Plateforme de développement d'aptamères

Les aptamères sont des oligonucléotides monocaténaires (ADN, ARN ou XNA) dotés de la propriété d'une affinité et d'une spécificité élevées qui se lient spécifiquement aux molécules cibles comme les anticorps, et ils sont largement utilisés pour le développement de biocapteurs, de diagnostic et de thérapie.

La plateforme d'aptamères fournie par Alpha Lifetech comprend deux catégories : la plateforme de synthèse d'aptamères, qui implique principalement le service de synthèse de bibliothèque d'aptamères SELEX et le service de développement d'aptamères (ADN, ARN ou XNA), et la plateforme de criblage d'aptamères comprenant des services de criblage basés sur la technologie SELEX pour les protéines, les peptides, les cellules, les petites molécules, les ions métalliques et d'autres molécules cibles, ainsi que des services d'optimisation et d'analyse d'identification d'aptamères en aval.

Plateforme de synthèse d'aptamères

Service de synthèse de bibliothèque d'aptamères SELEX

Le service de synthèse de bibliothèques d'aptamères SELEX consiste principalement à construire une bibliothèque contenant un grand nombre de séquences oligonucléotidiques simple brin aléatoires par synthèse chimique in vitro, en fonction des molécules cibles. La construction de bibliothèques est le point de départ de la technologie SELEX, qui fournit de nombreuses séquences candidates pour le processus de criblage ultérieur grâce à la construction de vastes bibliothèques aléatoires et augmente les possibilités de criblage d'aptamères de haute affinité.

La synthèse de la bibliothèque est principalement divisée en les étapes suivantes :

Mesures	Détails de la technologie
Identifier les molécules cibles	Identifier les molécules cibles qui doivent être criblées pour les aptamères, qui peuvent être des protéines, des acides nucléiques, de petites molécules, des ions métalliques, etc.
Conception de séquences aléatoires	La longueur des séquences aléatoires, la composition en bases et d'autres paramètres ont été définis en fonction des caractéristiques des molécules cibles et des exigences de criblage. Généralement, les séquences aléatoires mesurent entre quelques dizaines et quelques centaines de bases.
Synthèse de séquences fixes	Des fragments d'oligonucléotides avec des séquences fixes (telles que des séquences d'amorces PCR) aux deux extrémités sont conçus et synthétisés, qui seront utilisés dans le processus d'amplification et de criblage ultérieur.

La banque synthétisée doit encore subir un traitement complémentaire pour le contrôle qualité. La concentration de la banque a été déterminée afin de garantir son applicabilité lors du processus de criblage ultérieur. La diversité et la précision des séquences aléatoires de la banque ont été vérifiées par séquençage et par d'autres méthodes afin de garantir que la qualité de la banque répondait aux exigences de criblage.

Grâce aux étapes ci-dessus, une bibliothèque d’aptamères SELEX de haute qualité et très diversifiée peut être synthétisée, ce qui peut fournir des séquences candidates abondantes pour le processus de criblage ultérieur.

Services de développement d'aptamères (ADN, ARN ou XNA)

Les aptamères désignent généralement les aptamères d'acide nucléique. Ces aptamères comprennent les aptamères d'ADN, les aptamères d'ARN et les aptamères XNA, qui sont des aptamères d'acide nucléique chimiquement modifiés. La technique SELEX est largement utilisée pour le développement d'aptamères. Le processus de développement d'aptamères comprend la construction de bibliothèques, la liaison à la cible, l'isolement et la purification, l'amplification, plusieurs cycles de criblage et l'identification de séquences. Depuis de nombreuses années, nous nous concentrons sur la construction de bibliothèques et bénéficions d'une riche expérience dans le développement d'aptamères. Nous nous engageons à offrir à nos clients des services de meilleure qualité.

