ເວທີການພັດທະນາ Aptamer

ແພລະຕະຟອມ aptamer ສະຫນອງໃຫ້ໂດຍ Alpha Lifetech ປະກອບມີສອງປະເພດ: ເວທີການສັງເຄາະ aptamer ແລະເວທີການຄັດລອກ aptamer

ເວທີການພັດທະນາ Aptamer

Aptamers ແມ່ນ oligonucleotide ສາຍດຽວ (DNA, RNA ຫຼື XNA) ທີ່ມີຄຸນສົມບັດຂອງຄວາມໃກ້ຊິດແລະຄວາມສະເພາະສູງທີ່ຜູກມັດໂດຍສະເພາະກັບໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍເຊັ່ນ: ພູມຕ້ານທານ, ແລະພວກມັນຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງສໍາລັບການພັດທະນາຂອງ biosensors, ການວິນິດໄສແລະການປິ່ນປົວ.

ແພລະຕະຟອມ aptamer ສະຫນອງໃຫ້ໂດຍ Alpha Lifetech ປະກອບມີສອງປະເພດ: ແພລະຕະຟອມການສັງເຄາະ aptamer, ເຊິ່ງສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບການບໍລິການສັງເຄາະຫ້ອງສະຫມຸດ SELEX aptamer ແລະການບໍລິການພັດທະນາ aptamer (DNA, RNA ຫຼື XNA), ແລະເວທີການກວດກາ aptamer ລວມທັງການບໍລິການກວດກາໂດຍອີງໃສ່ເຕັກໂນໂລຊີ SELEX ສໍາລັບທາດໂປຼຕີນ, peptides, ຈຸລັງເປົ້າຫມາຍ, downions ຂະຫນາດນ້ອຍແລະ molecules ໂລຫະ. aptamer optimization ແລະການບໍລິການການວິເຄາະການກໍານົດ.

ເວທີການສັງເຄາະ Aptamer

ບໍລິການສັງເຄາະຫ້ອງສະໝຸດ SELEX Aptamer

ບໍລິການສັງເຄາະຫ້ອງສະໝຸດ SELEX aptamer ສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດທີ່ມີຈໍານວນລໍາດັບ oligonucleotide ແບບສຸ່ມຈໍານວນຫລາຍໂດຍການສັງເຄາະສານເຄມີໃນ vitro ຕາມໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍ. ການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດແມ່ນຈຸດເລີ່ມຕົ້ນຂອງເຕັກໂນໂລຢີ SELEX, ເຊິ່ງສະຫນອງລໍາດັບຜູ້ສະຫມັກທີ່ອຸດົມສົມບູນສໍາລັບຂະບວນການກວດສອບຕໍ່ໄປໂດຍການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດແບບສຸ່ມຂະຫນາດໃຫຍ່ແລະເພີ່ມຄວາມເປັນໄປໄດ້ຂອງການຄັດເລືອກ aptamers ທີ່ມີຄວາມສໍາພັນສູງ.

ການສັງເຄາະຫ້ອງສະໝຸດສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນແບ່ງອອກເປັນຂັ້ນຕອນຕໍ່ໄປນີ້:

ຂັ້ນຕອນ	ລາຍລະອຽດເຕັກໂນໂລຊີ
ກໍານົດໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍ	ກໍານົດໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍທີ່ຕ້ອງໄດ້ຮັບການກວດກາສໍາລັບ aptamers, ເຊິ່ງສາມາດເປັນທາດໂປຼຕີນ, ອາຊິດນິວເຄຼຍ, ໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ, ໂລຫະ ions, ແລະອື່ນໆ.
ການອອກແບບລໍາດັບແບບສຸ່ມ	ຄວາມຍາວຂອງລໍາດັບແບບສຸ່ມ, ອົງປະກອບຂອງພື້ນຖານແລະຕົວກໍານົດການອື່ນໆໄດ້ຖືກອອກແບບໂດຍອີງຕາມລັກສະນະຂອງໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍແລະຄວາມຕ້ອງການຂອງການກວດສອບ. ໂດຍປົກກະຕິ, ລໍາດັບແບບສຸ່ມແມ່ນລະຫວ່າງສິບຫາຫຼາຍຮ້ອຍຖານໃນຄວາມຍາວ.
ການສັງເຄາະຂອງລໍາດັບຄົງທີ່	ຊິ້ນ Oligonucleotide ທີ່ມີລໍາດັບຄົງທີ່ (ເຊັ່ນ: ລໍາດັບ PCR primer) ຢູ່ທັງສອງສົ້ນໄດ້ຖືກອອກແບບແລະສັງເຄາະ, ເຊິ່ງຈະຖືກນໍາໃຊ້ໃນຂະບວນການຂະຫຍາຍແລະການກວດສອບຕໍ່ໄປ.

