Aptameru izstrādes platforma

Aptameri ir vienpavedienu oligonukleotīdi (DNS, RNS vai XNA) ar augstu afinitāti un specifiskumu, kas specifiski saistās ar mērķa molekulām, piemēram, antivielām, un tos plaši izmanto biosensoru, diagnostikas un terapijas izstrādē.

Alpha Lifetech nodrošinātā aptameru platforma ietver divas kategorijas: aptameru sintēzes platformu, kas galvenokārt ietver SELEX aptameru bibliotēkas sintēzes pakalpojumu un aptameru (DNS, RNS vai XNA) izstrādes pakalpojumu, un aptameru skrīninga platformu, kas ietver skrīninga pakalpojumus, kuru pamatā ir SELEX tehnoloģija olbaltumvielām, peptīdiem, šūnām, mazām molekulām, metālu joniem un citām mērķa molekulām, kā arī lejupējas aptameru optimizācijas un identifikācijas analīzes pakalpojumus.

Aptamer sintēzes platforma

SELEX aptameru bibliotēkas sintēzes pakalpojums

SELEX aptameru bibliotēkas sintēzes pakalpojums galvenokārt ietver bibliotēkas, kas satur lielu skaitu nejaušu vienpavedienu oligonukleotīdu secību, konstruēšanu, izmantojot in vitro ķīmisko sintēzi atbilstoši mērķa molekulām. Bibliotēkas konstruēšana ir SELEX tehnoloģijas sākumpunkts, kas nodrošina bagātīgas kandidātu sekvences turpmākajam skrīninga procesam, veidojot milzīgas nejaušas bibliotēkas un palielinot augstas afinitātes aptameru skrīninga iespējas.

Bibliotēkas sintēze galvenokārt ir sadalīta šādos posmos:

Soļi	Tehnoloģiju detaļas
Identificējiet mērķa molekulas	Identificējiet mērķa molekulas, kurām jāveic skrīnings attiecībā uz aptamēriem, kas var būt olbaltumvielas, nukleīnskābes, mazas molekulas, metālu joni utt.
Nejaušas secības dizains	Nejaušas secības garums, bāzes sastāvs un citi parametri tika izstrādāti atbilstoši mērķa molekulu īpašībām un skrīninga prasībām. Parasti nejaušas secības garums ir no desmitiem līdz simtiem bāzu.
Fiksēto secību sintēze	Tiek izstrādāti un sintezēti oligonukleotīdu fragmenti ar fiksētām sekvencēm (piemēram, PCR praimeru sekvencēm) abos galos, kas tiks izmantoti turpmākajā amplifikācijas un skrīninga procesā.

Sintezētā bibliotēka vēl ir jāapstrādā tālāk kvalitātes kontrolei. Bibliotēkas koncentrācija tika noteikta, lai nodrošinātu tās piemērojamību turpmākajā skrīninga procesā. Nejaušo secību daudzveidība un precizitāte bibliotēkā tika pārbaudīta ar sekvencēšanu un citām metodēm, lai nodrošinātu, ka bibliotēkas kvalitāte atbilst skrīninga prasībām.

Veicot iepriekš minētās darbības, var sintezēt augstas kvalitātes un ļoti daudzveidīgu SELEX aptameru bibliotēku, kas var nodrošināt bagātīgas kandidātu sekvences turpmākajam skrīninga procesam.

Aptamēru izstrādes pakalpojumi (DNS, RNS vai XNA)

Aptamēri parasti attiecas uz nukleīnskābju aptamēriem. Nukleīnskābju aptamēri ietver DNS aptamērus, RNS aptamērus un XNA aptamērus, kas ir ķīmiski modificēti nukleīnskābju aptamēri. SELEX metode tiek plaši izmantota aptamēru izstrādē. Aptameru izstrādes pakalpojumu pamata darbplūsma ietver bibliotēkas veidošanu, mērķa saistīšanu, izolēšanu un attīrīšanu, amplifikāciju, vairākas skrīninga kārtas un secības identifikāciju. Daudzus gadus mēs esam koncentrējušies uz bibliotēku veidošanu un mums ir bagātīga pieredze aptameru izstrādē. Mēs esam apņēmušies sniegt klientiem labākus pakalpojumus.

SELEX tehnoloģijas process

SELEX process sastāv no vairākiem posmiem, no kuriem katrs ietver šādus galvenos soļus:

Bibliotēkas un mērķa saistīšana

Izveidotā nukleīnskābju bibliotēka tiek sajaukta ar specifiskām mērķa molekulām (piemēram, olbaltumvielām, mazo molekulu savienojumiem utt.), lai bibliotēkas nukleīnskābju sekvencēm būtu iespēja saistīties ar mērķa molekulām.

