აპტამერის სკრინინგის სერვისი ცილისთვის

Alpha Lifetech-ს ჰყავს გამოცდილი ტექნიკოსების გუნდი, რომელიც უზრუნველყოფს ცილის აპტამერის სკრინინგის მომსახურებას.

აპტამერის სკრინინგის სერვისი ცილისთვის

„ალფა ლაიფტეკი“ მრავალი წელია აქტიურად არის ჩართული აპტამერების ანალიზებში, შექმნა მყარი პლატფორმა ცილის ფუნქციური ანალიზისთვის აპტამერების სკრინინგისთვის და დაეუფლა ცილების ურთიერთქმედების დასადასტურებლად მრავალფეროვან ტექნიკურ საშუალებებს, რამაც შეიძლება დაზოგოს სამეცნიერო კვლევის ან პროექტის კვლევის დრო და ამავდროულად უზრუნველყოს სტაბილური შედეგები. ჩვენ ვალდებულნი ვართ, ჩვენს მომხმარებლებს შევთავაზოთ მაღალი ხარისხის, მაღალი აფინურობის აპტამერების სკრინინგის მომსახურება.

ინ ვიტრო სკრინინგის დიდი რაოდენობა აჩვენებს, რომ შერჩეულ აპტამერს შეუძლია სპეციფიკურად დაუკავშირდეს ნებისმიერ სამიზნეს. Alpha Lifetech-ის მიერ მოწოდებული აპტამერის სკრინინგის სამიზნეები მოიცავს ცილებს, ამინომჟავებს, პეპტიდებს, ლითონის იონებს და მცირე მოლეკულებს. Alpha Lifetech-ს ასევე შეუძლია მომხმარებლებს მიაწოდოს ცილის შეკავშირების ანალიზები, ცილის დნმ-ის შეკავშირების ანალიზები, ცილის რნმ-ის ურთიერთქმედების ანალიზები, BLI ანალიზები და SPR აფინურობის ანალიზები, რათა დააკმაყოფილოს სხვადასხვა მომხმარებლის ექსპერიმენტული საჭიროებები.

შესავალი ცილისა და ნუკლეინის მჟავის აპტამერში

აპტამერების სწრაფმა განვითარებამ მედიცინის სფეროს დიდი გამოწვევები მოუტანა. ცილები ყველა ბიომოლეკულაში გვხვდება და რთულ ურთიერთობებს ამყარებს სხვადასხვა მოლეკულურ ნივთიერებებთან, ინდივიდუალური ატომებიდან/იონებიდან დაწყებული გიგანტური მაკრომოლეკულებით დამთავრებული. მოლეკულებს შორის ურთიერთქმედება მაღალსპეციფიკურია და მნიშვნელოვან როლს ასრულებს ცხოვრებაში. ვინაიდან მცირე მოლეკულები ცილებს ნაკლები ატომური ურთიერთქმედებით უკავშირდებიან, გაჩნდა აპტამერის ტექნოლოგია.

ნუკლეინის მჟავებსა და ცილებს შორის ურთიერთქმედება გადამწყვეტ როლს ასრულებს ძირითად უჯრედულ პროცესებში, დნმ/რნმ-ზე დაფუძნებულ პოლინუკლეოტიდებს შეუძლიათ სპეციფიკურად მიზანმიმართულად მიმართონ ცილებს ფართო დიაპაზონში, მათ შორის ცილებს, რომლებიც არ ურთიერთქმედებენ ნუკლეინის მჟავებთან ფიზიოლოგიურ და პათოლოგიურ პირობებში. აპტამერის სტრუქტურის შეცვლას შეუძლია დაარეგულიროს ცილასთან ურთიერთქმედება და შემდგომ გავლენა მოახდინოს შესაბამის გზებზე.

ცილა-აპტამერული კომპლექსების პირველი სტრუქტურული დახასიათება მრავალი წლის წინ გავრცელდა, თუმცა აქამდე პროგრესი ნელი იყო. ვან დერ ოოსტმა ცილა-აპტამერული კომპლექსების წინასწარი ანალიზი 2012 წელს ჩაატარა. 2016 წელს, ცილა-აპტამერული ამოცნობის სტრუქტურული თემის დამახასიათებელ კვლევაში აღწერილი იყო მხოლოდ 16 ცილა-აპტამერული კომპლექსი. ცოტა ხნის წინ, ნოვოსელცევამ და სხვებმა შეისწავლეს 45 ასეთი კომპლექსის სტრუქტურა.

