پلاسمیدها را آماده کرده و سلول‌های مخمر را کشت دهید، DNA کدکننده پروتئین هدف را سنتز کنید و آن را در یک وکتور بیان مخمر حاوی پروموترهای القایی، پپتیدهای سیگنال و ژن‌های هدف متصل به پروتئین‌های نمایش سطحی (مانند Aga2p) کلون کنید. ژن کدکننده پروتئین هدف را می‌توان با ژن کدکننده پروتئین دیواره سلولی مخمر (معمولاً Aga2p) ترکیب کرد و ژن ترکیب‌شده را می‌توان از طریق الکتروپوریشن به سلول‌های مخمر تبدیل کرد. پس از ترانسفورماسیون، سلول‌های مخمر که ژن‌های آنتی‌بادی را روی سطح خود بیان می‌کنند، می‌توانند تحت آزمایش‌های غربالگری اختصاصی آنتی‌ژن قرار گیرند: کتابخانه مخمر با آنتی‌ژن هدف انکوبه می‌شود و سلول‌های مخمری که به‌طور خاص به آن متصل می‌شوند، انتخاب می‌شوند. با استفاده از مرتب‌سازی سلولی فعال‌شده با فلورسانس (FACS) برای جداسازی سلول‌های مخمر که پروتئین‌هایی با ویژگی‌های مورد نظر را نشان می‌دهند، غربالگری کتابخانه نمایش مخمر را می‌توان با حداکثر اندازه کتابخانه حدود 10 ^ 8-10 ^ 9 سلول مخمر انجام داد. سپس کلون‌های مثبت را می‌توان برای تجزیه و تحلیل بیشتر یا کاربردهای پایین‌دستی جدا کرد. پس از شناسایی کلون‌های آنتی‌بادی اختصاصی از کتابخانه آنتی‌بادی، می‌توان آنها را بیشتر توصیف و به صورت انبوه تولید کرد و با استفاده از تکنیک‌هایی مانند کروماتوگرافی میل ترکیبی پروتئین A/G، کل فرآیند غربالگری نمایش مخمر و تولید آنتی‌بادی را تکمیل کرد.

شکل 2 فرآیند غربالگری کتابخانه نمایش مخمر

در مقالات مربوط به پلتفرم نمایش سطح مخمر برای کشف سریع نانوبادی‌های با ساختار انتخابی، نویسندگان یک پلتفرم کامل کشف نانوبادی در شرایط آزمایشگاهی (in vitro) بر اساس نمایش سطح مخمر ایجاد کردند. ابتدا، یک کتابخانه نانوبادی مصنوعی با شروع از ژن‌های شتر طراحی شد. شکل D نشان می‌دهد که نانوبادی دارای یک برچسب HA در انتهای کربوکسیل است و سپس نانوبادی به صورت کووالانسی روی دیواره سلولی مخمر تثبیت می‌شود. شکل E فرآیند غربالگری نانوبادی را نشان می‌دهد. نانوبادی‌های مخمر با میل ترکیبی آنتی‌ژن، توسط FACS جداسازی، تکثیر و بارها برای آنتی‌بادی‌ها انتخاب شدند. نویسندگان نانوبادی‌های انتخابی ساختار یافته‌ای را کشف کردند که از طریق این پلتفرم، دو GPCR مختلف انسانی را هدف قرار می‌دهند.