완충액 선택 시에는 표적의 안정성, 결합 미세환경, 그리고 실제 적용 상황에서의 비특이적 결합 최소화를 고려해야 합니다. 관련 없는 단백질, 비이온성 세제, 그리고 생리학적 염 농도는 배경을 줄이는 데 도움이 됩니다. 또한, 일부 표적은 완충액에 2가 양이온이나 다른 보조인자를 첨가해야 할 수 있으며, 단백질 보조인자는 표적과 함께 고정되거나, 분류 완충액에 첨가될 수 있으며, 심지어 표적을 포획하는 수단으로 사용될 수도 있습니다.

일반적인 선택 압력 고려 사항에는 표적 분자의 농도, 결합 시간, 세척 강도 등이 포함됩니다. 선택 압력을 높이는 다른 기술로는 변성제(예: 산, 요소, 구아니딘), 유기 용매 사용, 온도 증가 또는 세척 완충액에서 경쟁 리간드 또는 표적의 농도 증가가 있습니다.
그중에서도 첫 번째 스크리닝이 중요합니다. 첫 번째 스크리닝은 구축된 라이브러리에서 비특이적 클론을 제거하면서 가능한 한 많은 양성 클론을 포획하는 것입니다. 라이브러리의 다양성을 유지하기 위해 많은 수의 결합된 파지를 포획하기 위해 다공성 코팅된 표적이나 많은 수의 가용성 표적을 사용해야 합니다. 이후 스크리닝에서는 농축, 다중 세척, 그리고 세척 시간을 증가시키면서 선택 압력을 높여야 하며, 이를 통해 높은 친화도를 가진 클론을 스크리닝할 수 있습니다.

항원 태그 및 운반체 물질 스크리닝 과정은 태그, 융합 단백질, 지지 기질 등 항원 접합체에 존재하는 모든 물질을 스크리닝하는 것입니다. 비표적 항원에 대한 음성 스크리닝은 표적 항원 이외의 항체의 증폭을 제한할 수 있습니다.
형질전환된 세포주를 스크리닝할 때, 시뮬레이션된 형질전환된 세포나 형질전환되지 않은 세포를 사용하여 전체 세포, 리포좀, 나노 인지질 디스크 및 VLP를 음성적으로 스크리닝할 수 있습니다.
복잡한 항원 혼합물 제거 알려지지 않았거나 복잡한 표적 분자(전체 세포나 불순한 단백질 등)에 대해서는 엄격한 음성 스크리닝을 수행할 수 있습니다.
항원의 특정 부위에 대한 항체의 전략은 하나는 리간드와 경쟁할 수 있는 항체를 고농도의 리간드를 첨가하여 용출시키는 것이고, 다른 하나는 항체를 차단하는 것입니다.

*항체 발견은 현대 의학에서 점점 더 중요해지고 있습니다. 다양한 항체 발견 방법이 존재하지만, 의학에서는 파지 디스플레이 기술이 더 많이 사용됩니다. 1990년 이후 VH, VHH, scFv, 디아바디, Fab 항체 등 다양한 항체 형태가 파지 라이브러리 구축에 사용되어 왔습니다.
*파지 펩타이드 라이브러리는 단백질 에피토프의 서열을 빠르게 결정할 수 있게 해주며 에피토프와 항원 수용체 간의 상호 작용을 조사하는 강력한 도구가 되었습니다.
*항체 단편은 M13 파지의 G3P에 융합되고, 항체 단편을 인코딩하는 많은 수의 유전자를 클로닝함으로써 다양한 항체를 선택할 수 있는 대규모 파지 디스플레이 항체 라이브러리를 생성할 수 있습니다.
*T7 파지 디스플레이 시스템은 단순성, 높은 안전성, 안정성, 보관 및 운송의 용이성 등 많은 장점이 있어 예방 및 치료용 백신에 사용됩니다.
*T7 파지 디스플레이 시스템은 병원성 미생물의 표면 항원, 암 항원 등 다양한 항원을 검출할 수 있습니다.