ଆଫିନିଟି ମାପ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ
ଅକ୍ଟେଟ୍ ଏବଂ ବାୟାକୋର୍-T2000 ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ଉପରେ ଆଧାରିତ, ଆଲଫା ଲାଇଫଟେକ୍ ନିର୍ଭରଯୋଗ୍ୟ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ସେବା ପ୍ରଦାନ କରିପାରିବ।
ଆମ ସହିତ ଯୋଗାଯୋଗ କରନ୍ତୁ୦୧
ଆଫିନିଟି ମାପ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ
ଅକ୍ଟେଟ୍ ଏବଂ ବାୟାକୋର୍-T2000 ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ଉପରେ ଆଧାରିତ, ଆଲଫା ଲାଇଫଟେକ୍ ନିର୍ଭରଯୋଗ୍ୟ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ସେବା ପ୍ରଦାନ କରିପାରିବ। ଆମେ ଆଣ୍ଟିବଡି, କୋଷ, ପ୍ରୋଟିନ୍, ଛୋଟ ଅଣୁ ଇତ୍ୟାଦି ଅନେକ ନମୁନା ପାଇଁ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ପ୍ରଦାନ କରିପାରିବା। ପୃଷ୍ଠ ପ୍ଲାଜମନ୍ ରେଜୋନାନ୍ସ (SPR) ଏବଂ ଜୈବ-ସ୍ତର ହସ୍ତକ୍ଷେପ (BLI) ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ସମେତ ବିଭିନ୍ନ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ପଦ୍ଧତି ଅଛି।
ଆଲଫା ଲାଇଫଟେକ୍ର ଏକ ବୃତ୍ତିଗତ ଏବଂ ସଠିକ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ଅଛି ଯାହା ELISA କୁ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ସହିତ ମିଶ୍ରଣ କରେ, ଯାହା ବିଶ୍ୱବ୍ୟାପୀ ଗ୍ରାହକମାନଙ୍କ ପାଇଁ ବୃତ୍ତିଗତ, ଦକ୍ଷ, ଦ୍ରୁତ ଏବଂ ସଠିକ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ଫଳାଫଳ ପ୍ରଦାନ କରେ। ଆମେ ଗ୍ରାହକମାନଙ୍କୁ ବାଛିବା ପାଇଁ ଦୁଇଟି ପଦ୍ଧତି ପ୍ରଦାନ କରିପାରିବା: ଦ୍ରୁତ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ଏବଂ ସଠିକ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ। ଦ୍ରୁତ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ହେଉଛି ଏକକ-ସାନ୍ଦ୍ରତା ନିର୍ଣ୍ଣୟ, ଯେତେବେଳେ ସଠିକ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ବିଭିନ୍ନ ସାନ୍ଦ୍ରତାର ଆଫିନିଟି ମାପିପାରେ। ବିଭିନ୍ନ କ୍ଷୁଦ୍ର ଅଣୁ ଯୌଗିକ, ପେପ୍ଟାଇଡ୍ସ, ପ୍ରୋଟିନ୍, ଅଲିଗୋନ୍ୟୁକ୍ଲିଓଟାଇଡ୍ସ ଏବଂ ଅଲିଗୋମର୍ସ, ଏବଂ ଲିପିଡ୍, ବ୍ୟାକ୍ଟିରୋଫେଜ୍, ଭାଇରସ୍ ଏବଂ କୋଷ ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାର ଅଧ୍ୟୟନରେ ପ୍ରୟୋଗ କରାଯାଏ। ଆଫିନିଟି ମାପ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ଆଫିନିଟି ଔଷଧ ପରୀକ୍ଷା ଏବଂ ସ୍କ୍ରିନିଂ, ଆଣ୍ଟିବଡି ଆବିଷ୍କାର ପାଇଁ ଏକ ଭିତ୍ତିଭୂମି ସ୍ଥାପନ କରିପାରିବ ଏବଂ ପରବର୍ତ୍ତୀ ଗବେଷଣାକୁ ସହଜ କରିପାରିବ।
