פלטפורמת פיתוח Aptamer

אפטמרים הם אוליגונוקלאוטידים חד-גדיליים (DNA, RNA או XNA) בעלי זיקה גבוהה וספציפיות גבוהה, הנקשרים באופן ספציפי למולקולות מטרה כמו נוגדנים, והם נמצאים בשימוש נרחב לפיתוח ביוסנסורים, אבחון וטיפולים.

פלטפורמת האפטמרים שמספקת Alpha Lifetech כוללת שתי קטגוריות: פלטפורמת סינתזה של אפטמרים, הכוללת בעיקר שירות סינתזה של ספריית אפטמרים של SELEX ושירות פיתוח אפטמרים (DNA, RNA או XNA), ופלטפורמת סינון אפטמרים הכוללת שירותי סינון המבוססים על טכנולוגיית SELEX עבור חלבונים, פפטידים, תאים, מולקולות קטנות, יוני מתכת ומולקולות מטרה אחרות, כמו גם שירותי אופטימיזציה וניתוח זיהוי אפטמרים במורד הזרם.

פלטפורמת סינתזה של אפטמר

שירות סינתזה של ספריית אפטמר של SELEX

שירות סינתזת ספריות אפטמרים של SELEX כרוך בעיקר בבניית ספרייה המכילה מספר רב של רצפי אוליגונוקלאוטידים חד-גדיליים אקראיים באמצעות סינתזה כימית in vitro בהתאם למולקולות המטרה. בניית ספרייה היא נקודת המוצא של טכנולוגיית SELEX, המספקת שפע של רצפים מועמדים לתהליך הסינון שלאחר מכן על ידי בניית ספריות אקראיות ענקיות ומגדילה את האפשרות לסינון אפטמרים בעלי זיקה גבוהה.

סינתזת ספריות מחולקת בעיקר לשלבים הבאים:

צעדים	פרטי טכנולוגיה
זיהוי מולקולות מטרה	זהה את מולקולות המטרה שיש לבדוק לאפטמרים, שיכולים להיות חלבונים, חומצות גרעין, מולקולות קטנות, יוני מתכת וכו'.
עיצוב רצף אקראי	אורך הרצף האקראי, הרכב הבסיסים ופרמטרים אחרים תוכננו בהתאם למאפייני מולקולות המטרה ולדרישות הסינון. בדרך כלל, רצפים אקראיים הם באורך של בין עשרות למאות בסיסים.
סינתזה של רצפים קבועים	מתוכננים ומסונתזים מקטעי אוליגונוקלאוטידים עם רצפים קבועים (כגון רצפי פריימרים של PCR) בשני הקצוות, אשר ישמשו בתהליך ההגברה והסינון שלאחר מכן.

הספרייה המסונתזת עדיין זקוקה לעיבוד נוסף לצורך בקרת איכות. ריכוז הספרייה נקבע על מנת להבטיח את ישימותה בתהליך הסינון העוקב. הגיוון והדיוק של הרצפים האקראיים בספרייה אומתו באמצעות ריצוף ושיטות אחרות על מנת להבטיח שאיכות הספרייה עומדת בדרישות הסינון.

באמצעות השלבים הנ"ל, ניתן לסנתז ספריית אפטמרים של SELEX באיכות גבוהה ומגוונת ביותר, אשר יכולה לספק שפע של רצפי מועמדים לתהליך הסינון שלאחר מכן.

שירותי פיתוח אפטמרים (DNA, RNA או XNA)

אפטמרים מתייחסים בדרך כלל לאפטמרים של חומצות גרעין. אפטמרים של חומצות גרעין כוללים אפטמרים של DNA, אפטמרים של RNA ואפטמרים של XNA, שהם אפטמרים של חומצות גרעין שעברו שינוי כימי. טכניקת SELEX נמצאת בשימוש נרחב לפיתוח אפטמרים. תהליך העבודה הבסיסי של שירותי פיתוח אפטמרים כולל בניית ספרייה, קשירת מטרה, בידוד וטיהור, הגברה, סבבי סינון מרובים וזיהוי רצף. במשך שנים רבות, התמקדנו בבניית ספרייה ויש לנו ניסיון עשיר בפיתוח אפטמרים. אנו מחויבים לספק ללקוחות שירותים טובים יותר.

תהליך טכנולוגיית SELEX

תהליך SELEX מורכב ממספר סבבים, שכל אחד מהם מורכב מהשלבים המרכזיים הבאים:

קשירת ספרייה ויעד

ספריית חומצות הגרעין שנבנתה מעורבבת עם מולקולות מטרה ספציפיות (כגון חלבונים, תרכובות מולקולות קטנות וכו'), כך שלרצפי חומצות הגרעין בספרייה יש הזדמנות להיקשר למולקולות המטרה.

