Platform Pembangunan Aptamer

Aptamer ialah oligonukleotida untai tunggal (DNA, RNA atau XNA) dengan sifat afiniti tinggi dan kekhususan tinggi yang secara khusus mengikat pada molekul sasaran seperti antibodi, dan ia digunakan secara meluas untuk pembangunan biosensor, diagnosis dan terapeutik.

Platform aptamer yang disediakan oleh Alpha Lifetech merangkumi dua kategori: platform sintesis aptamer, yang terutamanya melibatkan perkhidmatan sintesis perpustakaan aptamer SELEX dan perkhidmatan pembangunan aptamer (DNA, RNA atau XNA), dan platform saringan aptamer termasuk perkhidmatan saringan berdasarkan teknologi SELEX untuk protein, peptida, sel, molekul kecil, ion logam dan molekul sasaran lain, serta perkhidmatan pengoptimuman aptamer hiliran dan analisis pengenalpastian.

Platform Sintesis Aptamer

Perkhidmatan sintesis perpustakaan aptamer SELEX

Perkhidmatan sintesis perpustakaan aptamer SELEX terutamanya melibatkan pembinaan perpustakaan yang mengandungi sebilangan besar jujukan oligonukleotida untai tunggal rawak melalui sintesis kimia in vitro mengikut molekul sasaran. Pembinaan perpustakaan merupakan titik permulaan teknologi SELEX, yang menyediakan jujukan calon yang banyak untuk proses penyaringan seterusnya dengan membina perpustakaan rawak yang besar dan meningkatkan kemungkinan penyaringan aptamer berafiniti tinggi.

Sintesis perpustakaan dibahagikan kepada langkah-langkah berikut:

Langkah-langkah	Butiran Teknologi
Kenal pasti Molekul Sasaran	Kenal pasti molekul sasaran yang perlu ditapis untuk aptamer, yang boleh jadi protein, asid nukleik, molekul kecil, ion logam, dsb.
Reka Bentuk Turutan Rawak	Panjang jujukan rawak, komposisi bes dan parameter lain direka bentuk mengikut ciri-ciri molekul sasaran dan keperluan penyaringan. Biasanya, jujukan rawak adalah antara puluhan dan ratusan bes panjangnya.
Sintesis Jujukan Tetap	Serpihan oligonukleotida dengan jujukan tetap (seperti jujukan primer PCR) pada kedua-dua hujung direka bentuk dan disintesis, yang akan digunakan dalam proses amplifikasi dan penyaringan seterusnya.

Pustaka yang disintesis masih perlu diproses selanjutnya untuk kawalan kualiti. Kepekatan perpustakaan ditentukan bagi memastikan kebolehgunaannya dalam proses penyaringan seterusnya. Kepelbagaian dan ketepatan jujukan rawak dalam perpustakaan telah disahkan melalui penjujukan dan kaedah lain untuk memastikan kualiti perpustakaan memenuhi keperluan penyaringan.

Melalui langkah-langkah di atas, pustaka aptamer SELEX yang berkualiti tinggi dan sangat pelbagai boleh disintesis, yang boleh menyediakan jujukan calon yang banyak untuk proses penyaringan seterusnya.

Perkhidmatan pembangunan Aptamer (DNA, RNA atau XNA)

Aptamer biasanya merujuk kepada aptamer asid nukleik. Aptamer asid nukleik merangkumi aptamer DNA, aptamer RNA, dan aptamer XNA yang merupakan aptamer asid nukleik yang diubah suai secara kimia. Teknik SELEX digunakan secara meluas untuk pembangunan aptamer. Aliran kerja asas perkhidmatan pembangunan aptamer termasuk pembinaan perpustakaan, pengikatan sasaran, pengasingan dan penulenan, amplifikasi, pelbagai pusingan penyaringan, dan pengenalpastian jujukan. Selama bertahun-tahun, kami telah menumpukan pada pembinaan perpustakaan dan pengalaman yang kaya dalam pembangunan aptamer. Kami komited untuk menyediakan pelanggan dengan perkhidmatan yang lebih baik.

Proses Teknologi SELEX

Proses SELEX terdiri daripada beberapa pusingan, setiap satunya terdiri daripada langkah-langkah utama berikut:

Perpustakaan dan Pengikatan Sasaran

Pustaka asid nukleik yang dibina dicampurkan dengan molekul sasaran tertentu (seperti protein, sebatian molekul kecil, dsb.), supaya jujukan asid nukleik dalam pustaka berpeluang untuk mengikat pada molekul sasaran.

