Aptamer plėtros platforma

Aptamerai yra vienagrandžiai oligonukleotidai (DNR, RNR arba XNA), pasižymintys dideliu afinitetu ir dideliu specifiškumu, kurie specifiškai jungiasi su tikslinėmis molekulėmis, pavyzdžiui, antikūnais, ir yra plačiai naudojami kuriant biojutiklius, diagnozuojant ir gydant.

Alpha Lifetech teikiama aptamerio platforma apima dvi kategorijas: aptamerių sintezės platformą, kuri daugiausia apima SELEX aptamerių bibliotekos sintezės paslaugą ir aptamerių (DNR, RNR arba XNA) kūrimo paslaugą, ir aptamerių atrankos platformą, įskaitant baltymų, peptidų, ląstelių, mažų molekulių, metalo jonų ir kitų tikslinės analizės bei kitų aptamerų identifikavimo ir kitų tyrimų paslaugas, pagrįstas SELEX technologija.

Aptamer sintezės platforma

SELEX aptamer bibliotekos sintezės paslauga

SELEX aptamero bibliotekos sintezės paslauga daugiausia apima bibliotekos, kurioje yra daug atsitiktinių vienos grandinės oligonukleotidų sekų, kūrimą cheminės sintezės in vitro būdu pagal tikslines molekules. Bibliotekos kūrimas yra SELEX technologijos atspirties taškas, kuris pateikia gausias kandidatų sekas tolesniam atrankos procesui, sukuriant didžiules atsitiktines bibliotekas ir padidina didelio afiniteto aptamerių atrankos galimybę.

Bibliotekos sintezė daugiausia skirstoma į šiuos etapus:

Žingsniai	Technologijos detalės
Nustatykite tikslines molekules	Nustatykite tikslines molekules, kurias reikia patikrinti dėl aptamerių, kurie gali būti baltymai, nukleorūgštys, mažos molekulės, metalų jonai ir kt.
Atsitiktinės sekos dizainas	Atsitiktinės sekos ilgis, bazės sudėtis ir kiti parametrai buvo sukurti pagal tikslinių molekulių charakteristikas ir atrankos reikalavimus. Paprastai atsitiktinės sekos yra nuo dešimčių iki šimtų bazių ilgio.
Fiksuotų sekų sintezė	Suprojektuojami ir sintetinami oligonukleotidų fragmentai su fiksuotomis sekomis (pvz., PGR pradmenų sekomis) abiejuose galuose, kurie bus naudojami tolesniame amplifikacijos ir atrankos procese.

Susintetintą biblioteką dar reikia apdoroti, kad būtų galima kontroliuoti kokybę. Bibliotekos koncentracija buvo nustatyta siekiant užtikrinti jos pritaikymą tolesniame atrankos procese. Atsitiktinių sekų įvairovė ir tikslumas bibliotekoje buvo patikrintos sekos nustatymu ir kitais metodais, siekiant užtikrinti, kad bibliotekos kokybė atitiktų atrankos reikalavimus.

Atlikus pirmiau nurodytus veiksmus, galima susintetinti aukštos kokybės ir labai įvairią SELEX aptamerio biblioteką, kuri gali suteikti gausių kandidatų sekų tolesniam atrankos procesui.

Aptamer kūrimo paslaugos (DNR, RNR arba XNA)

Aptamerai paprastai reiškia nukleorūgščių aptamerius. Nukleino rūgščių aptamerai apima DNR aptamerus, RNR aptamerius ir XNA aptamerus, kurie yra chemiškai modifikuoti nukleorūgščių aptamerai. SELEX technika plačiai naudojama aptamerams kurti. Pagrindinė aptamerio kūrimo paslaugų darbo eiga apima bibliotekos kūrimą, taikinio surišimą, izoliavimą ir gryninimą, amplifikaciją, kelis atrankos etapus ir sekos identifikavimą. Daugelį metų mes sutelkėme dėmesį į bibliotekos statybą ir didelę aptamer kūrimo patirtį. Esame įsipareigoję teikti klientams geresnes paslaugas.

SELEX technologijos procesas

SELEX procesas susideda iš kelių raundų, kurių kiekvienas susideda iš šių pagrindinių žingsnių:

Biblioteka ir taikinių įrišimas

Sukurta nukleorūgščių biblioteka sumaišoma su specifinėmis tikslinėmis molekulėmis (pvz., baltymais, mažų molekulių junginiais ir kt.), todėl bibliotekoje esančios nukleorūgščių sekos turi galimybę prisijungti prie tikslinių molekulių.