ବାଇଣ୍ଡିଂ ଆଫିନିଟିର ପରିଚୟ
ଆନ୍ତଃଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା, ଆଫିନିଟି ଔଷଧ ପରୀକ୍ଷା ଏବଂ ଔଷଧ ସ୍କ୍ରିନିଂ ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନରେ ଆଫିନିଟି ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ। ଆନ୍ତଃଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାକୁ ସମୀକରଣ ଦ୍ୱାରା ବର୍ଣ୍ଣନା କରାଯାଇପାରିବ: L + R = LR, ଯେଉଁଠାରେ L ମୁକ୍ତ ଲିଗାଣ୍ଡକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ, R ଅବାନ୍ଧିତ ରିସେପ୍ଟରକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ, ଏବଂ LR ଆବଦ୍ଧ ଲିଗାଣ୍ଡ-ରିସେପ୍ଟର ଜଟିଳକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ। ବନ୍ଧନ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ଆନ୍ତଃଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାକୁ ପରିଭାଷିତ କରେ, ଯେଉଁଠାରେ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ସମୟରେ ଆବଦ୍ଧ ଏବଂ ଅବାନ୍ଧିତ ଅବସ୍ଥା ମଧ୍ୟରେ ଗତିଶୀଳ ବିନିମୟ ଘଟେ ଯେପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ସନ୍ତୁଳନ ପହଞ୍ଚି ନଥାଏ। ଏହାକୁ ପ୍ରତିକ୍ରିୟାର ଦୁଇଟି ହାର ସ୍ଥିରାଙ୍କ, Kon (ବନ୍ଧନ ହାର ସ୍ଥିର) ଏବଂ Koff (ବିଚ୍ଛିନ୍ନ ହାର ସ୍ଥିର) ଦ୍ୱାରା ବର୍ଣ୍ଣନା କରାଯାଇପାରିବ। Kd ମୂଲ୍ୟ, ଯାହା ବନ୍ଧନ ସ୍ଥିରାଙ୍କ (Ka) ର ପାରସ୍ପରିକ, ହେଉଛି Koff/Kon, ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ଆଫିନିଟି ପାଇଁ ଏକ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ସ୍ଥିରାଙ୍କ। ତେଣୁ, ଦୁଇଟି ଅଣୁ ମଧ୍ୟରେ ବନ୍ଧନ ଯେତେ କଠୋର ହେବ, ଆଫିନିଟି ସେତେ ଅଧିକ ହେବ। Kd ମୂଲ୍ୟ ଯେତେ ଛୋଟ ହେବ, ବିପରୀତ। ଏହି ସମୀକରଣକୁ ଏକ ଅର୍ଦ୍ଧ-ଲଗାରିଥମିକ୍ ଗ୍ରାଫରେ S-ଆକୃତିର ବକ୍ର ଭାବରେ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରାଯାଇପାରିବ, x-ଅକ୍ଷରେ (ଲଗାରିଥମିକ୍ ସ୍କେଲ୍ ଅକ୍ଷରେ) ଲିଗାଣ୍ଡ ସାନ୍ଦ୍ରତା ଏବଂ y-ଅକ୍ଷରେ ଭଗ୍ନ ସୀମା ସହିତ। ଡ୍ୟାସ୍ ହୋଇଥିବା ରେଖା 0.5 ବନ୍ଧନ ଭଗ୍ନାଂଶର Kd (1 nM) ରେ ଲିଗାଣ୍ଡ ସାନ୍ଦ୍ରତାକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ।
ଚିତ୍ର ୧: କୋଷ ପୃଷ୍ଠ ରିସେପ୍ଟର ସହିତ ବନ୍ଧିତ ଲିଗାଣ୍ଡର ବିଭିନ୍ନ ସାନ୍ଦ୍ରତାର ସିଗମୋଏଡାଲ୍ ବାଇଣ୍ଡିଂ ବକ୍ର। (ସନ୍ଦର୍ଭ ଉତ୍ସ: ହଣ୍ଟର SA, କୋକ୍ରାନ ଜେଆର। ପ୍ରୋଟିନ-ପ୍ରୋଟିନ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାର ଆନୁକୂଳତା ନିର୍ଣ୍ଣୟ ପାଇଁ କୋଷ-ବନ୍ଧନ ପରୀକ୍ଷା: ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ଏବଂ ବିଚାର।)
ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବା ପାଇଁ ପଦ୍ଧତିଗୁଡ଼ିକ
ELISA ବାନ୍ଧନାତ୍ମକ ଆଫିନିଟି ପରୀକ୍ଷା
ଆଣ୍ଟିବଡି ଆଫିନେଟି ଅଧ୍ୟୟନ ପାଇଁ ବହୁଳ ଭାବରେ ବ୍ୟବହୃତ କୌଶଳ ELISA ପଦ୍ଧତି ଉପରେ ଆଧାରିତ, ଯାହା ଏହାର ସୁବିଧା, ଗତି, ସରଳତା, ଉଚ୍ଚ ସମ୍ବେଦନଶୀଳତା ଏବଂ ଦୃଢ଼ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟତା ଦ୍ୱାରା ବର୍ଣ୍ଣିତ। ଏହା ଅଳ୍ପ ପରିମାଣର ରିଏଜେଣ୍ଟ (ଯଥା, ଆଣ୍ଟିବଡି ଏବଂ ଆଣ୍ଟିଜେନ୍) ବ୍ୟବହାର କରିପାରିବ ଏବଂ ଶୁଦ୍ଧିକରଣ ରିଏଜେଣ୍ଟର ଆବଶ୍ୟକତା ବିନା ଆଣ୍ଟିବଡି ଆଫିନେଟି ମାପିପାରିବ। ଏକ କଠିନ ପୃଷ୍ଠରେ ଆଣ୍ଟିଜେନକୁ ସ୍ଥିର କରି ଏବଂ ଏକ ପ୍ରାଥମିକ ଆଣ୍ଟିବଡି ବ୍ୟବହାର କରି ଏହାକୁ ଚିହ୍ନଟ କରି, ଲେବଲ୍ ହୋଇଥିବା ଦ୍ୱିତୀୟ ଆଣ୍ଟିବଡି ଏକ ଏନଜାଇମ-ଲିଙ୍କ୍ଡ ଇମ୍ୟୁନୋସର୍ବଣ୍ଟ ପରୀକ୍ଷା (ELISA) ରିଡରରେ ତଥ୍ୟ ପଢିବା ଏବଂ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିବା ପାଇଁ ପ୍ରାଥମିକ ଆଣ୍ଟିବଡି ସହିତ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା କରେ।
ଚିତ୍ର ୨: ଡିଜାଇନ୍ କରାଯାଇଥିବା ପେପ୍ଟାଇଡ୍ସକୁ ସେମାନଙ୍କ ଲକ୍ଷ୍ୟସ୍ଥଳରେ ବାନ୍ଧିବା ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ କରିବା ପାଇଁ ELISA-ପରି ପରୀକ୍ଷା। (ସନ୍ଦର୍ଭ ଉତ୍ସ: ହାଜିକାରିମଲୋ, ମାରିୟମ, ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ, 2022। SARS-CoV-2 ପୃଷ୍ଠ ପ୍ରୋଟିନ୍ S ଚିହ୍ନଟ କରୁଥିବା ପେପ୍ଟାଇଡ୍ସକୁ ଦ୍ରୁତ ଗତିରେ ଡିଜାଇନ୍ କରିବା ପାଇଁ ଏକ କମ୍ପ୍ୟୁଟେସନାଲ୍ ପଦ୍ଧତି।)
ପୃଷ୍ଠ ପ୍ଲାଜମନ୍ ରେଜୋନାନ୍ସ (SPR) ବାଇଣ୍ଡିଂ ଆଫିନିଟି ପରୀକ୍ଷା
