აპტამერის ოპტიმიზაციის სერვისი

„ალფა ლაიფტეკი“ ვალდებულია მომხმარებლებს მიაწოდოს ნუკლეინის მჟავის აპტამერის სკრინინგისა და ოპტიმიზაციის ზუსტი და ეფექტური სერვისები.

დაგვიკავშირდით

აპტამერის ოპტიმიზაციის სერვისი

აპტამერები ერთჯაჭვიანი ოლიგონუკლეოტიდებია, რომლებსაც შეუძლიათ სპეციფიკურად დაუკავშირდნენ სამიზნე მოლეკულებს. ისინი ქმნიან სპეციფიკურ სამგანზომილებიან სტრუქტურას ადაპტური დაკეცვის შემდეგ სხვადასხვა ურთიერთქმედების ძალების მეშვეობით, როგორიცაა ნუკლეოტიდური ბაზის კომპლემენტარული დაწყვილება, წყალბადური ბმა, π-π დაწყობა, ელექტროსტატიკური ძალა და ა.შ. ეს სტრუქტურა სპეციფიკურად უკავშირდება სამიზნე მოლეკულებს ინტერმოლეკულური ძალის მეშვეობით. აპტამერები, როგორც წესი, წარმოიქმნება SELEX სკრინინგის საშუალებით. აპტამერების ოპტიმიზაციის მეთოდები ძირითადად ფოკუსირებულია აპტამერების აფინურობის, სელექციურობისა და სტაბილურობის გაუმჯობესებაზე.

„ალფა ლაიფტეკი“ ვალდებულია მომხმარებლებს მიაწოდოს ნუკლეინის მჟავის აპტამერების სკრინინგისა და ოპტიმიზაციის ზუსტი და ეფექტური სერვისები. სკრინინგისა და ოპტიმიზაციის პროცესი არა მხოლოდ მაღალი ხარისხის აპტამერების მიღების მთავარი ნაბიჯია, არამედ ამ აპლიკაციების წინსვლის მნიშვნელოვანი საფუძველიც. „ალფა ლაიფტეკი“ აგრძელებს უახლესი ტექნოლოგიების დანერგვას და მომსახურების პროცესების ოპტიმიზაციას, რათა უზრუნველყოს, რომ ჩვენი სერვისები ყოველთვის ინდუსტრიის სათავეში იყოს და მომხმარებლებს შესთავაზოს ნუკლეინის მჟავის აპტამერების სკრინინგისა და ოპტიმიზაციის უფრო ეფექტური სერვისი.

SELEX აპტამერის შერჩევა

Alpha Lifetech-ი მრავალი წელია ნუკლეინის მჟავას აპტამერის შემუშავებაზეა ორიენტირებული, რაც ძირითადად ნუკლეინის მჟავას აპტამერის დიზაინს, ნუკლეინის მჟავას აპტამერის ბიბლიოთეკის შექმნას, ნუკლეინის მჟავას აპტამერის სკრინინგს და ნუკლეინის მჟავას აპტამერის სინთეზს მოიცავს.

SELEX სკრინინგის ტექნიკა აპტამერების სკრინინგის მთავარი მეთოდია. Alpha Lifetech-ს შეუძლია არა მხოლოდ SELEX აპტამერების შერჩევა, არამედ SELEX ტექნოლოგიაზე დაფუძნებული სხვა მეთოდების, როგორიცაა Cell-SELEX, CE-SELEX, Capture-SELEX და ა.შ., განხორციელება. აპტამერების in vitro სკრინინგის მეშვეობით მიიღება აპტამერები, რომლებსაც შეუძლიათ სამიზნე მოლეკულის სპეციფიკურად იდენტიფიცირება და აქვთ მაღალი აფინურობა სამიზნე მოლეკულის მიმართ, შემდეგ კი სკრინინგირებულ აპტამერებზე ხორციელდება მაღალი გამტარუნარიანობის სეკვენირება და საბოლოოდ, აპტამერები სინთეზირდება in vitro ქიმიური სინთეზის გზით. გარდა ამისა, Alpha Lifetech-ს შეუძლია შერჩეული აპტამერების ოპტიმიზაცია და ოპტიმიზებული აპტამერების ფუნქციების გადამოწმება.

აპტამერის ოპტიმიზაციის შესავალი

მიუხედავად იმისა, რომ SELEX ტექნოლოგიით შემოწმებულ ნუკლეინის მჟავას აპტამერებს აქვთ ძლიერი აფინურობა სამიზნე მოლეკულების მიმართ, პრაქტიკულ გამოყენებაში, აპტამერები მაინც საჭიროებენ ოპტიმიზაციას, რათა კიდევ უფრო გაუმჯობესდეს აპტამერის სპეციფიკურობა, აპტამერის აფინურობა და აპტამერის სტაბილურობა, რათა დააკმაყოფილონ კონკრეტული გამოყენების სცენარების საჭიროებები.

