Ապտամերի բնութագրման վերլուծության ծառայություն

Ապտամերի օպտիմալացված կապակցվածությունը ստուգվել է ապտամերի կապակցման վերլուծության համապատասխան տեխնիկաներով: Օրինակներ են իզոթերմ տիտրացիոն կալորիմետրիան (ITC), հոսքային ցիտոմետրիան (FCM) և մակերևութային պլազմոնային ռեզոնանսը (SPR), միկրոհոսքային անալիզը և այլն: Ապտամերի կապակցվածությունը սովորաբար արտահայտվում է դիսոցիացիայի հաստատունով (KD), որը ֆիզիկական մեծություն է, որն օգտագործվում է շրջելի ռեակցիայի մեջ մոլեկուլային դիսոցիացիայի աստիճանը քանակականացնելու համար: Որքան փոքր է KD արժեքը, այնքան կայուն է կոմպլեքսը, այսինքն՝ այնքան ուժեղ է կապակցվածությունը. հակառակը, որքան մեծ է KD արժեքը, այնքան անկայուն է կոմպլեքսը և այնքան թույլ է կապակցվածությունը: Այս քայլը ապտամերի կատարողականը որոշելու, ապտամերի կապակցվածության հասունացումը ապահովելու և գործնական կիրառություններում թիրախային մոլեկուլին բարձր կապակցվածությամբ և ընտրողականությամբ կապվելու բանալին է:

Նկ. 1. Ապտամերի աֆինիտետի հասունացման գործընթացը։ Հղման աղբյուր՝Քինգհորն ԱԲ, Ֆրեյզեր Լուիզիանա, 2017։

Բացի կապակցության ստուգումից, անհրաժեշտ է ստուգել ապտամերի գործառույթը։ Սա ներառում է ապտամերի կայունության, յուրահատկության և որոշակի միջավայրում այլ մոլեկուլների հետ փոխազդեցությունների ստուգումը։ Ֆունկցիոնալ ստուգման արդյունքները անմիջականորեն կազդեն ապտամերների արժեքի վրա գիտական ​​հետազոտություններում և արդյունաբերական կիրառություններում։

Հատուկ ստուգում

Համապատասխան մեթոդը սովորաբար ընտրվում է նուկլեինաթթվի ապտամերի կոնկրետ կիրառման նպատակին համապատասխան։

(1) Մոլեկուլային մակարդակի թեստավորում. Օգտագործելով մոլեկուլային կենսաբանության տեխնիկաներ, ինչպիսիք են գել էլեկտրոֆորեզը, Western blot-ը և այլն, ապտամերի և թիրախային մոլեկուլի միացումից հետո առաջացող կոմպլեքսները հայտնաբերելու կամ ապտամերի պատճառով թիրախային մոլեկուլի արտահայտման մակարդակի փոփոխությունները հայտնաբերելու համար։

(2) Բջջային մակարդակի թեստավորում. բջջային կուլտուրայի տեխնոլոգիայի միջոցով ապտամերները ինկուբացվում են թիրախային բջիջների հետ՝ դիտարկելու կենսաբանական փոփոխությունները, ինչպիսիք են բջջային ձևաբանությունը, բազմացումը և ապոպտոզը, և գնահատելու ապտամերների կենսաբանական ակտիվությունը։

(3) Կենդանիների մոդելի փորձարկում. Համապատասխան կենդանիների մոդելներում նուկլեինաթթվային ապտամերները տրվում են ներարկման կամ դեղորայքի միջոցով, և կենդանիների ֆիզիոլոգիական ցուցանիշները և պաթոլոգիական փոփոխությունները դիտարկվում են՝ in vivo ապտամերների կենսաբանական ակտիվությունն ու անվտանգությունը գնահատելու համար: