Platform Sintesis Aptamer
Tergantung pada targetnya, aptamer asam nukleat meliputi aptamer DNA, aptamer RNA, aptamer protein, dan aptamer membran sel.
HUBUNGI KAMI01
Platform Sintesis Aptamer
Pengantar tentang aptamer asam nukleat
Aptamer asam nukleat, juga dikenal sebagai aptamer, kompleks, dan antibodi kimia, diperoleh melalui penyaringan selex in vitro dengan teknik evolusi sistem pengayaan eksponensial ligan (SELEX). Ini adalah asam deoksiribonukleat (ssDNA) atau asam ribonukleat (RNA) beruntai tunggal yang mengikat secara spesifik dan efisien pada molekul target, dan biasanya terdiri dari 20-80 basa.
Aptamer asam nukleat yang diperoleh melalui skrining in vitro memiliki struktur yang stabil, mudah disintesis dan dimodifikasi, serta lebih unggul daripada antibodi yang berasal dari biologi yang umum digunakan dalam hal sintesis dan aplikasi; selain itu, aptamer asam nukleat dapat mengikat targetnya secara spesifik melalui berbagai gaya yang berbeda, secara umum, mereka berinteraksi dengan molekul kecil berdasarkan berbagai konformasi (misalnya, jepit rambut, cekung-cembung, pseudo-terpilin, dll.) melalui ikatan hidrogen, gaya elektrostatik, interaksi hidrofobik, dll. Tergantung pada targetnya, aptamer asam nukleat meliputi aptamer DNA, aptamer RNA, aptamer protein, dan aptamer membran sel.
Platform sintesis aptamer Alpha Lifetech, yang terutama meliputi layanan sintesis pustaka aptamer SELEX dan layanan pengembangan aptamer (DNA, RNA atau XNA), serta layanan penyaringan aptamer hilir, optimasi aptamer, dan analisis identifikasi aptamer.
Proses teknis sintesis Aptamer
Prinsip Dasar dan Proses Teknologi
Proses teknologi sintesis aptamer asam nukleat adalah dengan mensintesis secara kimiawi pustaka oligonukleotida untai tunggal secara in vitro, mencampurnya dengan zat target, dan membentuk kompleks antara zat target dan asam nukleat. Asam nukleat yang tidak berikatan dengan zat target akan tercuci, dan molekul asam nukleat yang berikatan dengan zat target akan diisolasi. Molekul asam nukleat ini kemudian digunakan sebagai templat untuk melakukan amplifikasi PCR pada tahap penyaringan selanjutnya. Melalui penyaringan dan amplifikasi SELEX berulang, beberapa molekul DNA atau RNA yang tidak berikatan dengan zat target atau memiliki afinitas rendah atau sedang terhadap zat target akan tercuci, dan aptamer, yaitu DNA atau RNA dengan afinitas tinggi terhadap zat target, akan dipisahkan dari pustaka acak yang sangat besar. Kemurniannya akan meningkat seiring dengan proses SELEX, dan pada akhirnya akan mendominasi sebagian besar pustaka tersebut.
Poin-Poin Penting Proses Teknis
Proses penyaringan SELEX aptamer asam nukleat dimulai dengan perakitan pustaka oligonukleotida acak yang disintesis secara kimia. Pustaka oligonukleotida acak memiliki kapasitas pustaka yang besar. Keragaman yang tinggi adalah keunggulan utamanya. Secara teoritis, jika urutan acak dalam suatu oligonukleotida terdiri dari n basa, kapasitas pustakanya adalah 4n. Jika kita mempertimbangkan pustaka modifikasi buatan, hal itu akan meningkatkan keragaman urutan acak. Saat ini, panjang urutan acak oligonukleotida yang umum digunakan dalam eksperimen SELEX umumnya adalah 30 basa, dan kapasitas pustakanya bisa mencapai 10^18. Kapasitas pustaka sangat penting untuk penyaringan SELEX ligan dengan afinitas tinggi. Namun, karena konsentrasi pustaka sintetik sudah pasti, urutan acak yang terlalu panjang akan mengurangi kelimpahan setiap oligonukleotida dalam pustaka, yang akan mengurangi probabilitas penyaringan SELEX untuk aptamer tertentu. Secara umum, kapasitas pustaka sebesar 10^13~10^15 pada putaran pertama penyaringan selex dapat memenuhi kebutuhan praktis.