SPR ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ମୁଖ୍ୟତଃ ପ୍ରତିସରଣ ସୂଚକାଙ୍କରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଚିହ୍ନଟ କରେ। ପାରମ୍ପରିକ ଅପ୍ଟିକାଲ୍ ଘଟଣା ଏବଂ ଆଲୋକର ଅନୁନାଦ ଘଟଣା ସାହାଯ୍ୟରେ, ବାୟୋସେନ୍ସିଂ ଚିପ୍ସରେ ଲିଗାଣ୍ଡ ଏବଂ ବିଶ୍ଳେଷଣକାରୀଙ୍କ ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ ଜୈବ ଅଣୁ ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ପାଇଁ ଏକ ଜୈବ ସେନ୍ସିଂ ବିଶ୍ଳେଷଣ ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ନିର୍ମାଣ କରାଯାଇପାରିବ। ଜୈବିକ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ସମୟରେ SPR କୋଣରେ ଗତିଶୀଳ ପରିବର୍ତ୍ତନଗୁଡ଼ିକୁ ନିରୀକ୍ଷଣ କରି ଜୈବ ଅଣୁ ମଧ୍ୟରେ ବନ୍ଧନ ଏବଂ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାର ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ସଙ୍କେତ ପାଇହେବ।
ଚିତ୍ର 3: H10/AGR2 ବନ୍ଧନର ପୃଷ୍ଠ ପ୍ଲାଜମନ୍ ରେଜୋନାନ୍ସ (SPR) ବିଶ୍ଳେଷଣ। (ସନ୍ଦର୍ଭ ଉତ୍ସ: ଗାରି, କାରୋଲିନା, ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ, ୨୦୧୮। ପୂର୍ବ ଗ୍ରେଡିଏଣ୍ଟ ହୋମୋଲୋଗ 2 (AGR2) ବିରୁଦ୍ଧରେ ଏକ ନୂତନ ପେପ୍ଟାଇଡର ଚିହ୍ନଟ, ଚରିତ୍ରୀକରଣ ଏବଂ ପ୍ରୟୋଗ।)
ବାୟୋ ଲେୟର ହସ୍ତକ୍ଷେପ (BLI) ବାଇଣ୍ଡିଂ ଆଫିନିଟି ପରୀକ୍ଷା
ବାୟୋଫିଲ୍ମ ହସ୍ତକ୍ଷେପ ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ହେଉଛି ଏକ ଲେବଲ୍-ମୁକ୍ତ, ବାସ୍ତବ-ସମୟ ମନିଟରିଂ ଅପ୍ଟିକାଲ୍ ଚିହ୍ନଟ କୌଶଳ ଯାହା ମୁଖ୍ୟତଃ ଆନ୍ତଃଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଏବଂ ପ୍ରୋଟିନ୍ ସାନ୍ଦ୍ରତା ନିର୍ଣ୍ଣୟର ବ୍ୟାପକ ପରିମାଣାତ୍ମକ ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ହୁଏ। ଏହି ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ନମୁନାରେ ବାୟୋଫିଲ୍ମର ଘନତାରେ ପରିବର୍ତ୍ତନକୁ ସିଧାସଳଖ ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ ଏକ ପ୍ରୋବ୍-ଆଧାରିତ ବାୟୋସେନ୍ସର ବ୍ୟବହାର କରେ। ହସ୍ତକ୍ଷେପ ସ୍ପେକ୍ଟ୍ରମର ବିସ୍ଥାପନ ପରିବର୍ତ୍ତନଗୁଡ଼ିକୁ ଚିହ୍ନଟ କରି, ସେନ୍ସର ପୃଷ୍ଠରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା କରୁଥିବା ବାୟୋମୂଳକ ମଧ୍ୟରେ ବନ୍ଧନ ଏବଂ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ଚିହ୍ନଟ କରାଯାଏ, ଏବଂ ହସ୍ତକ୍ଷେପ ସ୍ପେକ୍ଟ୍ରମର ପ୍ରକୃତ-ସମୟ ବିସ୍ଥାପନ (nm) ପ୍ରଦର୍ଶିତ ହୁଏ।
ଚିତ୍ର ୪: aLDRG ଏବଂ ଚିଟିନୋଲିଗୋସାକାରାଇଡ୍ ମଧ୍ୟରେ ବାୟୋଲେୟର ଇଣ୍ଟରଫେରୋମେଟ୍ରି (BLI) ପରୀକ୍ଷା। (ସନ୍ଦର୍ଭ ଉତ୍ସ: ଲି, ବିଙ୍ଗ୍, ୨୦୨୩। ଆର୍ମିଲାରିଆ ପ୍ରଜାତି ୫୪୧ ର ରାଇଜୋମର୍ଫସ୍ ଏବଂ ହାଇଫା ମଧ୍ୟରେ ତୁଳନାତ୍ମକ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପ୍ଟୋମର ଚିହ୍ନ। ଲାଇସଏମ୍ ଡୋମେନ୍ ଉପରେ ଗୁରୁତ୍ୱ ଦେଇ ଫଙ୍ଗାଲ୍ ସିମ୍ବାଇସିସ୍ ରେ ଅଂଶଗ୍ରହଣ।)
