پلتفرم توسعه آپتامر

آپتامرها الیگونوکلئوتیدهای تک رشته‌ای (DNA، RNA یا XNA) با خاصیت اتصال و اختصاصیت بالا هستند که به طور خاص به مولکول‌های هدف مانند آنتی‌بادی‌ها متصل می‌شوند و به طور گسترده برای توسعه حسگرهای زیستی، تشخیص و درمان استفاده می‌شوند.

پلتفرم آپتامر ارائه شده توسط آلفا لایف‌تک شامل دو دسته است: پلتفرم سنتز آپتامر، که عمدتاً شامل سرویس سنتز کتابخانه آپتامر SELEX و سرویس توسعه آپتامر (DNA، RNA یا XNA) است، و پلتفرم غربالگری آپتامر شامل خدمات غربالگری مبتنی بر فناوری SELEX برای پروتئین‌ها، پپتیدها، سلول‌ها، مولکول‌های کوچک، یون‌های فلزی و سایر مولکول‌های هدف، و همچنین خدمات بهینه‌سازی و تجزیه و تحلیل شناسایی آپتامر در پایین‌دست.

پلتفرم سنتز آپتامر

سرویس سنتز کتابخانه آپتامر SELEX

سرویس سنتز کتابخانه آپتامر SELEX عمدتاً شامل ساخت کتابخانه‌ای حاوی تعداد زیادی توالی الیگونوکلئوتیدی تک رشته‌ای تصادفی با سنتز شیمیایی آزمایشگاهی بر اساس مولکول‌های هدف است. ساخت کتابخانه نقطه شروع فناوری SELEX است که با ساخت کتابخانه‌های تصادفی عظیم، توالی‌های کاندید فراوانی را برای فرآیند غربالگری بعدی فراهم می‌کند و امکان غربالگری آپتامرهای با میل ترکیبی بالا را افزایش می‌دهد.

سنتز کتابخانه عمدتاً به مراحل زیر تقسیم می‌شود:

مراحل	جزئیات فناوری
شناسایی مولکول‌های هدف	مولکول‌های هدفی که باید برای آپتامرها غربالگری شوند را شناسایی کنید، که می‌توانند پروتئین‌ها، اسیدهای نوکلئیک، مولکول‌های کوچک، یون‌های فلزی و غیره باشند.
طراحی توالی تصادفی	طول توالی تصادفی، ترکیب بازها و سایر پارامترها بر اساس ویژگی‌های مولکول‌های هدف و الزامات غربالگری طراحی شدند. معمولاً توالی‌های تصادفی بین ده‌ها تا صدها باز طول دارند.
سنتز توالی‌های ثابت	قطعات الیگونوکلئوتیدی با توالی‌های ثابت (مانند توالی‌های پرایمر PCR) در دو انتها طراحی و سنتز می‌شوند که در فرآیند تکثیر و غربالگری بعدی مورد استفاده قرار خواهند گرفت.

کتابخانه سنتز شده هنوز برای کنترل کیفیت نیاز به پردازش بیشتر دارد. غلظت کتابخانه برای اطمینان از کاربرد آن در فرآیند غربالگری بعدی تعیین شد. تنوع و دقت توالی‌های تصادفی در کتابخانه با تعیین توالی و سایر روش‌ها تأیید شد تا اطمینان حاصل شود که کیفیت کتابخانه الزامات غربالگری را برآورده می‌کند.

از طریق مراحل فوق، می‌توان یک کتابخانه آپتامر SELEX با کیفیت بالا و تنوع بالا سنتز کرد که می‌تواند توالی‌های کاندید فراوانی را برای فرآیند غربالگری بعدی فراهم کند.

خدمات توسعه آپتامر (DNA، RNA یا XNA)

آپتامرها معمولاً به آپتامرهای اسید نوکلئیک اشاره دارند. آپتامرهای اسید نوکلئیک شامل آپتامرهای DNA، آپتامرهای RNA و آپتامرهای XNA که آپتامرهای اسید نوکلئیک اصلاح‌شده شیمیایی هستند، می‌شوند. تکنیک SELEX به طور گسترده برای توسعه آپتامرها استفاده می‌شود. گردش کار اساسی خدمات توسعه آپتامرها شامل ساخت کتابخانه، اتصال به هدف، جداسازی و خالص‌سازی، تکثیر، چندین دور غربالگری و شناسایی توالی است. سال‌هاست که ما بر ساخت کتابخانه و تجربه غنی در توسعه آپتامر تمرکز کرده‌ایم. ما متعهد به ارائه خدمات بهتر به مشتریان هستیم.

فرآیند فناوری SELEX

فرآیند SELEX شامل چندین دور است که هر کدام از مراحل کلیدی زیر تشکیل شده‌اند:

اتصال کتابخانه و هدف

کتابخانه اسید نوکلئیک ساخته شده با مولکول‌های هدف خاص (مانند پروتئین‌ها، ترکیبات مولکول‌های کوچک و غیره) مخلوط می‌شود، به طوری که توالی‌های اسید نوکلئیک موجود در کتابخانه فرصت اتصال به مولکول‌های هدف را داشته باشند.

