierung und potenzielle Funktionsbeeinträchtigungen zur Folge hat.

Hintergrund und MethodikHINTERGRUND

Die CAR-T-Zelltherapie ist hochwirksam zur Behandlung von Blutkrebs, und bei dieser Zelltherapie ist das Design der CARs noch wichtiger. In dieser Studie wurde die extrazelluläre Domäne des humanen Interleukin-13-Rezeptors alpha 2 (IL13R alpha 2) mithilfe des multiBac-Expressionssystems zusammen mit BirA-Biotinligase exprimiert. Nach einer Reihe optimierter Expressionen des Rezeptorproteins folgten Reinigung und Proteinvalidierung. Eine synthetische humane scFv-Bibliothek wurde für das Phagendisplay-Screening verwendet, und entsprechende scFv-Antikörper wurden durch Festphasenscreening und Bindungsassayanalyse für die Produktion ausgewählt. Geeignete Antikörper wurden für die Konstruktion und Verpackung lentiviraler Vektoren durch SPR- und ELISA-Assays ausgewählt. Die Forscher transduzierten und kultivierten anschließend T-Zellen und untersuchten anschließend die CAR in diesen Zellen mittels konfokaler Mikroskopie. Die Verteilung ist oben. Um das Verhalten von CAR-T-Zellen zu analysieren, untersuchten die Forscher die Bindung von CAR-T-Zellen an rekombinantes IL13R α 2, färbten T-Zell-Oberflächenmarker und untersuchten die Expression von CAR auf der Oberfläche und im Zellinneren. Darüber hinaus untersuchten sie die CAR-T-Zellproliferation und Zytokinsekretion sowie die Genexpression in verschiedenen CAR-T-Konstrukten und betonten deren Unterschiede. In-vivo-Experimente umfassen die Implantation von Tumorzellen in situ in Mäuse, gefolgt von einer CAR-T-Therapie und der Überwachung des Tumorwachstums durch In-vivo-Bildgebungssysteme (IVIS). Die statistische Analyse erfolgt mit GraphPad Prism und Standardsignifikanzmarkern.

AbschlussABSCHLUSS

In der aktuellen Studie untersuchten Forscher die Struktur des CAR-Konstrukts, sein extrazelluläres scFv, den Linker und zusätzliche Domänen, um deren Einfluss auf die CAR-T-Zell-Leistung zu verstehen. Es wurde festgestellt, dass die CDR-Schleife innerhalb des scFv für die Antigenerkennung verantwortlich ist und bestimmte Strukturen innerhalb des scFv unbeabsichtigt die CAR-Signalgebung aktivieren und so die T-Zell-Funktion beeinträchtigen können. Die Interaktionen innerhalb der CDR-Schleife können die Stabilität von CAR zusätzlich beeinträchtigen. Kleine Unterschiede in der CDR-Schleife können die Effektivität von CAR-T-Zellen stark verändern, und es wurde eine neue Schnellscreening-Methode für das CAR-Verhalten vorgeschlagen.

Detaillierte Inhaltseinführung

Einführung in CAR-T

Der Schlüssel zur CAR-T-Zelltherapie (Chimäre Antigenrezeptor-T-Zelltherapie) liegt darin, die Immunantwort der T-Zellen zu koordinieren, T-Zellen zu modifizieren, CAR-Gene einzufügen und diese als chimäre Antigenrezeptor-CAR-Proteine ​​auf der Oberfläche der T-Zellen zu exprimieren. CAR kann Antigene auf der Oberfläche von Krebszellen direkt erkennen und so eine spezifische therapeutische Methode zur Identifizierung und Abtötung von Krebszellen im Körper des Patienten ermöglichen. Seit 2017 hat die FDA sechs CAR-T-Zelltherapien zur Behandlung von Blutkrebsarten wie Lymphomen zugelassen. Die Behandlung solider Tumoren ist jedoch nach wie vor schwierig, da umgebende Mediatoren die CARs daran hindern können, Antigene auf der Tumoroberfläche zu erkennen. Zudem weisen solide Tumoren eine Heterogenität auf, die es aufgrund der Unterschiede innerhalb des gleichen Krebstyps im Körper erschwert, therapeutische Effekte zu erzielen.
CAR-T
Abb. 1: Von der FDA zugelassene CAR-T-Therapien. Abbildungsquelle:CAR-T-Zelle.

