Aptamer þróunarvettvangur

Aptamerar eru einþátta oligonúkleótíð (DNA, RNA eða XNA) með mikla sækni og sértækni sem bindast sértækt marksameindum eins og mótefnum og þau eru mikið notuð til þróunar líffræðilegra skynjara, greiningar og meðferða.

Aptamer-pallurinn sem Alpha Lifetech býður upp á samanstendur af tveimur flokkum: aptamer-myndunarpalli, sem felur aðallega í sér SELEX aptamer-bókasafnsmyndunarþjónustu og þróunarþjónustu fyrir aptamer (DNA, RNA eða XNA), og aptamer-skimunarpallur sem inniheldur skimunarþjónustu byggða á SELEX tækni fyrir prótein, peptíð, frumur, smásameindir, málmjónir og aðrar marksameindir, sem og greiningarþjónustu fyrir aptamer-bestun og auðkenningu.

Aptamer myndunarpallur

SELEX aptamer bókasafnsmyndunarþjónusta

Þjónusta SELEX aptamer bókasafnsmyndunar felst aðallega í að smíða bókasafn sem inniheldur mikið magn af handahófskenndum einþátta oligonúkleótíðaröðum með efnasmíði in vitro samkvæmt marksameindunum. Smíði bókasafna er upphafspunktur SELEX tækninnar, sem veitir gnægð af mögulegum röðum fyrir síðari skimunarferli með því að smíða stór handahófskennd bókasöfn og eykur möguleikann á að skima aptamera með mikilli sækni.

Bókasafnsmyndun skiptist aðallega í eftirfarandi skref:

Skref	Tækniupplýsingar
Greinið marksameindir	Greinið marksameindirnar sem þarf að skima fyrir aptamerum, sem geta verið prótein, kjarnsýrur, smásameindir, málmjónir o.s.frv.
Handahófskennd röð hönnunar	Handahófskennd raðlengd, basasamsetning og aðrir þættir voru hannaðir í samræmi við eiginleika marksameindanna og skimunarkröfur. Venjulega eru handahófskenndar raðir á bilinu tugir til hundruða basa að lengd.
Samantekt á föstum raðgreiningum	Ólígónúkleótíðbrot með föstum röðum (eins og PCR-praimeraröðum) í báðum endum eru hönnuð og mynduð, sem verða notuð í síðari mögnunar- og skimunarferli.

Myndaða safnið þarfnast frekari gæðaeftirlits. Styrkur safnsins var ákvarðaður til að tryggja notagildi þess í síðari skimunarferlinu. Fjölbreytileiki og nákvæmni handahófskenndra raða í safninu var staðfest með raðgreiningu og öðrum aðferðum til að tryggja að gæði safnsins uppfylltu skimunarkröfur.

Með ofangreindum skrefum er hægt að mynda hágæða og mjög fjölbreytt SELEX aptamer bókasafn, sem getur veitt ríkulegt úrval af mögulegum röðum fyrir síðari skimunarferli.

Þróunarþjónusta fyrir aptamer (DNA, RNA eða XNA)

Aptamerar vísa venjulega til kjarnsýruaptamera. Kjarnsýruaptamerar eru meðal annars DNA-aptamerar, RNA-aptamerar og XNA-aptamerar, sem eru efnafræðilega breyttir kjarnsýruaptamerar. SELEX-tæknin er mikið notuð við þróun aptamera. Grunnvinnuflæðið í þróun aptamera felur í sér smíði bókasafna, bindingu við markhóp, einangrun og hreinsun, mögnun, margar umferðir skimunar og raðgreiningu. Í mörg ár höfum við einbeitt okkur að smíði bókasafna og höfum mikla reynslu í þróun aptamera. Við erum staðráðin í að veita viðskiptavinum okkar betri þjónustu.

SELEX tækniferli

SELEX ferlið samanstendur af mörgum lotum og hver þeirra inniheldur eftirfarandi lykilþrep:

Bókasafn og markmiðsbinding

Smíðaða kjarnsýrusafnið er blandað saman við ákveðnar marksameindir (eins og prótein, smásameindasambönd o.s.frv.) þannig að kjarnsýruröðin í safninu fái tækifæri til að bindast marksameindunum.

