Aptamer иштеп чыгуу платформасы

Alpha Lifetech тарабынан берилген аптамер платформасы эки категорияны камтыйт: аптамер синтез платформасы жана аптамер скрининг платформасы

БИЗ МЕНЕН БАЙЛАНЫШЫҢЫЗ

Aptamer иштеп чыгуу платформасы

Аптамерлер – бул антителолор сыяктуу максаттуу молекулаларга атайын байланган жогорку аффиндүүлүк жана жогорку спецификалуулук касиетине ээ бир тизмектүү олигонуклеотиддер (ДНК, РНК же XNA) жана алар биосенсорлорду иштеп чыгуу, диагностика жана терапия үчүн кеңири колдонулат.

Alpha Lifetech тарабынан берилген аптамер платформасы эки категорияны камтыйт: негизинен SELEX аптамер китепканасын синтездөө кызматын жана аптамерди (ДНК, РНК же XNA) иштеп чыгуу кызматын камтыган аптамер синтез платформасы жана белоктор, пептиддер, клеткалар, кичинекей молекулалар, металл иондору жана башка максаттуу молекулалар үчүн SELEX технологиясына негизделген скрининг кызматтарын, ошондой эле кийинки аптамерди оптималдаштыруу жана идентификациялоо кызматтарын камтыган аптамерди скрининг платформасы.

Аптамер синтез платформасы

SELEX аптамер китепкана синтези кызматы

SELEX аптамер китепканасын синтездөө кызматы негизинен максаттуу молекулаларга ылайык in vitro химиялык синтез аркылуу көп сандаган кокустук бир тизмектүү олигонуклеотиддик ырааттуулуктарды камтыган китепкананы куруудан турат. Китепкананы куруу SELEX технологиясынын баштапкы чекити болуп саналат, ал чоң кокустук китепканаларды куруу менен кийинки скрининг процесси үчүн көптөгөн кандидаттык ырааттуулуктарды камсыз кылат жана жогорку аффиндүүлүктөгү аптамерлерди скринингдөө мүмкүнчүлүгүн жогорулатат.

Китепкана синтези негизинен төмөнкү этаптарга бөлүнөт:

Кадамдар	Технологиянын чоо-жайы
Максаттуу молекулаларды аныктоо	Аптамерлерге текшерүүдөн өтүү керек болгон максаттуу молекулаларды аныктаңыз, алар белоктор, нуклеин кислоталары, майда молекулярдык, металл иондору ж.б. болушу мүмкүн.
Туш келди ырааттуулуктун дизайны	Кокустук ырааттуулуктун узундугу, негиздин курамы жана башка параметрлер максаттуу молекулалардын мүнөздөмөлөрүнө жана скрининг талаптарына ылайык иштелип чыккан. Адатта, кокустук ырааттуулуктардын узундугу ондогон жана жүздөгөн негиздердин ортосунда болот.
Туруктуу ырааттуулуктардын синтези	Эки учунда тең туруктуу ырааттуулуктары (мисалы, ПЦР праймер ырааттуулуктары) бар олигонуклеотиддик фрагменттер иштелип чыгып, синтезделет, алар кийинки амплификация жана скрининг процессинде колдонулат.

Синтезделген китепкананы сапатты көзөмөлдөө үчүн дагы эле андан ары иштетүү керек. Кийинки текшерүү процессинде анын колдонулушун камсыз кылуу үчүн китепкананын концентрациясы аныкталган. Китепкананын сапаты текшерүү талаптарына жооп берерин камсыз кылуу үчүн китепканадагы кокустук ырааттуулуктардын ар түрдүүлүгү жана тактыгы ырааттуулук жана башка ыкмалар менен текшерилген.

Жогорудагы кадамдар аркылуу жогорку сапаттагы жана ар түрдүү SELEX аптамер китепканасын синтездөөгө болот, ал кийинки скрининг процесси үчүн көптөгөн кандидаттык ырааттуулуктарды камсыздай алат.

Аптамерди өнүктүрүү кызматтары (ДНК, РНК же XNA)

Аптамерлерге көбүнчө нуклеин кислотасынын аптамерлери кирет. Нуклеин кислотасынын аптамерлерине ДНК аптамерлери, РНК аптамерлери жана химиялык жактан модификацияланган нуклеин кислотасынын аптамерлери болгон XNA аптамерлери кирет. SELEX ыкмасы аптамерлерди иштеп чыгуу үчүн кеңири колдонулат. Аптамерлерди иштеп чыгуу кызматтарынын негизги жумуш агымына китепкана куруу, буталарды байлоо, изоляциялоо жана тазалоо, күчөтүү, бир нече айлампалуу скрининг жана ырааттуулукту аныктоо кирет. Көп жылдар бою биз китепкана курууга жана аптамерлерди иштеп чыгууда бай тажрыйбага көңүл буруп келебиз. Биз кардарларга жакшыраак кызматтарды көрсөтүүгө умтулабыз.

SELEX технологиялык процесси

SELEX процесси бир нече раунддан турат, алардын ар бири төмөнкү негизги кадамдардан турат:

Китепкана жана максаттуу байланыш

Курулган нуклеин кислоталарынын китепканасы белгилүү бир максаттуу молекулалар (мисалы, белоктор, кичинекей молекулалык кошулмалар ж.б.) менен аралаштырылат, ошондуктан китепканадагы нуклеин кислоталарынын ырааттуулугу максаттуу молекулаларга байланышуу мүмкүнчүлүгүнө ээ болот.

Байланышпаган молекулаларды бөлүп алуу

Максаттуу молекулага байланбаган нуклеин кислоталарынын ырааттуулугу аралашмадан аффиндик хроматография, магниттик мончокторду бөлүү сыяктуу атайын ыкмалар менен бөлүнөт.

Байланышуучу молекулаларды күчөтүү

Максаттуу молекулага байланган нуклеин кислотасынын ырааттуулугу, адатта, полимераз чынжыр реакциясы (ПЧР) технологиясын колдонуу менен күчөтүлөт. Кийинки скрининг фазасы үчүн күчөтүлгөн ырааттуулуктар баштапкы китепкана катары колдонулат.

1-сүрөт: SELEX скрининг процесси

Аптамер скрининг платформасы

Аптамер скрининг кызматы

Alpha Lifetech ар кандай молекулаларыңыз үчүн ар кандай SELEX методологияларын колдонуу менен адистештирилген аптамер скрининг кызматтарынын кеңири түрүн сунуштайт:

Бута түрлөрү	Техникалык маалыматтар
SELEX тарабынан протеин-аптамер скрининги	Белок аптамерлерин скринингдөөнүн негизги максаты - максаттуу белок молекулаларына атайын байланыша алган аптамерлерди скринингдөө. Бул аптамерлерди синтездөө оңой, туруктуураак жана айлана-чөйрөнүн факторлоруна азыраак сезгич.
SELEX тарабынан пептиддик Аптамерди скринингдөө	Пептиддик аптамерлер – бул жогорку спецификалуулугу жана аффиндүүлүгү бар кыска пептиддик ырааттуулуктардын бир классы, алар максаттуу заттарга атайын байланыша алат жана биомедициналык тармакта кеңири колдонуу потенциалын көрсөтөт. Белгилүү бир скрининг процесси аркылуу максаттуу молекулаларга атайын байланыша алган пептиддик аптамерлер көптөгөн кокустук пептиддик ырааттуулук китепканаларынан скринингден өтөт.
Клеткага мүнөздүү Аптамер скрининги (Cell-SELEX)	Бута клеткалары же клетканын бетиндеги белгилүү бир молекулалар бута катары даярдалат. Буталар бүтүн клеткалар, клетка мембранасындагы рецепторлор, белоктор же башка кичинекей молекулалар болушу мүмкүн.
Capture SELEX тарабынан кичинекей молекулалуу аптамер скрининги	SELEXти кармоо – бул SELEXтин бир варианты болгон кичинекей молекулалуу аптамерлерди скринингдөө үчүн in vitro скрининг ыкмасы. SELEXти кармоо, адатта, азыраак функционалдык топторго ээ болгон жана катуу фазалуу таянычтарда түз иммобилизациялоо кыйын болгон кичинекей молекулалык буталарды аптамердик скринингдөө үчүн өзгөчө ылайыктуу.
Тирүү жаныбарларга негизделген SELEX кызматтары	Тирүү жаныбарларды скринингдөө кызматы – бул биология, медицина жана биотехнология тармактарында кеңири колдонулган эксперименталдык ыкма, ал тирүү жаныбарларды белгилүү бир молекулаларды, медиктерди, терапевттерди же биологиялык процесстерди скринингдөө жана баалоо үчүн эксперименталдык моделдер катары колдонот. Кызматтар адам денесиндеги физиологиялык чөйрөнү симуляциялоо үчүн иштелип чыккан, бул адам денесиндеги эксперименталдык натыйжалардын натыйжалуулугун жана коопсуздугун так алдын ала айтуу жана баалоо үчүн колдонулат.

Aptamer оптималдаштыруу кызматы

Аптамерлердин гидрофилдүүлүгү, өндүрүш учурунда жогорку аффиндүүлүктүн жоголушу жана тез бөлүнүп чыгышы аларды колдонууну чектейт. Учурда, аптамерлердин иштешин жакшыртуу үчүн ар кандай оптималдаштыруу ыкмалары изилденген.

Ошондой эле, бизде аптамерди оптималдаштыруунун ар кандай жолдору бар, анын ичинде кыскартуу, модификациялоо, тиешелүү топко (тиол, карбокси, амин, флуорофор ж.б.) кошулуу.

Аптамердин мүнөздөмөсүн талдоо кызматы

Аптамердин мүнөздөмөсүн талдоо кызматы - бул аптамердин белгилүү бир байланышуу жөндөмүнө, туруктуулугуна жана спецификация талаптарына жооп берерин камсыз кылуу үчүн алынган аптамердин иштешин баалоо түзүмүн чечүү жана функционалдык текшерүү боюнча кесипкөй кызмат. Ал негизинен жакындыкты жана спецификацияны талдоону, туруктуулукту баалоону жана биологиялык функцияны текшерүүнү камтыйт.