בידוד של מולקולות לא קשורות

רצפי חומצות גרעין שאינם קשורים למולקולת המטרה מופרדים מהתערובת בשיטות ספציפיות כגון כרומטוגרפיית זיקה, הפרדת חרוזים מגנטיים וכו'.

הגברה של מולקולות קישור

רצף חומצות הגרעין הקשור למולקולת מטרה מוגבר, בדרך כלל באמצעות טכנולוגיית תגובת שרשרת פולימראזית (PCR). בשלב הסינון שלאחר מכן, הרצפים המוגברים ישמשו כספריית ההתחלה.

איור 1: תהליך סינון SELEX

פלטפורמת סינון אפטמרים

שירות סינון אפטמרים

אלפא לייפטק מציעה מגוון רחב של שירותי סינון אפטמרים ייעודיים, תוך שימוש במתודולוגיות SELEX שונות עבור סוגים שונים של המולקולות שלכם:

סוגי יעד	פרטים טכניים
בדיקת אפטמרים של חלבונים על ידי SELEX	המטרה העיקרית של סינון אפטמרים של חלבונים היא סינון אפטמרים שיכולים להיקשר באופן ספציפי למולקולות חלבון מטרה. אפטמרים אלה פשוטים יותר לסינתזה, יציבים יותר ופחות רגישים לגורמים סביבתיים.
סינון אפטמרים של פפטידים על ידי SELEX	אפטמרים פפטידיים הם סוג של רצפי פפטיד קצרים בעלי ספציפיות וזיקה גבוהים, שיכולים להיקשר באופן ספציפי לחומרי מטרה ולהראות פוטנציאל יישומים רחב בתחום הביו-רפואי. באמצעות תהליך סינון ספציפי, אפטמרים פפטידיים שיכולים להיקשר באופן ספציפי למולקולות מטרה נבחרים מתוך מספר רב של ספריות רצפי פפטידים אקראיות.
סינון אפטמרים ספציפי לתאים (Cell-SELEX)	תאי מטרה או מולקולות ספציפיות על פני התא מוכנות כמטרות. מטרות יכולות להיות תאים שלמים, קולטנים על קרום התא, חלבונים או מולקולות קטנות אחרות.
סינון אפטמרים של מולקולות קטנות על ידי Capture SELEX	Capture SELEX היא טכניקת סינון in vitro לסינון אפטמרים של מולקולות קטנות, שהיא גרסה של SELEX. Capture SELEX מתאים במיוחד לסינון אפטמרים של מטרות מולקולות קטנות, שבדרך כלל יש להן פחות קבוצות פונקציונליות וקשה לקבוע אותן ישירות על גבי תומכי פאזה מוצקה.
שירותי SELEX מבוססי בעלי חיים	שירות סינון מבוסס חיות חיים הוא טכניקה ניסיונית הנמצאת בשימוש נרחב בתחומי מדעי החיים, הרפואה והביוטכנולוגיה, המשתמשת בבעלי חיים כמודלים ניסיוניים לסינון והערכת מולקולות, תרופות, טיפולים או תהליכים ביולוגיים ספציפיים. השירותים נועדו לדמות את הסביבה הפיזיולוגית בגוף האדם כדי לחזות ולהעריך בצורה מדויקת יותר את היעילות והבטיחות של תוצאות הניסוי בגוף האדם.

שירות אופטימיזציה של אפטמר

ההידרופיליות, אובדן הזיקה הגבוה במהלך הייצור וההפרשה המהירה של אפטמרים מגבילים את יישומם. כיום, נחקרו מגוון שיטות אופטימיזציה כדי לשפר את ביצועי האפטמרים.

יש לנו גם מגוון דרכים לייעל את האפטמר הכוללות קיטום, מודיפיקציות, צימוד לקבוצה המתאימה (תיול, קרבוקסי, אמין, פלואורופור וכו').

שירות ניתוח אפיון אפטמרים

שירות ניתוח אפיון אפטמרים מתייחס לשירות מקצועי של הערכת ביצועים, רזולוציה, מבנה ואימות פונקציונלי של האפטמר המתקבל על מנת להבטיח שהאפטמר עומד בדרישות יכולת הקישור הספציפיות, היציבות והספציפיות. זה כולל בעיקר ניתוח זיקה וספציפיות, הערכת יציבות ואימות תפקוד ביולוגי.