Gambar 1 Proses Teknis SELEX
Keunggulan aptamer asam nukleat
| Keuntungan | Detail |
|---|---|
| Langsung | Menghindari proses tradisional eksperimen hewan dan memilih langsung dari pustaka in vitro; melakukan skrining selex untuk aptamer molekul target yang non-imunogenik, imunogenik rendah, atau bahkan toksik. |
| Beragam Aplikasi | Molekul target dapat berupa pewarna organik, asam amino, protein, antibiotik, peptida, vitamin, obat-obatan, bahkan sel, patogen, virus, jaringan, dan lain sebagainya. |
| Afinitas yang Kuat | Aptamer menunjukkan spesifisitas dan afinitas yang tinggi untuk penyaringan molekul target secara in vitro. |
| Stabilitas | Aptamer berukuran kecil, mudah diperoleh, sintesisnya dapat direproduksi, dan stabilitasnya dapat ditingkatkan melalui sintesis dan modifikasi kimia. Aptamer stabil secara kimia, memiliki umur simpan yang panjang, dan dapat diangkut pada suhu ruangan. |
01/
Kedokteran klinis: terapi tumor bertarget, teknik diagnostik kanker
Laporan kredit Gladtrust berhasil disusun berdasarkan basis data informasi kredit bisnis online terbesar - CreditVision.
Basis data ini mengumpulkan dan memperbarui informasi secara dinamis dari lebih dari 200.000 sumber data tepat waktu. Proses pembaruan dan pengelolaan informasi dapat menjamin keakuratan informasi.
Basis data ini mengumpulkan dan memperbarui informasi secara dinamis dari lebih dari 200.000 sumber data tepat waktu. Proses pembaruan dan pengelolaan informasi dapat menjamin keakuratan informasi.
02/
Bidang pengujian analitik: deteksi polutan organik, deteksi obat molekul kecil, deteksi patogen penyebab penyakit bawaan makanan.
Di bidang ini, teknologi sintesis aptamer asam nukleat akan digunakan bersamaan dengan imunokromatografi emas koloid, di mana emas koloid pertama-tama akan disiapkan dan diidentifikasi kualitasnya, kemudian dihubungkan dengan aptamer asam nukleat, dikarakterisasi dan disemprotkan pada bantalan pengikat, dan strip uji akan disiapkan menggunakan antibodi poliklonal yang akan dideteksi sebagai garis deteksi, dan sekuens komplementer aptamer asam nukleat sebagai garis kontrol kualitas, sehingga dapat menganalisis keberadaan zat target berdasarkan hasil percobaan negatif dan positif.
03/
Bidang biologi: pengembangan biosensor
Sensor aptamer asam nukleat menggunakan aptamer sebagai elemen pengenalan untuk mengenali zat target dan mengubah hasil pengenalan menjadi sinyal yang dapat diukur. Konversi sinyal dapat berupa elektrokimia, optik, suhu, piezoelektrik, magnetik, dan mikromekanik, atau kombinasi dari teknik-teknik tersebut. Dibandingkan dengan metode deteksi yang ada, sensor berbasis aptamer asam nukleat umumnya mudah dioperasikan, spesifik, responsif, dan sensitif, dan keunggulan ini membuatnya lebih mudah diterapkan pada sampel nyata dan memiliki prospek pengembangan yang baik.
Layanan Sintesis Aptamer SELEX
Layanan sintesis aptamer SELEX Alpha Lifetech mencakup pembuatan pustaka aptamer SELEX, optimasi SELEX, dan lain-lain. Alpha Lifetech bertujuan untuk mendapatkan aptamer SELEX dengan afinitas dan spesifisitas tinggi bagi pelanggan melalui proses skrining in vitro.
BACA SELENGKAPNYA
Layanan Pengembangan Aptamer Asam Nukleat
Layanan pengembangan aptamer asam nukleat dari Alpha Lifetech terutama didasarkan pada teknologi SELEX untuk penyaringan aptamer SELEX, termasuk pengembangan aptamer DNA, aptamer RNA, dan aptamer XNA, yang melibatkan desain pustaka, sintesis oligonukleotida, konstruksi pustaka, dan verifikasi.
BACA SELENGKAPNYAJika Anda memiliki pertanyaan, jangan ragu untuk menghubungi kami kapan saja.
Leave Your Message
16 Juli 2018 
0102