Procédé technologique SELEX

Le processus SELEX se compose de plusieurs cycles, chacun comprenant les étapes clés suivantes :

Bibliothèque et liaison cible

La bibliothèque d'acides nucléiques construite est mélangée à des molécules cibles spécifiques (telles que des protéines, des composés à petites molécules, etc.), de sorte que les séquences d'acides nucléiques de la bibliothèque ont la possibilité de se lier aux molécules cibles.

Isolement de molécules non liées

Les séquences d'acide nucléique qui ne sont pas liées à la molécule cible sont séparées du mélange par des méthodes spécifiques telles que la chromatographie d'affinité, la séparation par billes magnétiques, etc.

Amplification des molécules de liaison

La séquence d'acide nucléique liée à une molécule cible est amplifiée, généralement par réaction en chaîne par polymérase (PCR). Pour la phase de criblage suivante, les séquences amplifiées serviront de banque de départ.

Fig 1 : Processus de sélection SELEX

Plateforme de criblage d'aptamères

Service de dépistage des aptamères

Alpha Lifetech propose une gamme diversifiée de services spécialisés de criblage d'aptamères appliquant diverses méthodologies SELEX pour différents types de vos molécules :

Types de cibles	Détails techniques
Criblage d'aptamères protéiques par SELEX	L'objectif principal du criblage d'aptamères protéiques est de sélectionner des aptamères capables de se lier spécifiquement à des molécules protéiques cibles. Ces aptamères sont plus simples à synthétiser, plus stables et moins sensibles aux facteurs environnementaux.
Criblage d'aptamères peptidiques par SELEX	Les aptamères peptidiques sont une classe de courtes séquences peptidiques présentant une spécificité et une affinité élevées, capables de se lier spécifiquement à des substances cibles et présentant un large potentiel d'application dans le domaine biomédical. Grâce à un processus de criblage spécifique, les aptamères peptidiques capables de se lier spécifiquement à des molécules cibles sont sélectionnés à partir d'un grand nombre de bibliothèques de séquences peptidiques aléatoires.
Criblage d'aptamères spécifiques aux cellules (Cell-SELEX)	Des cellules cibles ou des molécules spécifiques à la surface cellulaire sont préparées comme cibles. Ces cibles peuvent être des cellules entières, des récepteurs sur la membrane cellulaire, des protéines ou d'autres petites molécules.
Criblage d'aptamères de petites molécules par Capture SELEX	Capture SELEX est une technique de criblage in vitro pour le criblage d'aptamères de petites molécules, variante de SELEX. Capture SELEX est particulièrement adapté au criblage d'aptamères de petites molécules cibles, qui présentent généralement moins de groupes fonctionnels et sont difficiles à immobiliser directement sur des supports en phase solide.
Services SELEX basés sur des animaux vivants	Le dépistage sur animaux vivants est une technique expérimentale largement utilisée en biosciences, en médecine et en biotechnologie. Elle utilise des animaux vivants comme modèles expérimentaux pour dépister et évaluer des molécules, des médicaments, des produits thérapeutiques ou des processus biologiques spécifiques. Ces services sont conçus pour simuler l'environnement physiologique du corps humain afin de prédire et d'évaluer avec plus de précision l'efficacité et la sécurité des résultats expérimentaux.

Service d'optimisation des aptamères

L'hydrophilie, la forte perte d'affinité lors de la production et l'excrétion rapide des aptamères limitent leur application. À l'heure actuelle, diverses méthodes d'optimisation ont été explorées pour améliorer les performances des aptamères.

Nous disposons également de diverses manières d'optimiser l'aptamère consistant en une troncature, des modifications, une conjugaison au groupe approprié (thiol, carboxy, amine, fluorophore, etc.).

Service d'analyse de caractérisation des aptamères

Le service d'analyse de caractérisation des aptamères consiste en une évaluation professionnelle des performances, de la résolution structurale et de la vérification fonctionnelle de l'aptamère obtenu, afin de garantir sa conformité aux exigences de capacité de liaison spécifique, de stabilité et de spécificité. Il comprend principalement l'analyse d'affinité et de spécificité, l'évaluation de la stabilité et la vérification de la fonction biologique.