ຫ້ອງສະຫມຸດສັງເຄາະຍັງຕ້ອງໄດ້ຮັບການປຸງແຕ່ງຕື່ມອີກສໍາລັບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ. ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງຫ້ອງສະຫມຸດໄດ້ຖືກກໍານົດເພື່ອຮັບປະກັນການນໍາໃຊ້ຂອງມັນໃນຂະບວນການກວດກາຕໍ່ໄປ. ຄວາມຫຼາກຫຼາຍແລະຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງລໍາດັບແບບສຸ່ມໃນຫ້ອງສະຫມຸດໄດ້ຖືກກວດສອບໂດຍການຈັດລໍາດັບແລະວິທີການອື່ນໆເພື່ອຮັບປະກັນວ່າຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດໄດ້ສອດຄ່ອງກັບຄວາມຕ້ອງການຂອງການກວດສອບ.

ໂດຍຜ່ານຂັ້ນຕອນຂ້າງເທິງ, ຫ້ອງສະຫມຸດ SELEX aptamer ທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງແລະມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍສູງສາມາດຖືກສັງເຄາະ, ເຊິ່ງສາມາດສະຫນອງລໍາດັບຜູ້ສະຫມັກທີ່ອຸດົມສົມບູນສໍາລັບຂະບວນການກວດສອບຕໍ່ໄປ.

ບໍລິການພັດທະນາ Aptamer (DNA, RNA ຫຼື XNA)

Aptamers ປົກກະຕິແລ້ວຫມາຍເຖິງ aptamers ອາຊິດ nucleic. ອາຊິດນິວຄລີອິກ aptamers ປະກອບ DNA aptamers, RNA aptamers, ແລະ XNA aptamers ເຊິ່ງເປັນ aptamers ອາຊິດ nucleic ທີ່ຖືກດັດແປງທາງເຄມີ. ເຕັກນິກ SELEX ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງສໍາລັບການພັດທະນາຂອງ aptamers. ຂະບວນການເຮັດວຽກພື້ນຖານຂອງການບໍລິການພັດທະນາ aptamer ປະກອບມີການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດ, ການຜູກມັດເປົ້າຫມາຍ, ການໂດດດ່ຽວແລະການຊໍາລະລ້າງ, ການຂະຫຍາຍ, ການຄັດເລືອກຫຼາຍຮອບ, ແລະການກໍານົດລໍາດັບ. ສໍາລັບເວລາຫຼາຍປີ, ພວກເຮົາໄດ້ສຸມໃສ່ການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດແລະປະສົບການອຸດົມສົມບູນໃນການພັດທະນາ aptamer. ພວກເຮົາມຸ່ງຫມັ້ນທີ່ຈະໃຫ້ບໍລິການລູກຄ້າທີ່ດີກວ່າ.

ຂະບວນການເຕັກໂນໂລຊີ SELEX

ຂະບວນການ SELEX ປະກອບດ້ວຍຫຼາຍຮອບ, ແຕ່ລະອັນປະກອບດ້ວຍຂັ້ນຕອນສໍາຄັນຕໍ່ໄປນີ້:

ຫໍສະຫມຸດແລະການຜູກມັດເປົ້າຫມາຍ

ຫໍສະຫມຸດອາຊິດນິວຄລີອິກທີ່ສ້າງຂຶ້ນແມ່ນປະສົມກັບໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍສະເພາະ (ເຊັ່ນ: ທາດໂປຼຕີນ, ທາດປະສົມໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ, ແລະອື່ນໆ), ດັ່ງນັ້ນລໍາດັບອາຊິດນິວເຄຼຍໃນຫ້ອງສະຫມຸດມີໂອກາດທີ່ຈະຜູກມັດກັບໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍ.