Nesurištų molekulių išskyrimas

Nukleino rūgščių sekos, nesusijusios su tiksline molekule, yra atskiriamos nuo mišinio specifiniais metodais, tokiais kaip afininė chromatografija, magnetinių granulių atskyrimas ir kt.

Surišančių molekulių amplifikacija

Nukleino rūgščių seka, susieta su tiksline molekule, amplifikuojama, dažniausiai naudojant polimerazės grandininės reakcijos (PGR) technologiją. Vėlesniam atrankos etapui sustiprintos sekos bus naudojamos kaip pradinė biblioteka.

1 pav. SELEX atrankos procesas

Aptamer atrankos platforma

Aptamer patikros paslauga

Alpha Lifetech siūlo platų specializuotų aptamerių patikros paslaugų spektrą, taikydama įvairias SELEX metodikas skirtingų tipų jūsų molekulėms:

Tiksliniai tipai	Techninės detalės
SELEX atlikta baltymų aptamerio atranka	Pagrindinis baltymų aptamerių atrankos tikslas yra patikrinti aptamerius, kurie gali specifiškai prisijungti prie tikslinių baltymų molekulių. Šie aptamerai yra lengviau sintezuojami, stabilesni ir mažiau jautrūs aplinkos veiksniams.
SELEX atliktas peptidų aptamerio patikrinimas	Peptidų aptamerai yra trumpų peptidų sekų klasė, pasižyminti dideliu specifiškumu ir afinitetu, galinčių specifiškai prisijungti prie tikslinių medžiagų ir parodyti platų panaudojimo potencialą biomedicinos srityje. Atliekant specifinį atrankos procesą, peptidų aptamerai, kurie gali specifiškai prisijungti prie tikslinių molekulių, yra atrenkami iš daugybės atsitiktinių peptidų sekų bibliotekų.
Ląstelėms būdingas aptamerio patikrinimas (Cell-SELEX)	Tikslinės ląstelės arba specifinės molekulės ląstelės paviršiuje paruošiamos kaip taikiniai. Taikiniai gali būti ištisos ląstelės, ląstelės membranos receptoriai, baltymai ar kitos mažos molekulės.
„Capture SELEX“ atlikta mažų molekulių aptamerio atranka	Capture SELEX yra in vitro atrankos metodas, skirtas mažų molekulių aptamerių atrankai, kuris yra SELEX variantas. Capture SELEX ypač gerai tinka mažų molekulių taikinių, kurie paprastai turi mažiau funkcinių grupių ir kuriuos sunku imobilizuoti tiesiai ant kietosios fazės atramų, aptamerio atrankai.
Gyvi gyvūnai SELEX paslaugos	Gyvų gyvūnų atrankos paslauga yra eksperimentinė technika, plačiai naudojama biomokslų, medicinos ir biotechnologijų srityse, pagal kurią gyvi gyvūnai naudojami kaip eksperimentiniai modeliai tam tikroms molekulėms, medikams, terapiniams ar biologiniams procesams tikrinti ir įvertinti. Paslaugos skirtos imituoti fiziologinę žmogaus organizmo aplinką, kad būtų galima tiksliau prognozuoti ir įvertinti eksperimentinių rezultatų efektyvumą ir saugumą žmogaus organizme.

Aptamer optimizavimo paslauga

Hidrofiliškumas, didelis afiniteto praradimas gamybos metu ir greitas aptamerų išsiskyrimas riboja jų naudojimą. Šiuo metu buvo ištirta daugybė optimizavimo metodų, siekiant pagerinti aptamerių veikimą.

Taip pat turime įvairių būdų optimizuoti aptamerį, kurį sudaro sutrumpinimas, modifikacijos, konjugacija į atitinkamą grupę (tiolis, karboksi, aminas, fluoroforas ir kt.).

Aptamer charakteristikų analizės paslauga

Aptamerio apibūdinimo analizės paslauga reiškia profesionalią gauto aptamerio veikimo vertinimo struktūros skyros ir funkcinio patikrinimo paslaugą, siekiant užtikrinti, kad aptameris atitiktų specifinius rišamumo, stabilumo ir specifiškumo reikalavimus. Tai daugiausia apima giminingumo ir specifiškumo analizę, stabilumo įvertinimą ir biologinės funkcijos patikrinimą.