Nesaistīto molekulu izolēšana

Nukleīnskābju sekvences, kas nav saistītas ar mērķa molekulu, tiek atdalītas no maisījuma ar specifiskām metodēm, piemēram, afinitātes hromatogrāfiju, magnētisko lodīšu atdalīšanu utt.

Saistošo molekulu amplifikācija

Ar mērķa molekulu saistītā nukleīnskābju secība tiek amplificēta, parasti izmantojot polimerāzes ķēdes reakcijas (PCR) tehnoloģiju. Nākamajā skrīninga fāzē amplificētās secības tiks izmantotas kā sākuma bibliotēka.

1. attēls: SELEX skrīninga process

Aptameru skrīninga platforma

Aptamēru skrīninga pakalpojums

Alpha Lifetech piedāvā plašu specializētu aptameru skrīninga pakalpojumu klāstu, izmantojot dažādas SELEX metodoloģijas dažādiem jūsu molekulu veidiem:

Mērķu veidi	Tehniskā informācija
Olbaltumvielu aptameru skrīnings ar SELEX	Olbaltumvielu aptameru skrīninga galvenais mērķis ir pārbaudīt aptamerus, kas var specifiski saistīties ar mērķa olbaltumvielu molekulām. Šie aptameri ir vienkāršāk sintezējami, stabilāki un mazāk jutīgi pret vides faktoriem.
Peptīdu aptameru skrīnings ar SELEX	Peptīdu aptamēri ir īsu peptīdu secību klase ar augstu specifiskumu un afinitāti, kas var specifiski saistīties ar mērķa vielām un uzrāda plašu pielietojuma potenciālu biomedicīnas jomā. Izmantojot īpašu skrīninga procesu, no liela skaita nejaušu peptīdu secību bibliotēku tiek pārbaudīti peptīdu aptamēri, kas var specifiski saistīties ar mērķa molekulām.
Šūnu specifiskā aptameru skrīnings (Cell-SELEX)	Kā mērķi tiek sagatavotas mērķa šūnas vai specifiskas molekulas uz šūnas virsmas. Mērķi var būt veselas šūnas, receptori uz šūnas membrānas, olbaltumvielas vai citas mazas molekulas.
Mazo molekulu aptameru skrīnings ar Capture SELEX	Capture SELEX ir in vitro skrīninga metode mazo molekulu aptamēru skrīningam, kas ir SELEX variants. Capture SELEX ir īpaši piemērota mazo molekulu mērķu aptameru skrīningam, kuriem parasti ir mazāk funkcionālo grupu un kurus ir grūti imobilizēt tieši uz cietfāzes nesējiem.
Uz dzīviem dzīvniekiem balstīti SELEX pakalpojumi	Skrīninga pakalpojums, kas balstīts uz dzīviem dzīvniekiem, ir eksperimentāla metode, ko plaši izmanto biozinātnēs, medicīnā un biotehnoloģijā, izmantojot dzīvus dzīvniekus kā eksperimentālus modeļus, lai pārbaudītu un novērtētu noteiktas molekulas, medikamentus, terapeitiskos līdzekļus vai bioloģiskos procesus. Pakalpojumi ir izstrādāti, lai simulētu fizioloģisko vidi cilvēka ķermenī, lai precīzāk prognozētu un novērtētu eksperimentālo rezultātu efektivitāti un drošību cilvēka organismā.

Aptameru optimizācijas pakalpojums

Aptamēru hidrofilitāte, augstais afinitātes zudums ražošanas laikā un straujā izdalīšanās ierobežo to pielietojumu. Pašlaik ir pētītas dažādas optimizācijas metodes, lai uzlabotu aptamēru veiktspēju.

Mums ir arī dažādi aptameru optimizācijas veidi, kas sastāv no saīsināšanas, modifikācijām, konjugācijas ar atbilstošo grupu (tiolu, karboksigrupu, amīnu, fluoroforu utt.).

Aptameru raksturojuma analīzes pakalpojums

Aptameru raksturošanas analīzes pakalpojums attiecas uz profesionālu pakalpojumu, kas ietver iegūtā aptamera veiktspējas novērtēšanu, struktūras izšķiršanu un funkcionālo verifikāciju, lai nodrošinātu, ka aptamers atbilst specifiskajām saistīšanās spējas, stabilitātes un specifiskuma prasībām. Tas galvenokārt ietver afinitātes un specifiskuma analīzi, stabilitātes novērtēšanu un bioloģiskās funkcijas verifikāciju.