BLI ଏବଂ SPR ପ୍ରଯୁକ୍ତିର ତୁଳନା
| ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ନାମ | BLI (ବାୟୋ-ଲେୟର ଇଣ୍ଟରଫେରୋମେଟ୍ରି) | SPR (ପୃଷ୍ଠ ପ୍ଲାଜମନ୍ ରେଜୋନାନ୍ସ) |
|---|---|---|
| ନୀତି | ସେନ୍ସର ପୃଷ୍ଠରେ ପ୍ରତିଫଳିତ ଆଲୋକର ହସ୍ତକ୍ଷେପ ଢାଞ୍ଚାରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ ମାପ କରେ, ଜୈବ-ସ୍ତରରେ ଅପ୍ଟିକାଲ୍ ଘନତାରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ ମାଧ୍ୟମରେ ଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଚିହ୍ନଟ କରେ। ଏହା ଏକ ବାସ୍ତବ-ସମୟ ବନ୍ଧନ କର୍ଭ (ପ୍ରତ୍ୟକ୍ଷ ମାପ) ପ୍ରଦାନ କରେ। | ସେନ୍ସର ଚିପ୍ ପୃଷ୍ଠ ନିକଟରେ ପ୍ରତିସରଣ ସୂଚକାଙ୍କରେ ସଙ୍କେତ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଚିହ୍ନଟ କରି ଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ମାପ କରେ (ଯେତେବେଳେ ଆଲୋକ ସୁନା ଏବଂ କାଚ ଇଣ୍ଟରଫେସ୍ ସହିତ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା କରେ, ପ୍ରତିସରଣ ସୂଚକାଙ୍କରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଘଟେ)। ତଥ୍ୟ ଅନୁବାଦ କୋଣରେ ପରିବର୍ତ୍ତନ ଭାବରେ ପ୍ରତିଫଳିତ ହୁଏ (ପରୋକ୍ଷ ମାପ)। |
| ନିର୍ମାତା | ସାର୍ଟୋରିଅସ୍ | ଜିଇ |
| ବାଦ୍ୟଯନ୍ତ୍ର | ଫୋର୍ଟବାୟୋ ବାୟୋସେନ୍ସରଗୁଡ଼ିକ | SPR ଉପକରଣ ଖୋଲନ୍ତୁ |
| ସିଷ୍ଟମ୍ | ଫୋର୍ଟବାୟୋ ଅକ୍ଟେଟ୍ ସିଷ୍ଟମ୍ (ଆଣବିକ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ) | ଟ୍ରେସଡ୍ରୟର (ରିଜଭ୍ୟୁ ଇନଷ୍ଟ୍ରୁମେଣ୍ଟସ୍, ସ୍ୱିଡେନ ଦ୍ୱାରା ବିକଶିତ) |
| ଲାଭ | 1. ବ୍ୟାପକ ନମୁନା ସୁସଙ୍ଗତତା, ଉତ୍କୃଷ୍ଟ ସ୍ଥିରତା, ବିଶେଷକରି ଛୋଟ ଅଣୁ ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ (ନମୁନା ଶୁଦ୍ଧତା ଏବଂ ବଫର ଅବସ୍ଥା ପାଇଁ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଆବଶ୍ୟକତା କମ୍ କଠୋର)। SSA ଚିପ୍ସ ବାଇଣ୍ଡିଂ ଅଧ୍ୟୟନ ପାଇଁ ମୂଲ୍ୟ-ପ୍ରଭାବଶାଳୀ। 2. SPR ତୁଳନାରେ ଦ୍ରୁତ ଥ୍ରୁପୁଟ୍ ଏବଂ କମ୍ ପରୀକ୍ଷଣ ସମୟ। | 1. ଦୀର୍ଘ ବିକାଶ ଇତିହାସ, BLI ତୁଳନାରେ ଅଧିକ ସମ୍ବେଦନଶୀଳତା ପ୍ରଦାନ କରେ। 2. ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ପ୍ରୟୋଗ ପାଇଁ ଅଧିକ ସଠିକତା ଏବଂ ଦୃଢ଼ତା, ଯେପରିକି ଅଧିକ ଆକର୍ଷକତା ଏବଂ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟତା ତଥ୍ୟ ସହିତ ବିରଳ କିମ୍ବା ମୂଲ୍ୟବାନ ପ୍ରୋଟିନ ଚିହ୍ନଟ କରିବା। |
