Aptamer оновчлолын үйлчилгээ

Аптамерууд нь зорилтот молекулуудтай тусгайлан холбогдож чаддаг нэг гинжин олигонуклеотидууд юм. Эдгээр нь нуклеотидын суурийн нэмэлт хослол, устөрөгчийн холбоо, π-π давхарлах, электростатик хүч гэх мэт янз бүрийн харилцан үйлчлэлийн хүчээр дасан зохицох нугалах дараа тодорхой гурван хэмжээст бүтэц үүсгэдэг. Энэ бүтэц нь молекул хоорондын хүчээр зорилтот молекулуудтай тусгайлан холбогддог. Аптамерыг ихэвчлэн SELEX скринингээр үйлдвэрлэдэг. Аптамерын оновчлолын аргууд нь гол төлөв aptamer-ийн ойр дотно байдал, сонгомол байдал, тогтвортой байдлыг сайжруулахад чиглэгддэг.

Альфа Lifetech нь үйлчлүүлэгчдэд нуклейн хүчлийн аптамерын скрининг, оновчлолын үнэн зөв, үр дүнтэй үйлчилгээг үзүүлэх үүрэгтэй. Шалгах, оновчтой болгох үйл явц нь өндөр чанартай аптамер олж авах гол алхам төдийгүй эдгээр програмуудыг хөгжүүлэх чухал үндэс суурь юм. Альфа Lifetech нь манай үйлчилгээг үргэлж салбартаа тэргүүлж, нуклейн хүчлийн аптамерын шинжилгээ, оновчлолын үйлчилгээний туршлагыг хэрэглэгчдэд хүргэхийн тулд хамгийн сүүлийн үеийн технологиудыг нэвтрүүлж, үйлчилгээний үйл явцыг оновчтой болгосоор байна.

SELEX Aptamer сонголт

Альфа Lifetech нь нуклейн хүчлийн аптамерын дизайн, нуклейн хүчлийн аптамерын номын сангийн бүтэц, нуклейн хүчлийн аптамерын скрининг, нуклейн хүчлийн аптамерын нийлэгжилт зэрэг чиглэлээр олон жилийн турш нуклейн хүчлийн аптамерын хөгжилд анхаарлаа хандуулж ирсэн.

SELEX скрининг хийх арга нь аптамерыг илрүүлэх үндсэн арга юм. Alpha Lifetech нь зөвхөн SELEX aptamer сонголтоор хангаад зогсохгүй SELEX технологид суурилсан Cell-SELEX, CE-SELEX, Capture-SELEX гэх мэт бусад аргыг ашиглах боломжтой. Аптамеруудыг in vitro скринингоор дамжуулан зорилтот молекулыг тусгайлан таних чадвартай, зорилтот молекултай өндөр хамааралтай аптамеруудыг гаргаж аваад дараа нь дэлгэцэнд хийсэн аптамерууд дээр өндөр үр дүнтэй дараалал хийж, эцэст нь in vitro химийн синтезээр aptamerуудыг нэгтгэдэг. Нэмж дурдахад Alpha Lifetech нь сонгосон аптамеруудыг оновчтой болгож, оновчтой aptamer-ийн үйл ажиллагааг шалгах боломжтой.

Aptamer Optimization-ийн танилцуулга

SELEX технологиор шалгасан нуклейн хүчлийн аптамерууд нь зорилтот молекулуудтай хүчтэй холбоотой байдаг ч практик хэрэглээнд апптамеруудын өвөрмөц байдал, аптамерын хамаарал ба аптамерын тогтвортой байдлыг сайжруулахын тулд хэрэглээний тодорхой хувилбаруудын хэрэгцээг хангахын тулд оновчтой болгох шаардлагатай хэвээр байна.

Аптамерыг оновчтой болгох үндсэн аргууд нь дараахь зүйлийг агуулна.

