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タンパク質間相互作用解析サービス

Alpha Lifetech は、さまざまな顧客の実験ニーズを満たすために、タンパク質アッセイ、タンパク質相互作用分析、タンパク質間相互作用アッセイ (CO-IP、ウェスタンブロット、クロマチン免疫沈降アッセイ)、およびタンパク質機能アッセイも顧客に提供できます。

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タンパク質間相互作用解析サービス

Alpha Lifetech は長年にわたりタンパク質アッセイに深く関与し、タンパク質機能アッセイ用の健全なプラットフォームを構築し、タンパク質相互作用を検証するためのさまざまな技術的手段を習得してきました。これにより、科学研究やプロジェクト研究の時間を節約しながら、安定した結果を提供することができます。
Alpha Lifetech は、さまざまな顧客の実験ニーズを満たすために、タンパク質アッセイ、タンパク質相互作用分析、タンパク質間相互作用アッセイ (CO-IP、ウェスタンブロット、クロマチン免疫沈降アッセイ)、およびタンパク質機能アッセイも顧客に提供できます。

タンパク質間相互作用アッセイ入門

タンパク質は、あらゆる生命体において最も重要な実行分子であり、遺伝物質に蓄えられた指令に応答します。多くの場合、タンパク質は他のタンパク質と相互作用する役割を担うことでその役割を果たします。これは、タンパク質の機能を細胞という実際の環境において調べることで、より明確になります。タンパク質間の相互作用を特定することは、個々のタンパク質の生化学研究において非常に重要です。一般的なタンパク質相互作用分析には、以下の種類があります。

共免疫沈降アッセイ

共免疫沈降法の原理は、標的タンパク質、特異的抗体、およびタンパク質A / G磁気ビーズを混合してインキュベーションし、磁気ビーズを磁気ラックに吸着させて結合していないタンパク質の上清を廃棄し、磁気ビーズを洗浄して、特異的に結合していないタンパク質やその他の不純物を除去することです。
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図1 Co-IPアッセイの模式図。(参考元: 共免疫沈降アッセイ - PubMed (nih.gov)

プルダウンアッセイ

プルダウンアッセイは、既知のタンパク質を磁気ビーズ上に固定し、検出対象物質を添加します。溶出液中の相互作用タンパク質の吸着を検出します。
1988 年、スミスらはプルダウン アッセイに応用された GST 融合タンパク質を精製しました。これは Gst プル ダウンと呼ばれ、標的タンパク質に GST タグを追加し、相互作用するタンパク質を GSH を介して捕捉し、結合を溶出させて WB アッセイで検証します。
写真2
図2 GSTプルダウンアッセイの概略図。(参考元: PIF4結合をin vitroで研究するためのGSTプルダウンアッセイ - PubMed (nih.gov)
彼のプルダウンは、ニッケルやコバルトなどの金属イオンを媒体として使用し、アフィニティークロマトグラフィーでタンパク質を精製し、WB実験で結合を溶出して検証するというものです。
さらに、DNA プルダウン (タンパク質 DNA 結合アッセイ)、RNA プルダウン (タンパク質 RNA 相互作用アッセイ)、および小分子プルダウン アッセイがあります。
DNAプルダウン(タンパク質DNA結合アッセイ)は、タンパク質のDNA結合を試験管内で測定する手法です。特定のタンパク質が標的DNAに結合するかどうかをWBアッセイで検出し、タンパク質に結合する未知のDNA断片はMS検出で特定します。
RNAプルダウン(タンパク質-RNA相互作用アッセイ)は、RNAとタンパク質の結合をin vitroで測定する方法です。WBアッセイでは、特定のタンパク質が標的RNAに結合するかどうかを検出しました。MS検出では、タンパク質に結合する未知のRNA断片がどのRNA断片であるかが判明しています。
SM プルダウン (小分子プルダウンアッセイ) は、小分子に特異的に結合する標的タンパク質を見つけることができ、MS と組み合わせると、小分子標的タンパク質を正確にスクリーニングすることができ、in vitro 標識法と生物学的直交法に分けられます。

WB実験

WB実験(ウエスタンブロット実験またはウェスタンブロットとも呼ばれます)の本質は抗原と抗体の特異的反応であり、基本原理はSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動によって変性タンパク質を分離し、膜転写(湿式または半乾式回転)を介して固相担体(PVDF膜、NC膜など)に転写することです。ブロッキング(BSA、バターミルクなどを使用)に続いて、一次抗体を適用してタンパク質に特異的に結合させ、フィルムを洗浄した後、フルオレセイン標識二次抗体を添加します。二次抗体を一次抗体に結合させることにより、基質の発色と化学発光によって標的タンパク質を観察できます。一般的には、サンプル中に特定のタンパク質が発現しているかどうかを判断し、その発現レベルを大まかに分析するために使用されます。
ウェスタンブロット-Alpha Lifetech

タンパク質間相互作用法の比較

タンパク質プルダウンアッセイはCo-IPアッセイに類似しており、どちらもタンパク質相互作用の検出実験に属します。2つの方法の違いは、Co-IPアッセイは既知タンパク質の相互作用タンパク質を取得するため、ある程度の信頼性はありますが、相互作用タンパク質が直接相互作用するか間接的に相互作用するかを確認できないことです。プルダウンアッセイは、既知タンパク質と相互作用する未知のタンパク質を検出するためのものです。既知タンパク質が検出されたタンパク質と相互作用するかどうかを直接確認できますが、生体内での結合状況を知ることはできません。
共免疫沈降技術は、免疫沈降実験に基づいて、2つ以上のタンパク質間に相互作用があるかどうかを分析するために使用されます。他の実験技術(GSTプルダウン、ウエスタンブロット、クロマチン免疫沈降アッセイなど)のタンパク質相互作用分析と比較して、Co-IP技術はより高い特異性、感度、および高い再現性を備えており、非特異的結合の干渉を回避し、自然な状態でのタンパク質の相互作用を反映できます。

GSTプルダウン 共同IP ワーナーブラザーズ
アドバンテージ *操作が簡単
*様々なタンパク質の精製に適しています
*生体内相互作用解析用
*下流のタンパク質と識別できる
*強い特異性
*定性的および定量的in vitro
制限
*非特異的結合の可能性あり
*相互作用のさらなる検証が必要です
*抗体への強い依存
*非特異的結合が起こる可能性がある
*時間がかかる
*大規模なタンパク質分析には使いにくい
アプリケーション例
*相互作用を特定する
*精製タンパク質複合体
*シグナル伝達の研究
*病気のメカニズム
タンパク質-タンパク質、タンパク質-DNA、タンパク質-RNA相互作用のその後の分析

利点1

カスタマイズ

ニーズに合わせてサービスをカスタマイズ
利点2

経験

長年のタンパク質生産経験
利点3

テクノロジー

高品質な納品結果
利点4

実験プロセス

厳格な品質管理プロセス
ご不明な点がございましたら、いつでもお気軽にお問い合わせください。

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