ການໂດດດ່ຽວຂອງໂມເລກຸນທີ່ບໍ່ໄດ້ຜູກມັດ

ລຳດັບອາຊິດນິວຄລີອິກທີ່ບໍ່ໄດ້ຜູກມັດກັບໂມເລກຸນເປົ້າໝາຍແມ່ນແຍກອອກຈາກການປະສົມໂດຍວິທີການສະເພາະເຊັ່ນ: ໂຄມາຕາເຟຣນິຕີ, ການແຍກລູກປັດແມ່ເຫຼັກ, ແລະອື່ນໆ.

ການຂະຫຍາຍໂມເລກຸນຜູກມັດ

ລຳດັບອາຊິດນິວຄລີອິກທີ່ຜູກມັດກັບໂມເລກຸນເປົ້າໝາຍຖືກຂະຫຍາຍອອກ, ໂດຍປົກກະຕິແລ້ວແມ່ນໃຊ້ເທັກໂນໂລຍີລະບົບຕ່ອງໂສ້ຕິກິຣິຍາໂພລີເມີເຣສ (PCR). ສໍາລັບໄລຍະການກວດກາຕໍ່ມາ, ລໍາດັບຂະຫຍາຍຈະຖືກນໍາໃຊ້ເປັນຫ້ອງສະຫມຸດເລີ່ມຕົ້ນ.

Fig 1: ຂະບວນການກວດ SELEX

ເວທີການຄັດເລືອກ Aptamer

ບໍລິການກວດຫາ Aptamer

Alpha Lifetech ສະຫນອງການບໍລິການກວດກາ aptamer ພິເສດຫຼາກຫຼາຍຊະນິດທີ່ນໍາໃຊ້ວິທີການ SELEX ຕ່າງໆສໍາລັບປະເພດຕ່າງໆຂອງໂມເລກຸນຂອງທ່ານ:

ປະເພດເປົ້າໝາຍ	ລາຍລະອຽດດ້ານວິຊາການ
ການຄັດເລືອກ Protein Aptamer ໂດຍ SELEX	ຈຸດປະສົງຕົ້ນຕໍຂອງການກວດທາດໂປຼຕີນຈາກ aptamer ແມ່ນເພື່ອຄັດລອກ aptamers ທີ່ສາມາດຜູກມັດໂດຍສະເພາະກັບໂມເລກຸນທາດໂປຼຕີນ. aptamers ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນງ່າຍທີ່ຈະສັງເຄາະ, ຄວາມຫມັ້ນຄົງຫຼາຍແລະຫນ້ອຍຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ປັດໄຈສິ່ງແວດລ້ອມ.
ການກວດ Peptide Aptamer ໂດຍ SELEX	Peptide aptamers ແມ່ນປະເພດຂອງລໍາດັບ peptide ສັ້ນທີ່ມີຄວາມສະເພາະແລະຄວາມກ່ຽວຂ້ອງສູງ, ເຊິ່ງໂດຍສະເພາະສາມາດຜູກມັດກັບສານທີ່ກໍານົດເປົ້າຫມາຍແລະສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງຄວາມສາມາດຂອງຄໍາຮ້ອງສະຫມັກຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນຂົງເຂດຊີວະແພດ. ໂດຍຜ່ານຂະບວນການກວດກາສະເພາະ, peptide aptamers ທີ່ສາມາດຜູກມັດໂດຍສະເພາະກັບໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍແມ່ນໄດ້ຖືກກວດສອບຈາກຈໍານວນຂະຫນາດໃຫຍ່ຂອງຫ້ອງສະຫມຸດລໍາດັບ peptide ແບບສຸ່ມ.
ການກວດ Aptamer ສະເພາະເຊລ (Cell-SELEX)	ຈຸລັງເປົ້າຫມາຍຫຼືໂມເລກຸນສະເພາະຢູ່ເທິງຫນ້າຂອງເຊນໄດ້ຖືກກະກຽມເປັນເປົ້າຫມາຍ. ເປົ້າຫມາຍສາມາດເປັນຈຸລັງທັງຫມົດ, receptors ໃນເຍື່ອຈຸລັງ, ທາດໂປຼຕີນ, ຫຼືໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍອື່ນໆ.
ການກວດ Aptamer ໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍໂດຍການຈັບ SELEX	Capture SELEX ແມ່ນເຕັກນິກການກວດກາໃນ vitro ສໍາລັບການກວດສອບຂອງ aptamers ໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ, ເຊິ່ງເປັນຕົວແປຂອງ SELEX. Capture SELEX ແມ່ນເຫມາະສົມໂດຍສະເພາະສໍາລັບການກວດສອບ aptamer ຂອງເປົ້າຫມາຍໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ, ເຊິ່ງປົກກະຕິແລ້ວມີກຸ່ມທີ່ເຮັດວຽກຫນ້ອຍແລະຍາກທີ່ຈະ immobilization ໂດຍກົງກ່ຽວກັບການສະຫນັບສະຫນູນໄລຍະແຂງ.
ການບໍລິການ SELEX ທີ່ອີງໃສ່ສັດສົດ	ບໍລິການກວດຫາສັດທີ່ມີຊີວິດເປັນເຕັກນິກການທົດລອງທີ່ໃຊ້ກັນຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນຂົງເຂດຊີວະວິທະຍາ, ຢາປົວພະຍາດ ແລະ ເຕັກໂນໂລຊີຊີວະພາບ, ເຊິ່ງໃຊ້ສັດທີ່ມີຊີວິດເປັນຕົວແບບທົດລອງເພື່ອກວດກາ ແລະ ປະເມີນໂມເລກຸນສະເພາະ, ແພດສາດ, ບຳບັດ ຫຼືຂະບວນການທາງຊີວະວິທະຍາ. ການບໍລິການດັ່ງກ່າວຖືກອອກແບບມາເພື່ອຈໍາລອງສະພາບແວດລ້ອມທາງກາຍະພາບໃນຮ່າງກາຍຂອງມະນຸດເພື່ອຄາດຄະເນແລະປະເມີນປະສິດທິຜົນແລະຄວາມປອດໄພຂອງຜົນການທົດລອງໃນຮ່າງກາຍຂອງມະນຸດຢ່າງຖືກຕ້ອງ.

ບໍລິການເພີ່ມປະສິດທິພາບ Aptamer

hydrophilicity, ການສູນເສຍຄວາມໃກ້ຊິດສູງໃນລະຫວ່າງການຜະລິດ, ແລະການຂັບໄລ່ຢ່າງໄວວາຂອງ aptamers ຈໍາກັດການສະຫມັກຂອງເຂົາເຈົ້າ. ໃນປັດຈຸບັນ, ຫຼາຍໆວິທີການເພີ່ມປະສິດທິພາບໄດ້ຖືກຄົ້ນຫາເພື່ອເພີ່ມປະສິດທິພາບຂອງ aptamers.

ພວກເຮົາຍັງມີຫຼາຍວິທີທີ່ຈະເພີ່ມປະສິດທິພາບ aptamer ປະກອບດ້ວຍການຕັດ, ການດັດແປງ, ການປະສົມກັບກຸ່ມທີ່ເຫມາະສົມ (thiol, carboxy, amine, fluorophore, ແລະອື່ນໆ).

ບໍລິການວິເຄາະລັກສະນະ Aptamer

ການບໍລິການການວິເຄາະລັກສະນະ Aptamer ຫມາຍເຖິງການບໍລິການມືອາຊີບຂອງການແກ້ໄຂໂຄງສ້າງການປະເມີນຜົນການປະຕິບັດແລະການກວດສອບການເຮັດວຽກຂອງ aptamer ທີ່ໄດ້ຮັບເພື່ອຮັບປະກັນວ່າ aptamer ຕອບສະຫນອງຄວາມສາມາດຜູກມັດ, ຄວາມຫມັ້ນຄົງແລະຄວາມຕ້ອງການສະເພາະ. ມັນສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນປະກອບມີການວິເຄາະຄວາມໃກ້ຊິດແລະສະເພາະ, ການປະເມີນຄວາມຫມັ້ນຄົງແລະການກວດສອບການເຮັດວຽກທາງຊີວະພາບ.