| ଅସୁବିଧାଗୁଡ଼ିକ | 1. SPR ତୁଳନାରେ ତଥ୍ୟ ସଠିକତା ସାମାନ୍ୟ କମ୍। ୨. ଉପକରଣର ସତର୍କ ରକ୍ଷଣାବେକ୍ଷଣ ଆବଶ୍ୟକ। 3. SSA ଚିପ୍ ମୂଲ୍ୟ ତୁଳନାତ୍ମକ ଭାବରେ ଅଧିକ। | 1. ଅତି କ୍ଷୁଦ୍ର ଅଣୁ ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ ବଫର ଅବସ୍ଥା କଷ୍ଟକର ହୋଇପାରେ, ଯାହା ଚିହ୍ନଟ ବିଫଳତାର ବିପଦକୁ ବୃଦ୍ଧି କରିପାରେ। ୨. ସାଧାରଣତଃ BLI ରେ ବ୍ୟବହୃତ ଚିପ୍ସ ଅପେକ୍ଷା ଅଧିକ ମହଙ୍ଗା ହୋଇଥାଏ। 3. ବିସ୍ତାରିତ ପରୀକ୍ଷଣ ସମୟରେ ନମୁନା ବାଷ୍ପୀଭବନ ଏକ ସମସ୍ୟା ହୋଇପାରେ। |
| ଚିପ୍ ପ୍ରକାର | SSA ଚିପ୍ | NTA ଚିପ୍ |
ଆଫିନିଟି ମାପର ପରିସର
ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟରେ ଆଣ୍ଟିଜେନ-ଆଣ୍ଟିବଡି (ଶକ୍ତିଶାଳୀ ଆଣ୍ଟିଜେନ-ଆଣ୍ଟିବଡି, ଦୁର୍ବଳ ଆଣ୍ଟିଜେନ-ଆଣ୍ଟିବଡି), ପ୍ରୋଟିନ-ପ୍ରୋଟିନ, ପ୍ରୋଟିନ-ପେପ୍ଟାଇଡ, ପ୍ରୋଟିନ-କ୍ଷୁଦ୍ର ଅଣୁ, ଏବଂ ପ୍ରୋଟିନ DNA/RNA (ଆପ୍ଟାମର) ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ ହୋଇପାରେ। KD ମାପ କରିବା ସମୟରେ, ମୋଲାର ସାନ୍ଦ୍ରତା ମଧ୍ୟରୁ ଗୋଟିଏ ଜାଣିବା ଆବଶ୍ୟକ। ଯେତେବେଳେ ଛୋଟ ଅଣୁ ବାନ୍ଧିଥାଏ, ଗୋଟିଏ ଆଣବିକ ଓଜନ 150 ଡାଲଟନରୁ କମ୍ ହୋଇପାରିବ ନାହିଁ।
| ପ୍ରକାର | ପରିସର | ସତର୍କତା |
|---|---|---|
| ୧. ଆଣ୍ଟିଜେନ୍-ଆଣ୍ଟିବଡି | ୧୦^-୬ ରୁ ୧୦^-୧୨ | ଅଧିକାଂଶ ଆଣ୍ଟିବଡିର Kd ମୂଲ୍ୟ 10^-6-10^-7 ରୁ 10^-9 ମଧ୍ୟରେ ଥାଏ। ସାଧାରଣତଃ ଏହା ବିଶ୍ୱାସ କରାଯାଏ ଯେ ଉଚ୍ଚ-ଆଫିନିଟି ଆଣ୍ଟିବଡି 10^-9 ମଧ୍ୟରେ ଥାଏ, ଯେତେବେଳେ ଉଚ୍ଚ-ଆଫିନିଟି। ଆଣ୍ଟିବଡି 10^-12 ମଧ୍ୟରେ ଥାଏ। |
| ୨. ପ୍ରୋଟିନ - ଛୋଟ ଅଣୁ | ୧୦^-୪ ରୁ ୧୦^-୫ | ଛୋଟ ଅଣୁ ଏବଂ ପ୍ରୋଟିନର KD 10^-4 ଏବଂ 10^-5 ମଧ୍ୟରେ ଥାଏ, ଯେତେବେଳେ 10^-3 ଏବଂ 10^-7 ସାଧାରଣ ଏବଂ 10^-10 ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ପହଞ୍ଚିପାରେ ନାହିଁ। ସହସଂଯୋଜିତ ଛୋଟ ଅଣୁ 10^-10 ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ପହଞ୍ଚିପାରେ। |
| ୩. ଆଭିଡିନ୍-ବାୟୋଟିନ୍ | ୧୦^-୧୪ | ଆଫିନିଟି ସହଜରେ ଅଣ-ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ବାଇଣ୍ଡିଂ ଦେଇପାରେ, ଏବଂ ଷ୍ଟ୍ରେପ୍ଟାଭିଡିନ୍ କିମ୍ବା ଡିଗ୍ଲାଇକୋସିଲେଟେଡ୍ ଆଫିନିଟି ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇପାରିବ। |