Einführung inscFv-Antikörper

scFv ist ein kleines Antikörperfragment mit einer Größe von etwa 25 kDa, das aus einer schweren Kette (VH) und einer leichten Kette (VL) besteht, die durch ein kurzes, flexibles Peptid verbunden sind. Es ist der am häufigsten verwendete Typ rekombinanter Antikörper. scFv ist klein, spezifisch, kann in großem Maßstab in einem prokaryotischen Expressionssystem produziert werden und verfügt über eine intakte Antigen-Bindungsstelle. Daher wird es häufig bei der Diagnose und Behandlung von Krankheiten eingesetzt.
scFv-Antikörper-Alpha Lifetech
Abb. 2: scFv-Antikörper

Einführung in CDR

Komplementaritätsbestimmende Regionen (CDRs) sind Peptidfragmente der variablen Regionen von Antikörpern, die über CDRs, auch Antigenbindungsstellen genannt, an Antigene binden können. Ein Antikörpermolekül enthält zwei Antigenrezeptoren, und ein Antigenrezeptor enthält sechs CDRs. CDRs spiegeln die Bindungsaktivität von Antigenen an Antikörper wider.

Die Technologie dahinter

Insekten-Expressionssystem

Das Baculovirus-Insektenzell-Expressionssystem hat sich zu einem der am häufigsten eingesetzten Systeme für die routinemäßige Produktion rekombinanter Proteine ​​entwickelt. Das Baculovirus-Insektenzellsystem exprimierte erfolgreich G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (GPCRs), produzierte VLPs und produzierte Vektoren des infektiösen gonadales-assoziierten Virus (AAV) Typ 2. Ein prominentes Anwendungsbeispiel dieser Technologie ist die Entwicklung von Impfstoffen auf Basis von HPV-VLPs. Klinische Studien haben gezeigt, dass VLPs, die aus HPV 16/18 L1-Strukturproteinen bestehen und in mit stäbchenförmigen Viren infizierten Insektenzellen produziert werden, zervikale Infektionen mit HPV-16 und HPV-18 sowie damit verbundene Zellanomalien und -läsionen wirksam verhindern können.
Insekten-Expressionssystem
Abb. 3: Produktionsprozess. Abbildungsquelle:Baculoviren als vielseitige Vektoren für die Proteinexpression in Insekten- und Säugetierzellen.

Phagendisplay-Technologie

Die Phagendisplay-Technologie entstand 1985, als George Smith berichtete, dass Fremdpeptide auf der Oberfläche filamentöser Bakteriophagen präsentiert werden können. Durch das Einfügen fremder DNA in das Genom von Phagen werden Fusionsproteine ​​auf der Oberfläche der Phagen präsentiert. Diese Methode hat sich zu einer effektiven Methode für die Produktion großer Mengen von Peptiden, Proteinen und Antikörpern entwickelt und ermöglicht den Aufbau von Bibliotheken mit bis zu 10^10 verschiedenen Varianten. Sie kann für das Affinitätsscreening von Peptidbibliotheken zur Untersuchung von Protein-Liganden-Interaktionen, Antigen- und Antikörperbindungsstellen sowie zur Produktion von scFv-Antikörpern, Fab-Antikörpern und Nanobodys eingesetzt werden.
Phagendisplay-Technologie – Alpha Lifetech
Abb. 4: Phagendisplay-Technologie