აპტამერის ოპტიმიზაციის ძირითადი მეთოდები მოიცავს შემდეგ ასპექტებს:

სტრუქტურის ჭრა

შემოკლება: აპტამერის თანმიმდევრობის იმ ნაწილების ამოღებით, რომლებიც არ ან ნაკლებად მოქმედებს სამიზნე მოლეკულის შეკავშირების უნარზე, ბირთვის ამოცნობის არეალის შენარჩუნებით, შესაძლებელია აპტამერის სიგრძის შემცირება და მისი სინთეზის ეფექტურობისა და აპტამერის სტაბილურობის გაუმჯობესება.

მეორადი სტრუქტურის სიმულაციისა და ემპირიული ცდისა და შეცდომის საფუძველზე, ხელოვნურად განისაზღვრა აპტამერის ლოკალური უმაღლესი სტრუქტურა (როგორიცაა ღეროვანი რგოლი, ფსევდოშეერთება, G-ოთხკუთხედი და ა.შ.), ამოიღეს არაფორმირებული ან დაწყვილებული ერთჯაჭვიანი ჯაჭვები, დამოკლდა ღერო, ამოიღეს პატარა ამოზნექილი რგოლები, შეამცირეს რგოლები და ა.შ. მოლეკულური დოკინგის ტექნოლოგია გამოიყენება აპტამერისა და სამიზნე მოლეკულის სამგანზომილებიანი სტრუქტურის პროგნოზირებისთვის უფრო ზუსტი მორგებისთვის.

მუტაციის გაცნობა

შემთხვევითი მუტაციააპტამერული თანმიმდევრობაში შემთხვევითი მუტაციების შესატანად მუტაგენეზის ტექნიკის (მაგალითად, PCR მუტაგენეზის) გამოყენება და SELEX ტექნოლოგიით ხელახალი სკრინინგით შესაძლებელია უფრო მაღალი აფინურობისა და სელექციურობის მქონე მუტანტების მიღება. ამ მეთოდს შეუძლია შეისწავლოს აპტამერული თანმიმდევრობების მრავალფეროვნება და აღმოაჩინოს ახალი შეკავშირების ნიმუშები და ოპტიმიზაციის მიმართულებები.

ლოკალიზაციის სპეციფიკური მუტაციასტრუქტურული ანალიზისა და შეკავშირების ადგილის პროგნოზირების საფუძველზე, შესაძლებელია მუტაციის ადგილების შერჩევა ერთფუძიანი ან მრავალფუძიანი ჩანაცვლებისთვის, რათა შესწავლილ იქნას სხვადასხვა თანმიმდევრობის გავლენა აპტამერის მუშაობაზე. ადგილ-სპეციფიკურ მუტაციას შეუძლია ზუსტად აკონტროლოს აპტამერის სტრუქტურული ცვლილებები მისი მუშაობის ოპტიმიზაციის მიზნით.

ქიმიური მოდიფიკაცია

აპტამერი ქიმიურად მოდიფიცირებულია და მოდიფიკაციის ჯგუფები შეჰყავთ აპტამერის სხვადასხვა პოზიციაზე (მაგალითად, ფუძე, შაქრის რგოლი, ფოსფატური ჯგუფი და ა.შ.), რათა გაუმჯობესდეს აპტამერის სტაბილურობა, ანტინუკლეაზური უნარი და აფინურობა.

სურ. 1 აპტამერების გავრცელებული მოდიფიკაციები. (წყარო:„ნუკლეინის მჟავა“ წიგნი, თავი „ნუკლეინის მჟავას აპტამერები“

გავრცელებული მოდიფიკაციებია 2'-ფტორრიბოზა, 2'-ამინორიბოზა, 2'-ო-მეთილრიბოზა, LNA (დაბლოკილი ნუკლეინის მჟავა) და არამეთილირებული პურინის ნუკლეინის მჟავა (UNA). ამ მოდიფიკაციებს შეუძლიათ შეამცირონ ნუკლეაზების ამოცნობა, გაზარდონ აპტამერების დეგრადაციისადმი წინააღმდეგობის უნარი ან შეცვალონ მათი შეკავშირების თვისებები სამიზნე მოლეკულებთან.

ფუნქციური არეალის გაცნობა

აპტამერს ახალი ფუნქციები ენიჭება, როგორიცაა ფერმენტული აქტივობა და ფლუორესცენციის რეპორტირების უნარი. ლიგანდთან შეკავშირების რეგიონი კატალიზურ რეგიონთან შერწყმულია ფერმენტული აქტივობის მქონე აპტამერის წარმოსაქმნელად. მაგალითად, ფლუორესცენციის გამოსხივების მოლეკულებთან შეკავშირების რეგიონების დამატება ქმნის თვითრეპორტირებად აპტამერს, რომელიც სამიზნესთან წარმატებული შეკავშირების შემდეგ ფლუორესცენტურ სიგნალს ასხივებს.