ბოლო წლებში, აპტამერების სწრაფი განვითარების შედეგად, რაც აპტამერებსა და ცილებს შორის ურთიერთქმედების სიღრმისეულ შესწავლას გულისხმობს, ნუკლეინის მჟავის აპტამერების სკრინინგის ტექნოლოგია ფართოდ განვითარდა და ბიომოლეკულური დეტექციის ძლიერ ინსტრუმენტად იქცა. მიზანმიმართული ცილის დეგრადაციას დიდი მნიშვნელობა აქვს ქრონიკული დაავადებების, იშვიათი დაავადებების, კიბოს და ა.შ. კვლევაში. ამიტომ, აპტამერები აქტიურად გამოიყენება მიზანმიმართული ცილის დეგრადაციის ტექნოლოგიების დიზაინსა და მშენებლობაში. წლების განმავლობაში ბაზარზე მხოლოდ ერთი აპტამერზე დაფუძნებული პრეპარატი იყო, პეგაპტანიბ ნატრიუმი (Pfizer / Eyetech-ის Macugen), რომელიც FDA-მ 2004 წელს დაამტკიცა მაკულური დეგენერაციის სამკურნალოდ. ცოტა ხნის წინ, FDA-მ დაამტკიცა მეორე რნმ აპტამერი, ავაცინკაპტად პეგოლი (Iveric Bio/Astellas), ასაკობრივი მაკულური დეგენერაციის შედეგად გამოწვეული გეოგრაფიული ატროფიის სამკურნალოდ. სელექსი

სურ. 1. ცილა და ნუკლეინის მჟავა აპტამერი. (წყარო: აპტამერ-ცილის ურთიერთქმედება: რეგულაციიდან ბიომოლეკულურ დეტექციამდე - PubMed (nih.gov))

ცილის აპტამერის სკრინინგის ტექნოლოგია

SELEX სკრინინგის შედეგები დაკავშირებულია ბიბლიოთეკის დიზაინთან, ამიტომ აპტამერის თანმიმდევრობის დიზაინი ძალიან მნიშვნელოვანია. ზოგადად რეკომენდებულია ნუკლეინის მჟავას ჯაჭვის სიგრძის კონტროლი 300 bp/nt-ის ფარგლებში. რადგან გრძელ ნუკლეინის მჟავას მოლეკულას ექნება მრავალი განსხვავებული შეკავშირების ადგილი ცილასთან დასაკავშირებლად, არსებობს შემთხვევები, რომელთა მორგება არსებულ მოდელებთან შეუძლებელია. ამიტომ, ურთიერთქმედების კვლევებისთვის რეკომენდებულია შედარებით მოკლე ნუკლეინის მჟავას ფრაგმენტების (ანუ შეკავშირებაში ჩართული ბირთვის რეგიონის) გამოყენება.

ფიქსირებული ცილა ან ნუკლეინის მჟავა

ორივეს ფიქსირება შესაძლებელია, ნიმუშის ბუნებიდან და ექსპერიმენტის მიზნიდან გამომდინარე.

თუ ცილის ნიმუში სუფთა არ არის, ცილის ფიქსაცია შესაძლებელია ხაფანგის მეთოდით; თუ აუცილებელია სხვადასხვა სახის ცილებსა და ნუკლეინის მჟავას მოლეკულებს შორის აფინურობის შემოწმება, ნუკლეინის მჟავა ფიქსირდება; თუ აუცილებელია ნუკლეინის მჟავების ბიბლიოთეკასა და ცილას შორის მაღალი აფინურობის მქონე აპტამერების სკრინინგი, ცილა ფიქსირდება.

ცილის აპტამერის სკრინინგის მეთოდი

ფიქსირებულ სამიზნეზე დაფუძნებული სკრინინგის ტექნოლოგია

სამიზნის ფიქსაციაზე დაფუძნებული ინ ვიტრო სკრინინგის ტექნოლოგია შემუშავდა აპტამერული ბიბლიოთეკის არასპეციფიკური შეკავშირების, სამიზნე შეკავშირების ადგილების ექსპოზიციის, ცუდი აფინურობისა და ქიმიური მოდიფიკაციის პრობლემების გადასაჭრელად.

ბიბლიოთეკის ფიქსაციაზე დაფუძნებული სკრინინგის ტექნიკა -Capture-SELEX

Capture SELEX-ის აპტამერების ბიბლიოთეკა შედგება შემთხვევითი თანმიმდევრობის, დოკინგის თანმიმდევრობის და პრაიმერის თანმიმდევრობისგან.

ჰომოგენური სკრინინგის ტექნოლოგია

ჰომოგენური სკრინინგის ტექნოლოგია აუმჯობესებს სკრინინგის ეფექტურობას და სკრინინგის შედეგად მიღებული ნუკლეინის მჟავების აპტამერები შეიძლება გარდაიქმნას სენსორებად.

ავტომატური SELEX

ტრადიციული SELEX სკრინინგის ციკლი ძალიან გრძელია. ავტომატიზირებული SELEX სკრინინგი აუმჯობესებს აპტამერის სკრინინგის ეფექტურობას. კვლევებმა აჩვენა, რომ სიმსივნესთან ან დაავადებასთან დაკავშირებული სხვადასხვა ცილა შეირჩევა უკუსკრინინგისთვის, ქიმიური მოდიფიკაციის გზით უერთდება მაგნიტურ მძივებს, შემდეგ კი ნუკლეინის მჟავების ბიბლიოთეკებთან ერთად ინკუბირდება და სამიზნე ცილები სკრინინგით გადის გარეცხვისა და ელუირების მრავალჯერად რაუნდს.