Bibliothek synthetisierter menschlicher scFv-Antikörper

Synthetische Antikörperbibliotheken, auch bekannt als De-novo-Bibliotheken, sind synthetische Verfahren, die Techniken wie DNA-Synthese oder Phagendisplay nutzen, um komplette variable Antikörperregionen, einschließlich Framework-Regionen und CDRs, zu entwerfen und zu synthetisieren, ohne auf natürliche Antikörperbibliotheken zurückzugreifen. Synthetische DNA, die Antikörpersequenzen, einschließlich Framework-Regionen und CDRs, kodiert, wird durch chemische oder enzymatische Methoden synthetisiert. Die synthetisierten DNA-Fragmente werden mittels Techniken wie PCR zu Antikörperexpressionsvektoren zusammengesetzt und anschließend zur Antikörperproduktion in Expressionssysteme wie Bakterien, Hefen oder Säugetierzellen eingebracht. Hochdurchsatz-Screening-Verfahren, wie Phagendisplay, Hefedisplay oder Ribosomendisplay, können zum Screening von Antikörpern mit gewünschten Merkmalen in Antikörperbibliotheken eingesetzt werden. Synthetische Antikörperbibliotheken bieten folgende Vorteile: (1) Die Bibliothek weist eine höhere Zufälligkeit und eine größere Kapazität auf; (2) Einige schwierige Antikörper können ohne Immunisierung von Tieren gescreent werden; (3) Im Vergleich zu naiven Antikörperbibliotheken ist das Design synthetischer Antikörperbibliotheken vielfältiger.

SPR-Affinitätsmessung

Oberflächenplasmonenresonanz (SPR) kann zur Analyse der Bindungsaffinität und kinetischen Parameter zwischen Liganden und Analyten eingesetzt werden. Die SPR-Messung basiert auf Änderungen des Brechungsindex in der Nähe der Sensoroberfläche, wo der Analyt kontinuierlich fließt und entlang der Sensoroberfläche gemessen wird. SPR wird verwendet, um die relative Affinität von Protein-Protein-Interaktionen zu bestimmen, beispielsweise die Affinität von Antikörpern zu Zielantigenen. SPR kann zur Erkennung molekularer Adsorption, für SPR-Immunoassays, zur Materialcharakterisierung, Datenanalyse und für Biosensoren eingesetzt werden.
SPR
Abb. 5: Oberflächenplasmonenresonanz (SPR). Abbildungsquelle:Sabban, Sari (2011) Entwicklung eines In-vitro-Modellsystems zur Untersuchung der Interaktion von Equus caballus IgE mit seinem hochaffinen FcεRI-Rezeptor (Doktorarbeit), The University of Sheffield, CC BY-SA 3.0

Konstruktion und Produktion von Lentiviren

Lentivirale Vektoren zeichnen sich durch hohe Verpackungskapazität, breites Anwendungsspektrum, einzigartige Vielseitigkeit und Stabilität aus und eignen sich daher ideal als Gentransportsystem. Lentiviren sind Viren, die Krankheiten wie AIDS auslösen können. Die Infektion erfolgt durch Einfügen von DNA in das Genom der Wirtszelle. Lentivirale Vektoren sind Retroviren mit einzelsträngigem RNA-Genom und reverser Transkriptase, die Gene im Organismus einfügen und modifizieren können.
HIV
Abb. 6: Struktur von HIV, einem Lentivirus. Abbildungsquelle:Wikipedia

ReferenzREFERENZ

[1] Sarén, T., Saronio, G., Marti Torrell, P. et al. Eine Häufung komplementaritätsbestimmender Regionen kann zu einer Funktionsstörung der CAR-T-Zellen führen. Nat Commun 14, 4732 (2023). https://doi.org/10.1038/s41467-023-40303-z
[2] Kost, T., Condreay, J. & Jarvis, D. Baculoviren als vielseitige Vektoren für die Proteinexpression in Insekten- und Säugetierzellen. Nat Biotechnol 23, 567–575 (2005). https://doi.org/10.1038/nbt1095.
[3] Sparks RP, Jenkins JL, Fratti R. Verwendung der Oberflächenplasmonenresonanz (SPR) zur Bestimmung von Bindungsaffinitäten und kinetischen Parametern zwischen wichtigen Komponenten in Fusionsmaschinen. Methods Mol Biol. 2019;1860:199-210. doi: 10.1007/978-1-4939-8760-3_12. PMID: 30317506; PMCID: PMC8489108.
[4] https://en.wikipedia.org/wiki/Lentivirus.
[5] https://www.cancer.gov/about-cancer/treatment/research/car-t-cells.