अंतर-आणविक अंतःक्रियाओं, एफिनिटी ड्रग एसेज़ और ड्रग स्क्रीनिंग के मूल्यांकन में एफिनिटी महत्वपूर्ण है। अंतर-आणविक अंतःक्रियाओं को समीकरण L + R = LR द्वारा वर्णित किया जा सकता है, जहाँ L मुक्त लिगैंड्स को, R अबद्ध रिसेप्टर्स को और LR बद्ध लिगैंड-रिसेप्टर कॉम्प्लेक्स को दर्शाता है। बंधन अभिक्रियाएँ अंतर-आणविक अंतःक्रियाओं को परिभाषित करती हैं, जहाँ अभिक्रिया के दौरान बद्ध और अबद्ध अवस्थाओं के बीच गतिशील आदान-प्रदान होता है जब तक कि संतुलन प्राप्त नहीं हो जाता। इसे अभिक्रिया के दो दर स्थिरांक, Kon (बंधन दर स्थिरांक) और Koff (वियोजन दर स्थिरांक) द्वारा वर्णित किया जा सकता है। Kd मान, जो बंधन स्थिरांक (Ka) का व्युत्क्रम है, Koff/Kon है, जो अभिक्रिया एफिनिटी के लिए एक महत्वपूर्ण स्थिरांक है। इसलिए, दो अणुओं के बीच बंधन जितना मजबूत होगा, एफिनिटी उतनी ही अधिक होगी। Kd मान जितना कम होगा, एफिनिटी उतनी ही अधिक होगी। इस समीकरण को अर्ध-लघुगणकीय ग्राफ पर एक S-आकार के वक्र के रूप में दर्शाया जा सकता है, जिसमें x-अक्ष (लघुगणकीय पैमाने के अक्ष पर) पर लिगैंड सांद्रता और y-अक्ष पर आंशिक सीमा होती है। बिंदीदार रेखा 0.5 बंधन अंश के Kd (1 nM) पर लिगैंड सांद्रता को दर्शाती है।

चित्र 1: कोशिका सतह रिसेप्टर से बंधे लिगैंड की विभिन्न सांद्रताओं का सिग्मॉइडल बंधन वक्र। (संदर्भ स्रोत: हंटर एस.ए., कोचरन जे.आर. प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रियाओं की आत्मीयता निर्धारित करने के लिए कोशिका-बंधन परख: प्रौद्योगिकियाँ और विचार।)