Бүтцийн зүсэлт

Таслах: Зорилтот молекулын холбох чадварт нөлөөлдөггүй эсвэл бага нөлөө үзүүлдэг аптамерын дарааллын хэсгүүдийг устгаж, үндсэн таних хэсгийг хадгалснаар аптамерын уртыг богиносгож, синтезийн үр ашиг, аптамерын тогтвортой байдлыг сайжруулах боломжтой.

Хоёрдогч бүтцийн загварчлал, эмпирик туршилт, алдаан дээр үндэслэн аптамерын орон нутгийн дээд бүтцийг (ишний цагираг, псевдохолболт, G-дөрвөлжин гэх мэт) зохиомлоор тодорхойлж, хэлбэргүй эсвэл хосолсон дан гинжийг зайлуулж, ишийг богиносгож, жижиг гүдгэр цагирагуудыг зайлуулж, цагирагыг багасгах, цагирагыг багасгах гэх мэт технологийг ашигласан. аптамер болон зорилтот молекулын гурван хэмжээст бүтэц нь илүү нарийвчлалтай оёдол юм.

Мутацийг танилцуулж байна

Санамсаргүй мутаци: Аптамерын дараалалд санамсаргүй мутацийг нэвтрүүлэхийн тулд мутагенезийн техникийг (ПГУ-ын мутагенез гэх мэт) ашиглах ба SELEX технологиор дахин скрининг хийснээр илүү ойр дотно, сонгомол мутантуудыг олж авах боломжтой. Энэ арга нь аптамерын дарааллын олон янз байдлыг судалж, шинэ холболтын хэв маяг, оновчтой болгох чиглэлийг олж мэдэх боломжтой.

Сайтын өвөрмөц мутаци: Бүтцийн шинжилгээ ба холболтын талбайн таамаглал дээр үндэслэн аптамерын гүйцэтгэлд янз бүрийн дарааллын үр нөлөөг судлахын тулд нэг суурь эсвэл олон суурьт орлуулах боломжтой мутацийн газрыг сонгоно. Сайтын тусгай мутаци нь түүний гүйцэтгэлийг оновчтой болгохын тулд аптамерын бүтцийн өөрчлөлтийг нарийн хянах боломжтой.

Химийн өөрчлөлт

Аптамер нь химийн хувьд өөрчлөгдсөн бөгөөд аптамерын тогтвортой байдал, нуклеазын эсрэг чадвар, ойр дотно байдлыг сайжруулахын тулд аптамерын янз бүрийн байрлалд (суурь, сахарын цагираг, фосфатын бүлэг гэх мэт) өөрчлөлтийн бүлгүүдийг нэвтрүүлдэг.

Зураг.1 Аптамеруудын нийтлэг өөрчлөлтүүд. (Лавлах эх сурвалж:Нуклейн хүчил” ном, “Нуклейн хүчлийн аптамерууд” бүлэг

Нийтлэг өөрчлөлтүүд нь 2 '-фторрибоз, 2' -амин рибоз, 2'-о-метилрибоз, LNA (түгжигдсэн нуклейн хүчил), метилгүй пурины нуклейн хүчил (UNA) юм. Эдгээр өөрчлөлтүүд нь нуклеазыг таних чадварыг бууруулж, аптамеруудын задралыг эсэргүүцэх чадварыг нэмэгдүүлэх эсвэл зорилтот молекулуудтай холбох шинж чанарыг өөрчлөх боломжтой.

Үйл ажиллагааны талбарыг танилцуулж байна

Аптамер нь ферментийн идэвхжил, флюресценцийн мэдээлэх чадвар зэрэг шинэ функцээр хангагдсан. Лиганд холбох бүс нь каталитик бүстэй нийлж ферментийн идэвхжилтэй аптамер үүсгэдэг. Жишээлбэл, флюресценц ялгаруулах молекулуудтай холбогддог бүс нутгийг нэмснээр зорилтот холболтыг амжилттай гүйцэтгэсний дараа флюресцент дохио ялгаруулдаг өөрөө мэдээлэх аптамер үүсдэг.