Plataforma de desarrollo de aptámeros

Los aptámeros son oligonucleótidos monocatenarios (ADN, ARN o XNA) con alta afinidad y especificidad que se unen específicamente a moléculas objetivo como los anticuerpos, y se utilizan ampliamente para el desarrollo de biosensores, diagnósticos y terapias.

La plataforma de aptámeros proporcionada por Alpha Lifetech incluye dos categorías: plataforma de síntesis de aptámeros, que comprende principalmente el servicio de síntesis de bibliotecas de aptámeros SELEX y el servicio de desarrollo de aptámeros (ADN, ARN o XNA), y plataforma de cribado de aptámeros, que incluye servicios de cribado basados en la tecnología SELEX para proteínas, péptidos, células, moléculas pequeñas, iones metálicos y otras moléculas objetivo, así como servicios posteriores de optimización y análisis de identificación de aptámeros.

Plataforma de síntesis de aptámeros

Servicio de síntesis de bibliotecas de aptámeros SELEX

El servicio de síntesis de bibliotecas de aptámeros SELEX consiste principalmente en la construcción de una biblioteca que contiene un gran número de secuencias aleatorias de oligonucleótidos monocatenarios mediante síntesis química in vitro, de acuerdo con las moléculas objetivo. La construcción de la biblioteca es el punto de partida de la tecnología SELEX, que proporciona abundantes secuencias candidatas para el posterior proceso de cribado mediante la creación de enormes bibliotecas aleatorias y aumenta la posibilidad de seleccionar aptámeros de alta afinidad.

La síntesis de la biblioteca se divide principalmente en los siguientes pasos:

Pasos	Detalles de la tecnología
Identificar las moléculas objetivo	Identificar las moléculas objetivo que deben ser analizadas para la detección de aptámeros, que pueden ser proteínas, ácidos nucleicos, moléculas pequeñas, iones metálicos, etc.
Diseño de secuencia aleatoria	La longitud de la secuencia aleatoria, la composición de bases y otros parámetros se diseñaron de acuerdo con las características de las moléculas objetivo y los requisitos de cribado. Por lo general, las secuencias aleatorias tienen una longitud de entre decenas y cientos de bases.
Síntesis de secuencias fijas	Se diseñan y sintetizan fragmentos de oligonucleótidos con secuencias fijas (como secuencias de cebadores de PCR) en ambos extremos, que se utilizarán en el posterior proceso de amplificación y cribado.

La biblioteca sintetizada aún requiere un procesamiento adicional para el control de calidad. Se determinó la concentración de la biblioteca para asegurar su aplicabilidad en el proceso de cribado posterior. La diversidad y precisión de las secuencias aleatorias en la biblioteca se verificaron mediante secuenciación y otros métodos para garantizar que la calidad de la biblioteca cumpliera con los requisitos de cribado.

Mediante los pasos anteriores, se puede sintetizar una biblioteca de aptámeros SELEX de alta calidad y gran diversidad, que puede proporcionar abundantes secuencias candidatas para el proceso de selección posterior.

Servicios de desarrollo de aptámeros (ADN, ARN o XNA)

Los aptámeros suelen referirse a aptámeros de ácidos nucleicos. Estos incluyen aptámeros de ADN, ARN y XNA, que son aptámeros de ácidos nucleicos modificados químicamente. La técnica SELEX se utiliza ampliamente para el desarrollo de aptámeros. El flujo de trabajo básico para el desarrollo de aptámeros comprende la construcción de bibliotecas, la unión al objetivo, el aislamiento y la purificación, la amplificación, múltiples rondas de cribado y la identificación de secuencias. Durante muchos años, nos hemos especializado en la construcción de bibliotecas y contamos con una amplia experiencia en el desarrollo de aptámeros. Nos comprometemos a brindar a nuestros clientes un servicio de excelencia.