| ୪. ଡିଏନଏ-ପ୍ରୋଟିନ୍ | ୧୦^-୮ ରୁ ୧୦^-୧୦ | ଉଚ୍ଚମାନର ଏବଂ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଡିଏନଏ; ଇଲେକ୍ଟ୍ରୋଫୋରେସିସର ପ୍ରଭାବକୁ ରୋକିବା ପାଇଁ ସତର୍କ ରୁହନ୍ତୁ। |
ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ପାଇଁ ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା
| ନମୁନା | ଆବଶ୍ୟକତାଗୁଡ଼ିକ |
|---|---|
| 1. ବଡ଼ ଅଣୁ ନମୁନା | ପ୍ରୋଟିନ > 50 µg, ଆଣ୍ଟିବଡି > 100 µg, ବାୟୋଟିନାଇଲେଟେଡ ପ୍ରୋଟିନ > 200 µg; ବାୟୋଟିନ ବିନା ପ୍ରୋଟିନ > 2 ମିଗ୍ରା, ଶୁଦ୍ଧତା ଆବଶ୍ୟକତା > 90%, ବଫର ଦ୍ରବଣ: PBS, HEPBS। ଇମିଡାଜୋଲ ଗୋଷ୍ଠୀ ରହିପାରିବ ନାହିଁ; ଗୁଣବତ୍ତା ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ଆବଶ୍ୟକ। |
| 2. ଛୋଟ ଅଣୁ ନମୁନା | ପରିମାଣ> 1mg, ପାଉଡର କିମ୍ବା ତରଳ, ତରଳ ପାଣି କିମ୍ବା DMSO ରେ ଦ୍ରବୀଭୂତ ହେବା ଆବଶ୍ୟକ। ଗ୍ଲିସେରଲ୍, ଇମିଡାଜୋଲ୍, ଟ୍ରେହାଲୋଜ୍ କିମ୍ବା ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ଲବଣ ନ ରଖିବାକୁ ଚେଷ୍ଟା କରନ୍ତୁ; ଜୈବିକ ପ୍ରତିକାରକ ବିନା ବଫରରେ Tris ପରି ଆମିନୋ ଗୋଷ୍ଠୀ ସହିତ ସାଧାରଣତଃ PBS, HEPPS, ଇତ୍ୟାଦି ସହିତ ପ୍ରତିକାରକ ଏଡାଇବାକୁ ଚେଷ୍ଟା କରନ୍ତୁ। |
ଏକାଧିକ ନମୁନା ବିଶ୍ଳେଷଣ
ଆଲଫା ଲାଇଫଟେକ୍ ଆଣ୍ଟିବଡି, କୋଷ, ପ୍ରୋଟିନ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ଜୈବ ଅଣୁ ସମେତ ବିଭିନ୍ନ ନମୁନା ପାଇଁ ଆଫିନିଟି ପରୀକ୍ଷା ପ୍ରଦାନ କରିପାରିବ।
ପରିପକ୍ୱ ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ପ୍ଲାଟଫର୍ମ
ଆମ ପାଖରେ ସ୍ପ୍ର ବାଇଣ୍ଡିଂ ପର୍ସେ, ବିଏଲଆଇ ବାଇଣ୍ଡିଂ ପର୍ସେ, ଏବଂ ଏଲିସା ବାଇଣ୍ଡିଂ ପର୍ସେ ଭଳି ଉନ୍ନତ ପ୍ରଯୁକ୍ତିବିଦ୍ୟା ଅଛି।
ନମନୀୟ ପ୍ରକଳ୍ପ ଚୟନ
ଗ୍ରାହକମାନେ ଦ୍ରୁତ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ଏବଂ ସଠିକ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ମଧ୍ୟରୁ ଗୋଟିଏ ବାଛିପାରିବେ।
ଉଚ୍ଚ-ସଠିକତା ଫଳାଫଳ
ଆମର ବୃତ୍ତିଗତ ବୈଷୟିକ ଦଳ ଦକ୍ଷ, ସଠିକ୍ ଏବଂ ନିର୍ଭରଯୋଗ୍ୟ ଆଫିନିଟି ନିର୍ଣ୍ଣୟ ଫଳାଫଳ ସୁନିଶ୍ଚିତ କରିପାରିବେ।
କେସ୍ ଷ୍ଟଡିମାମଲା
BLI ଦ୍ରୁତ ଆଫିନିଟି ପରୀକ୍ଷା ଆଣ୍ଟିବଡି ଏବଂ ଆପ୍ଟାମର ଆଫିନିଟି ପରୀକ୍ଷା