Pengasingan Molekul Tidak Terikat

Urutan asid nukleik yang tidak terikat pada molekul sasaran dipisahkan daripada campuran melalui kaedah tertentu seperti kromatografi afiniti, pemisahan manik magnetik, dan sebagainya.

Penguatan Molekul Pengikat

Urutan asid nukleik yang terikat pada molekul sasaran dikuatkan, biasanya menggunakan teknologi tindak balas rantai polimerase (PCR). Untuk fasa penyaringan berikutnya, urutan yang dikuatkan akan digunakan sebagai pustaka permulaan.

Rajah 1: Proses penyaringan SELEX

Platform Saringan Aptamer

Perkhidmatan saringan Aptamer

Alpha Lifetech menawarkan pelbagai perkhidmatan saringan aptamer khusus yang menggunakan pelbagai metodologi SELEX untuk pelbagai jenis molekul anda:

Jenis Sasaran	Butiran Teknikal
Saringan Protein Aptamer oleh SELEX	Tujuan utama saringan aptamer protein adalah untuk menapis aptamer yang boleh mengikat secara khusus pada molekul protein sasaran. Aptamer ini lebih mudah disintesis, lebih stabil dan kurang terdedah kepada faktor persekitaran.
Saringan Peptida Aptamer oleh SELEX	Aptamer peptida ialah kelas jujukan peptida pendek dengan kekhususan dan afiniti yang tinggi, yang boleh mengikat secara khusus kepada bahan sasaran dan menunjukkan pelbagai potensi aplikasi dalam bidang bioperubatan. Melalui proses penyaringan khusus, aptamer peptida yang boleh mengikat secara khusus kepada molekul sasaran ditapis daripada sebilangan besar perpustakaan jujukan peptida rawak.
Saringan Aptamer Khusus Sel (Cell-SELEX)	Sel sasaran atau molekul tertentu pada permukaan sel disediakan sebagai sasaran. Sasaran boleh terdiri daripada sel keseluruhan, reseptor pada membran sel, protein atau molekul kecil lain.
Saringan Aptamer Molekul Kecil oleh Capture SELEX	Capture SELEX ialah teknik saringan in vitro untuk saringan aptamer molekul kecil, yang merupakan varian SELEX. Capture SELEX amat sesuai untuk saringan aptamer sasaran molekul kecil, yang biasanya mempunyai kumpulan berfungsi yang lebih sedikit dan sukar untuk diimobilisasi secara langsung pada sokongan fasa pepejal.
Perkhidmatan SELEX berasaskan Haiwan Hidup	Perkhidmatan saringan berasaskan haiwan hidup merupakan teknik eksperimen yang digunakan secara meluas dalam bidang biosains, perubatan dan bioteknologi, yang menggunakan haiwan hidup sebagai model eksperimen untuk menyaring dan menilai molekul, pakar perubatan, terapeutik atau proses biologi tertentu. Perkhidmatan ini direka bentuk untuk mensimulasikan persekitaran fisiologi dalam tubuh manusia bagi meramalkan dan menilai keberkesanan dan keselamatan keputusan eksperimen dalam tubuh manusia dengan lebih tepat.

Perkhidmatan pengoptimuman Aptamer

Hidrofilisiti, kehilangan afiniti yang tinggi semasa pengeluaran, dan perkumuhan aptamer yang cepat mengehadkan aplikasinya. Pada masa ini, pelbagai kaedah pengoptimuman telah diterokai untuk meningkatkan prestasi aptamer.

Kami juga mempunyai pelbagai cara untuk mengoptimumkan aptamer yang terdiri daripada pemotongan, pengubahsuaian, konjugasi kepada kumpulan yang sesuai (tiol, karboksi, amina, fluorofor, dll.).

Perkhidmatan analisis pencirian Aptamer

Perkhidmatan analisis pencirian Aptamer merujuk kepada perkhidmatan profesional bagi penyelesaian struktur penilaian prestasi dan pengesahan fungsi aptamer yang diperoleh untuk memastikan aptamer memenuhi keperluan keupayaan pengikatan, kestabilan dan kekhususan khusus. Ia terutamanya merangkumi analisis afiniti dan kekhususan, penilaian kestabilan dan pengesahan fungsi biologi.