ცილა ნუკლეინის მჟავა აპტამერები შემთხვევა

მარკეტა სვობოდოვამ და სხვებმა წარმატებით შეიმუშავეს აღმოჩენის მეთოდი, რომელსაც შეუძლია სწრაფად აღმოაჩინოს SARS-CoV-2 Spike Protein Antigen აპტამერის სკრინინგის ტექნოლოგიის გამოყენებით.

ვირუსის სატრანსპორტო გარემოში 375 pg ცილის აღმოჩენის შედეგებმა აჩვენა ანალიზის მეთოდის თავსებადობა კლინიკურ ნიმუშებთან. ექსპერიმენტმა ოპტიმიზაცია გაუკეთა ექსპერიმენტულ პირობებს და შესაძლებელი გახდა 21 ნგ/მლ (270 pM) ცილის აღმოჩენა უმნიშვნელო ჯვარედინი რეაქტიულობით სხვა ცნობილ ადამიანის კორონავირუსებთან. ცხვირ-ხახის ნაცხის ნიმუშების S-ანტიგენის ტესტის გამოყენება შესაძლებელია სამიზნე ცილების სკრინინგისთვის და ეპიდემიური დაავადებების ადრეულ ეტაპზე კონტროლისთვის.

სურ. 2. SARS-CoV-2 S ანტიგენის აღმოჩენა აპტამერული სენდვიჩის ანალიზით. (წყაროს მითითება: აპტამერის სენდვიჩის ანალიზი SARS-CoV-2 სპაიკ ცილოვანი ანტიგენის გამოსავლენად - PubMed (nih.gov))

აპტამერის სკრინინგის სერვისის სამუშაო პროცესი

პროცესი	განმარტება	ქრონოლოგია
ნუკლეინის მჟავის აპტამერის სკრინინგი	- მომხმარებელი აწვდის სკრინინგის სამიზნე ინფორმაციას, ხოლო Tektronbio ახორციელებს პროექტის შეფასებას და მოდიფიკაციის სამუშაოებს (ჩვეულებრივი მოდიფიკაცია: ბიოტინის მოდიფიკაცია). -ბიბლიოთეკის გამდიდრება და სკრინინგი: სკრინინგის 6-10 რაუნდი, SA მძივის უარყოფითი სკრინინგი. NGS სეკვენირება. -მიწოდება: 10-50 აპტამერული თანმიმდევრობა, მათი გამოვლენის სიხშირის ჩათვლით. ექსპერიმენტული ანგარიში	8-12 კვირა
აპტამერის სინთეზი და აფინურობის განსაზღვრა	-სინთეზური ბიოტინით მონიშნული აპტამერები (შექმნილი და სინთეზირებული სპეციფიკური პირობების შესაბამისად). -აპტამერისა და სამიზნის სწრაფი აფინურობის განსაზღვრა (აფინურობის სეკვენირება). -მიწოდება: სინთეზის ანგარიში, აფინურობის ტესტის ანგარიში, ორიგინალი მონაცემები	3-4 კვირა

უპირატესობებიაპტამერის სკრინინგის სერვისი

ჩვენ ვალდებულნი ვართ, ჩვენს მომხმარებლებს შევთავაზოთ მაღალი ხარისხის, მაღალი აფინურობის აპტამერების სკრინინგის მომსახურება.

მრავალი სამიზნე

სკრინინგის სამიზნეების ფართო სპექტრი, მათ შორის ცილები, მცირე მოლეკულები, პეპტიდები და ლითონის იონები და ა.შ.
მრავალი მეთოდი

ხელმისაწვდომია სკრინინგის სხვადასხვა მეთოდი, მათ შორის ტრადიციული SELEX, CE-SELEX, Cell-SELEX, GO-SELEX და Capture-SELEX.
ხარისხის უზრუნველყოფა

ჩვენ გვყავს პროფესიონალური გუნდი, რომელსაც აქვს ადაპტერების შემუშავების გამოცდილება, ხოლო ჩვენი ექსპერიმენტული მონაცემები ავთენტური და სანდოა, რაც გადაწყვეტილებებს გვთავაზობს.
ტექნიკური მხარდაჭერა

ჩვენ გვაქვს სრული აღჭურვილობა შემდგომი ოპტიმიზაციისა და ვალიდაციის დასასრულებლად, მაღალი აფინურობისა და მაღალი სპეციფიკურობის აპტამერების წარმოებისთვის, ხელსაყრელ ფასებსა და უფრო მაღალ ხარისხში.