SA ପ୍ରୋବ୍ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟତା ସହିତ ବାୟୋଟିନାଇଲେଟେଡ୍ ଆପ୍ଟାମର୍ କ୍ୟାପଚର କରନ୍ତୁ ଏବଂ ସେଗୁଡ଼ିକୁ ଦ୍ରବୀଭୂତ କରନ୍ତୁ। ନମୁନାକୁ ଏକ ସ୍ଥିର ସାନ୍ଦ୍ରତା ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ଦ୍ରବୀଭୂତ କରନ୍ତୁ ଏବଂ ଡିଲୁଅ କରନ୍ତୁ, ପ୍ରୋବ୍-ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ କ୍ୟାପଚର ହୋଇଥିବା ଟାର୍ଗେଟ 1-5 ଆପ୍ଟାମର୍ କୁ ଘନୀଭୂତ କରନ୍ତୁ, ଏବଂ ସିଗନାଲ ସାଚୁରେସନ୍ ପରେ, ନମୁନା ସହିତ ବାନ୍ଧି ଦିଅନ୍ତୁ। ତା'ପରେ ସେଗୁଡ଼ିକୁ ଏକ 96-କୂପ ପ୍ଲେଟରେ ଯୋଡନ୍ତୁ।
ଚିତ୍ର 5: 96-କୂପ ପ୍ଲେଟ୍ ନମୁନା ପାଇଁ ଚିହ୍ନଟ ସ୍ଥାନର ବଣ୍ଟନ। B ସେନ୍ସରଗୁଡ଼ିକର ସନ୍ତୁଳନ ଏବଂ ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ବଫରକୁ ବୁଝାଏ। L: ବାୟୋଟିନ୍ ଟାର୍ଗେଟ 1-5 ଆପ୍ଟାମର୍, 221: ନମୁନା।
ତଥ୍ୟର ସ୍ଥିରତା ଏବଂ ସଠିକତା ସୁନିଶ୍ଚିତ କରିବା ପାଇଁ ଡ୍ରିଲିଂ ପ୍ରତି ଧ୍ୟାନ ଦିଅନ୍ତୁ, ଏବଂ ଫଳାଫଳ ପାଇବା ପାଇଁ ଅନୁରୂପ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ରମ ସେଟ୍ କରନ୍ତୁ:
ଚିତ୍ର 6: ଟାର୍ଗେଟ 1, 2, ଏବଂ 3 ଆପ୍ଟାମର୍ ଏବଂ ନମୁନା ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଫିଟିଂ ଚିତ୍ର। (CH 1 \ 3 \ 5 ଦୃଢ଼ ହୋଇଥିବା ଟାର୍ଗେଟ 1 \ 2 \ 3 ଆପ୍ଟାମର୍ ପ୍ରୋବ୍ ଏବଂ ନମୁନା ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାର ସଙ୍କେତ ଏବଂ ତଥ୍ୟକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ।)
ଚିତ୍ର ୭: ଟାର୍ଗେଟ ୪ ଏବଂ ୫ ଆପ୍ଟାମର୍ ଏବଂ ନମୁନା ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ଫିଟିଂ ଚିତ୍ର। (CH ୧ \ ୩ କଠିନ ହୋଇଥିବା ଟାର୍ଗେଟ ୪ \ ୫ ଆପ୍ଟାମର୍ ପ୍ରୋବ୍ ଏବଂ ନମୁନା ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାର ସଙ୍କେତ ଏବଂ ତଥ୍ୟକୁ ପ୍ରତିନିଧିତ୍ୱ କରେ।)
ଫଳାଫଳ ଦେଖାଉଛି
ନିମ୍ନଲିଖିତ ଫଳାଫଳଗୁଡ଼ିକ ପ୍ରାପ୍ତ ହୋଇଥିଲା: ଫିଟିଂ ପରେ ନମୁନା ସହିତ ଟାର୍ଗେଟ 1 ଆଡାପ୍ଟରର ସମ୍ପର୍କ ଥିଲା 9.41 ^ -8; ଫିଟିଂ ପରେ ନମୁନା ସହିତ ଟାର୍ଗେଟ 2 ଆଡାପ୍ଟରର ସମ୍ପର୍କ ହେଉଛି 8.32 ^ -8; ଫିଟିଂ ପରେ ନମୁନା ସହିତ ଟାର୍ଗେଟ 3 ଆଡାପ୍ଟରର ସମ୍ପର୍କ ହେଉଛି 8.64 ^ -8; ଫିଟିଂ ପରେ ନମୁନା ସହିତ ଟାର୍ଗେଟ 4 ଆଡାପ୍ଟରର ସମ୍ପର୍କ ହେଉଛି 3.70 ^ -8; ଫିଟିଂ ପରେ ନମୁନା ସହିତ ଟାର୍ଗେଟ 5 ଆଡାପ୍ଟରର ସମ୍ପର୍କ ହେଉଛି 3.01 ^ -8।
ଯଦି ଆପଣଙ୍କର କୌଣସି ପ୍ରଶ୍ନ ଅଛି, ଦୟାକରି ଯେକୌଣସି ସମୟରେ ଆମ ସହିତ ଯୋଗାଯୋଗ କରିବାକୁ ମୁକ୍ତ ମନେ କରନ୍ତୁ।
Leave Your Message
୨୦୧୮-୦୭-୧୬ 
୦୧୦୨