جداسازی مولکول‌های آزاد

توالی‌های اسید نوکلئیکی که به مولکول هدف متصل نیستند، با روش‌های خاصی مانند کروماتوگرافی میل ترکیبی، جداسازی مهره مغناطیسی و غیره از مخلوط جدا می‌شوند.

تکثیر مولکول‌های اتصال‌دهنده

توالی اسید نوکلئیک متصل به یک مولکول هدف، معمولاً با استفاده از فناوری واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) تکثیر می‌شود. برای مرحله غربالگری بعدی، توالی‌های تکثیر شده به عنوان کتابخانه شروع استفاده می‌شوند.

شکل ۱: فرآیند غربالگری SELEX

پلتفرم غربالگری آپتامر

خدمات غربالگری آپتامر

آلفا لایف‌تک طیف متنوعی از خدمات تخصصی غربالگری آپتامر را با استفاده از روش‌های مختلف SELEX برای انواع مختلف مولکول‌های شما ارائه می‌دهد:

انواع هدف	جزئیات فنی
غربالگری آپتامر پروتئین با استفاده از SELEX	هدف اصلی غربالگری آپتامرهای پروتئینی، غربالگری آپتامرهایی است که می‌توانند به طور اختصاصی به مولکول‌های پروتئینی هدف متصل شوند. این آپتامرها سنتز ساده‌تری دارند، پایدارتر هستند و کمتر تحت تأثیر عوامل محیطی قرار می‌گیرند.
غربالگری آپتامر پپتیدی با استفاده از SELEX	آپتامرهای پپتیدی دسته‌ای از توالی‌های پپتیدی کوتاه با اختصاصیت و میل ترکیبی بالا هستند که می‌توانند به طور اختصاصی به مواد هدف متصل شوند و طیف وسیعی از پتانسیل کاربرد را در حوزه زیست‌پزشکی نشان می‌دهند. از طریق یک فرآیند غربالگری خاص، آپتامرهای پپتیدی که می‌توانند به طور اختصاصی به مولکول‌های هدف متصل شوند، از تعداد زیادی کتابخانه تصادفی توالی پپتیدی غربالگری می‌شوند.
غربالگری آپتامر اختصاصی سلول (Cell-SELEX)	سلول‌های هدف یا مولکول‌های خاصی روی سطح سلول به عنوان هدف آماده می‌شوند. اهداف می‌توانند سلول‌های کامل، گیرنده‌های روی غشای سلولی، پروتئین‌ها یا سایر مولکول‌های کوچک باشند.
غربالگری آپتامر مولکول کوچک با استفاده از Capture SELEX	تکنیک Capture SELEX یک تکنیک غربالگری آزمایشگاهی (in vitro) برای غربالگری آپتامرهای مولکول‌های کوچک است که نوعی از SELEX محسوب می‌شود. Capture SELEX به ویژه برای غربالگری آپتامر مولکول‌های کوچک هدف که معمولاً گروه‌های عاملی کمتری دارند و تثبیت مستقیم آنها روی پایه‌های فاز جامد دشوار است، بسیار مناسب است.
خدمات SELEX مبتنی بر حیوانات زنده	خدمات غربالگری مبتنی بر حیوانات زنده، یک تکنیک تجربی است که به طور گسترده در زمینه‌های علوم زیستی، پزشکی و بیوتکنولوژی مورد استفاده قرار می‌گیرد و از حیوانات زنده به عنوان مدل‌های تجربی برای غربالگری و ارزیابی مولکول‌های خاص، داروها، درمان‌ها یا فرآیندهای بیولوژیکی استفاده می‌کند. این خدمات به گونه‌ای طراحی شده‌اند که محیط فیزیولوژیکی بدن انسان را شبیه‌سازی کنند تا اثربخشی و ایمنی نتایج تجربی در بدن انسان را با دقت بیشتری پیش‌بینی و ارزیابی کنند.

سرویس بهینه‌سازی آپتامر

آب‌دوستی، از دست دادن میل ترکیبی بالا در طول تولید و دفع سریع آپتامرها، کاربرد آنها را محدود می‌کند. در حال حاضر، روش‌های بهینه‌سازی متنوعی برای افزایش عملکرد آپتامرها بررسی شده است.

ما همچنین روش‌های متنوعی برای بهینه‌سازی آپتامر داریم که شامل برش، اصلاحات، اتصال به گروه مناسب (تیول، کربوکسی، آمین، فلوروفور و غیره) می‌شود.

خدمات آنالیز مشخصه‌یابی آپتامر

خدمات آنالیز مشخصه‌یابی آپتامر به خدمات حرفه‌ای ارزیابی عملکرد، تفکیک ساختار و تأیید عملکرد آپتامر به‌دست‌آمده اشاره دارد تا اطمینان حاصل شود که آپتامر الزامات توانایی اتصال ویژه، پایداری و اختصاصیت را برآورده می‌کند. این خدمات عمدتاً شامل آنالیز میل ترکیبی و اختصاصیت، ارزیابی پایداری و تأیید عملکرد بیولوژیکی است.