Einangrun óbundinna sameinda

Kjarnsýruraðir sem eru ekki bundnar við marksameindina eru aðskildar frá blöndunni með sérstökum aðferðum eins og sækniskiljun, segulkornaaðskilnaði o.s.frv.

Magnun bindandi sameinda

Kjarnsýruröðin sem er bundin við marksameindina er mögnuð, venjulega með pólýmerasakeðjuverkunartækni (PCR). Fyrir síðari skimunarfasa verða mögnuðu raðirnar notaðar sem upphafsbókasafn.

Mynd 1: SELEX skimunarferli

Aptamer skimunarpallur

Aptamer skimunarþjónusta

Alpha Lifetech býður upp á fjölbreytt úrval sérhæfðra aptamer skimunarþjónustu með því að nota ýmsar SELEX aðferðir fyrir mismunandi gerðir af sameindum þínum:

Tegundir skotmarka	Tæknilegar upplýsingar
Skimun á próteinaptamerum með SELEX	Megintilgangur skimunar á prótein-aptamerum er að skima aptamera sem geta tengst sértækt við markpróteinsameindir. Þessir aptamerar eru einfaldari í myndun, stöðugri og minna viðkvæmir fyrir umhverfisþáttum.
Skimun á peptíðaptamerum með SELEX	Peptíð-aptamerar eru flokkur stuttra peptíðraða með mikla sértækni og sækni, sem geta sértækt bundist markefnum og sýna fjölbreytt notkunarmöguleika á líftæknisviðinu. Með sérstöku skimunarferli eru peptíð-aptamerar sem geta sértækt bundist markefnum skimaðir úr fjölda handahófskenndra peptíðraðasafna.
Frumusértæk skimun á aptamerum (Cell-SELEX)	Markfrumur eða tilteknar sameindir á frumuyfirborði eru útbúnar sem skotmörk. Skotmörk geta verið heilar frumur, viðtakar á frumuhimnu, prótein eða aðrar litlar sameindir.
Skimun á smásameindaaptamerum með Capture SELEX	Capture SELEX er in vitro skimunartækni fyrir aptamera smásameinda, sem er afbrigði af SELEX. Capture SELEX hentar sérstaklega vel til aptamera skimunar á aptamera smásameinda, sem hafa yfirleitt færri virka hópa og erfitt er að festa beint á föstum fasa undirlagi.
SELEX þjónusta byggð á lifandi dýrum	Skimun á lifandi dýrum er tilraunatækni sem er mikið notuð á sviði lífvísinda, læknisfræði og líftækni, þar sem lifandi dýr eru notuð sem tilraunalíkön til að skima og meta tilteknar sameindir, lyf, meðferðir eða líffræðileg ferli. Þjónustan er hönnuð til að herma eftir lífeðlisfræðilegu umhverfi í mannslíkamanum til að spá fyrir um og meta nákvæmar virkni og öryggi tilraunaniðurstaðna í mannslíkamanum.

Aptamer hagræðingarþjónusta

Vatnssækni, mikið sæknitap við framleiðslu og hraður útskilnaður aptamera takmarkar notkun þeirra. Sem stendur hafa ýmsar bestunaraðferðir verið kannaðar til að auka afköst aptamera.

Við höfum einnig ýmsar leiðir til að hámarka aptamer, þar á meðal styttingu, breytingum, tengingu við viðeigandi hóp (þíól, karboxý, amín, flúorófor o.s.frv.).

Þjónusta við greiningu á aptamerum

Þjónusta við greiningu á aptamerum vísar til faglegrar þjónustu við mat á afköstum, upplausn, upplausn og virknisstaðfestingu á aptamerinu sem fæst til að tryggja að það uppfylli kröfur um sértæka bindingargetu, stöðugleika og sértækni. Þetta felur aðallega í sér greiningu á sækni og sértækni, stöðugleikamat og staðfestingu á líffræðilegri virkni.