Платформа разработки аптамеров
Аптамеры представляют собой одноцепочечные олигонуклеотиды (ДНК, РНК или КсНА), обладающие высокой аффинностью и высокой специфичностью, которые специфически связываются с целевыми молекулами, такими как антитела, и широко используются для разработки биосенсоров, диагностических и терапевтических средств.
Платформа аптамеров, предоставляемая Alpha Lifetech, включает две категории: платформу синтеза аптамеров, которая в основном включает сервис синтеза библиотеки аптамеров SELEX и сервис разработки аптамеров (ДНК, РНК или КсНА), и платформу скрининга аптамеров, включающую сервисы скрининга на основе технологии SELEX для белков, пептидов, клеток, малых молекул, ионов металлов и других целевых молекул, а также сервисы анализа последующей оптимизации и идентификации аптамеров.
Платформа синтеза аптамеров
Служба синтеза библиотеки аптамеров SELEX
Сервис синтеза библиотеки аптамеров SELEX в основном заключается в создании библиотеки, содержащей большое количество случайных одноцепочечных олигонуклеотидных последовательностей, методом химического синтеза in vitro в соответствии с целевыми молекулами. Создание библиотеки является отправной точкой технологии SELEX, которая обеспечивает обширный выбор последовательностей-кандидатов для последующего скрининга за счет создания больших случайных библиотек и повышает вероятность скрининга высокоаффинных аптамеров.
Синтез библиотеки в основном делится на следующие этапы:
| Шаги | Подробности технологии |
|---|---|
| Определить целевые молекулы | Определить целевые молекулы, которые необходимо проверить на наличие аптамеров. Это могут быть белки, нуклеиновые кислоты, малые молекулы, ионы металлов и т. д. |
| Дизайн случайной последовательности | Длина случайной последовательности, состав оснований и другие параметры были разработаны в соответствии с характеристиками целевых молекул и требованиями скрининга. Обычно длина случайных последовательностей составляет от десятков до сотен оснований. |
| Синтез фиксированных последовательностей | Проектируются и синтезируются олигонуклеотидные фрагменты с фиксированными последовательностями (например, последовательностями ПЦР-праймеров) на обоих концах, которые будут использоваться в последующем процессе амплификации и скрининга. |
Синтезированная библиотека ещё требует дальнейшей обработки для контроля качества. Концентрация библиотеки была определена для обеспечения её применимости в последующем процессе скрининга. Разнообразие и точность случайных последовательностей в библиотеке были проверены секвенированием и другими методами, чтобы гарантировать соответствие качества библиотеки требованиям скрининга.
С помощью вышеописанных шагов можно синтезировать высококачественную и разнообразную библиотеку аптамеров SELEX, которая может предоставить обширные кандидатные последовательности для последующего процесса скрининга.
Услуги по разработке аптамеров (ДНК, РНК или КсНА)
Аптамерами обычно называют аптамеры нуклеиновых кислот. К аптамерам нуклеиновых кислот относятся ДНК-аптамеры, РНК-аптамеры и ксенон-аптамеры (XNA-аптамеры), представляющие собой химически модифицированные аптамеры нуклеиновых кислот. Метод SELEX широко применяется для разработки аптамеров. Основной рабочий процесс разработки аптамеров включает создание библиотеки, связывание с мишенью, выделение и очистку, амплификацию, несколько раундов скрининга и идентификацию последовательностей. На протяжении многих лет мы специализируемся на создании библиотек и обладаем богатым опытом в разработке аптамеров. Мы стремимся предоставлять клиентам услуги высочайшего качества.
Технологический процесс SELEX
Процесс SELEX состоит из нескольких раундов, каждый из которых включает следующие ключевые этапы:
Привязка библиотеки и цели
Сконструированная библиотека нуклеиновых кислот смешивается со специфическими целевыми молекулами (такими как белки, низкомолекулярные соединения и т. д.), так что последовательности нуклеиновых кислот в библиотеке имеют возможность связываться с целевыми молекулами.
Выделение несвязанных молекул
Последовательности нуклеиновых кислот, не связанные с целевой молекулой, отделяются от смеси с помощью специальных методов, таких как аффинная хроматография, разделение на магнитных частицах и т. д.
Усиление связывающих молекул
Последовательность нуклеиновой кислоты, связанная с целевой молекулой, амплифицируется, обычно с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР). Для последующего этапа скрининга амплифицированные последовательности используются в качестве исходной библиотеки.

Рис. 1: Процесс скрининга SELEX
Платформа скрининга аптамеров
Служба скрининга аптамеров
Alpha Lifetech предлагает широкий спектр специализированных услуг по скринингу аптамеров с применением различных методик SELEX для разных типов молекул:
| Типы целей | Технические детали |
|---|---|
| Скрининг белковых аптамеров с помощью SELEX | Основная цель скрининга белковых аптамеров — поиск аптамеров, способных специфически связываться с целевыми молекулами белков. Такие аптамеры проще синтезировать, они более стабильны и менее подвержены влиянию факторов окружающей среды. |
| Скрининг пептидных аптамеров с помощью SELEX | Пептидные аптамеры представляют собой класс коротких пептидных последовательностей с высокой специфичностью и сродством, которые способны специфически связываться с целевыми веществами и обладают широким спектром применения в биомедицинской области. С помощью специального процесса скрининга пептидные аптамеры, способные специфически связываться с целевыми молекулами, отбираются из большого количества библиотек случайных пептидных последовательностей. |
| Скрининг клеточно-специфических аптамеров (Cell-SELEX) | В качестве мишеней используются клетки-мишени или специфические молекулы на поверхности клеток. Мишенями могут быть целые клетки, рецепторы на клеточной мембране, белки или другие малые молекулы. |
| Скрининг аптамеров малых молекул с помощью Capture SELEX | Capture SELEX — это метод скрининга in vitro для скрининга аптамеров малых молекул, являющийся вариантом SELEX. Capture SELEX особенно хорошо подходит для скрининга аптамеров малых молекул-мишеней, которые обычно имеют меньше функциональных групп и которые трудно иммобилизовать непосредственно на твердофазных носителях. |
| Услуги SELEX на основе живых животных | Скрининг на живых животных — это экспериментальный метод, широко применяемый в области биологических наук, медицины и биотехнологий, при котором живые животные используются в качестве экспериментальных моделей для скрининга и оценки конкретных молекул, лекарственных препаратов, терапевтических средств или биологических процессов. Эти услуги предназначены для моделирования физиологической среды в организме человека для более точного прогнозирования и оценки эффективности и безопасности результатов экспериментальных исследований. |
Служба оптимизации Aptamer
Гидрофильность, высокая потеря аффинности в процессе производства и быстрое выведение аптамеров ограничивают их применение. В настоящее время изучается ряд методов оптимизации для повышения эффективности аптамеров.
У нас также есть множество способов оптимизации аптамера, включающих усечение, модификации, конъюгацию с соответствующей группой (тиол, карбокси, амин, флуорофор и т. д.).
Служба анализа характеристик аптамеров
Услуги по анализу характеристик аптамеров включают в себя профессиональную оценку эффективности, определение структуры и функциональную верификацию полученного аптамера для обеспечения его соответствия требованиям к специфической связывающей способности, стабильности и специфичности. В основном, услуги включают анализ аффинности и специфичности, оценку стабильности и проверку биологической функции.
Если у вас возникнут какие-либо вопросы, обращайтесь к нам в любое время.
Leave Your Message
0102




2018-07-16 