Proceso de tecnología SELEX

El proceso SELEX consta de varias rondas, cada una de las cuales consta de los siguientes pasos clave:

Enlace de biblioteca y destino

La biblioteca de ácidos nucleicos construida se mezcla con moléculas objetivo específicas (como proteínas, compuestos de moléculas pequeñas, etc.), de modo que las secuencias de ácidos nucleicos de la biblioteca tengan la oportunidad de unirse a las moléculas objetivo.

Aislamiento de moléculas no unidas

Las secuencias de ácidos nucleicos que no están unidas a la molécula objetivo se separan de la mezcla mediante métodos específicos como la cromatografía de afinidad, la separación con perlas magnéticas, etc.

Amplificación de moléculas de unión

La secuencia de ácido nucleico unida a una molécula diana se amplifica, generalmente mediante la tecnología de reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Para la fase de cribado posterior, las secuencias amplificadas se utilizarán como biblioteca inicial.

Figura 1: Proceso de cribado SELEX

Plataforma de cribado de aptámeros

Servicio de cribado de aptámeros

Alpha Lifetech ofrece una amplia gama de servicios especializados de cribado de aptámeros, aplicando diversas metodologías SELEX para diferentes tipos de moléculas:

Tipos de objetivos	Detalles técnicos
Cribado de aptámeros de proteínas mediante SELEX	El objetivo principal de la selección de aptámeros proteicos es identificar aquellos que puedan unirse específicamente a las moléculas de proteína objetivo. Estos aptámeros son más fáciles de sintetizar, más estables y menos susceptibles a factores ambientales.
Cribado de aptámeros peptídicos mediante SELEX	Los aptámeros peptídicos son una clase de secuencias peptídicas cortas con alta especificidad y afinidad, capaces de unirse específicamente a sustancias diana y que presentan un amplio potencial de aplicación en el campo biomédico. Mediante un proceso de selección específico, se identifican los aptámeros peptídicos que pueden unirse específicamente a moléculas diana a partir de una gran cantidad de bibliotecas de secuencias peptídicas aleatorias.
Cribado de aptámeros específicos para células (Cell-SELEX)	Las células diana o moléculas específicas de la superficie celular se preparan como objetivos. Los objetivos pueden ser células enteras, receptores de la membrana celular, proteínas u otras moléculas pequeñas.
Cribado de aptámeros de moléculas pequeñas mediante Capture SELEX	Capture SELEX es una técnica de cribado in vitro para la selección de aptámeros de moléculas pequeñas, y es una variante de SELEX. Capture SELEX resulta especialmente adecuada para el cribado de aptámeros dirigidos a moléculas pequeñas, que suelen tener menos grupos funcionales y son difíciles de inmovilizar directamente en soportes de fase sólida.
Servicios SELEX basados en animales vivos	El cribado con animales vivos es una técnica experimental ampliamente utilizada en los campos de la biociencia, la medicina y la biotecnología. Esta técnica emplea animales vivos como modelos experimentales para analizar y evaluar moléculas, medicamentos, terapias o procesos biológicos específicos. El objetivo es simular el entorno fisiológico del cuerpo humano para predecir y evaluar con mayor precisión la eficacia y la seguridad de los resultados experimentales en el organismo.

Servicio de optimización de aptámeros

La hidrofilicidad, la elevada pérdida de afinidad durante la producción y la rápida excreción de los aptámeros limitan su aplicación. Actualmente, se han explorado diversos métodos de optimización para mejorar su rendimiento.

También disponemos de diversas formas de optimizar el aptámero, que consisten en truncamiento, modificaciones y conjugación con el grupo apropiado (tiol, carboxilo, amina, fluoróforo, etc.).

Servicio de análisis de caracterización de aptámeros

El servicio de análisis de caracterización de aptámeros se refiere al servicio profesional de evaluación del rendimiento, resolución de la estructura y verificación funcional del aptámero obtenido para asegurar que cumpla con los requisitos de capacidad de unión específica, estabilidad y especificidad. Incluye principalmente análisis de afinidad y especificidad, evaluación de la estabilidad y verificación de la función biológica.