Платформа синтеза аптамеров

В зависимости от цели аптамеры нуклеиновых кислот включают ДНК-аптамеры, РНК-аптамеры, белковые аптамеры и аптамеры клеточных мембран.

СВЯЗАТЬСЯ С НАМИ

Платформа синтеза аптамеров

Введение в аптамеры нуклеиновых кислот

Аптамеры нуклеиновых кислот, также известные как аптамеры, комплексы и химические антитела, получаются с помощью скрининга in vitro selex с помощью техники эволюции системы экспоненциального обогащения лигандов (SELEX). Это одноцепочечная дезоксирибонуклеиновая кислота (ssDNA) или рибонуклеиновая кислота (РНК), которая специфически и эффективно связывается с целевой молекулой и обычно состоит из 20-80 оснований.

Аптамеры нуклеиновых кислот, полученные с помощью скрининга in vitro, структурно стабильны, просты в синтезе и модификации и превосходят обычно используемые биологически полученные антитела с точки зрения синтеза и применения; кроме того, аптамеры нуклеиновых кислот могут специфически связываться со своими мишенями посредством различных сил, в целом они взаимодействуют с малыми молекулами на основе широкого спектра конформаций (например, шпильки, вогнуто-выпуклые, псевдоскрученные и т. д.) посредством водородных связей, электростатических сил, гидрофобных взаимодействий и т. д. молекул. В зависимости от мишени аптамеры нуклеиновых кислот включают ДНК-аптамеры, РНК-аптамеры, белковые аптамеры и аптамеры клеточных мембран.

Платформа синтеза аптамеров Alpha Lifetech, которая в основном включает в себя службу синтеза библиотеки аптамеров SELEX и службу разработки аптамеров (ДНК, РНК или КсНА), а также службы последующего скрининга аптамеров, оптимизации аптамеров и анализа идентификации аптамеров.

Технический процесс синтеза аптамеров

Основной принцип и технологический процесс

Процесс технологии синтеза аптамеров нуклеиновых кислот заключается в том, что библиотека одноцепочечных олигонуклеотидов химически синтезируется in vitro, смешивается с целевым веществом, и в смеси присутствует комплекс целевого вещества и нуклеиновой кислоты, нуклеиновая кислота, которая не связывается с целевым веществом, вымывается, а молекулы нуклеиновой кислоты, которые связываются с целевым веществом, изолируются, и молекулы нуклеиновой кислоты используются в качестве шаблонов для выполнения ПЦР-амплификации для следующего раунда скрининга. Благодаря повторному скринингу и амплификации selex некоторые молекулы ДНК или РНК, которые не связываются с целевым веществом или имеют низкое или умеренное сродство к целевому веществу, будут вымыты, и аптамеры, т. е. ДНК или РНК с высоким сродством к целевому веществу, будут отделены от очень большой случайной библиотеки, и их чистота увеличится с процессом SELEX, и в конечном итоге они займут большую часть библиотеки.

Ключевые моменты технического процесса

Процесс селекс-скрининга аптамеров нуклеиновых кислот начинается со сборки химически синтезированных случайных олигонуклеотидных библиотек. Случайные олигонуклеотидные библиотеки имеют большую емкость библиотеки. Высокое разнообразие является ее существенным преимуществом. Теоретически, если случайная последовательность в олигонуклеотиде состоит из n оснований, емкость библиотеки составляет 4n. Если мы рассмотрим библиотеку искусственных модификаций, это увеличит разнообразие случайных последовательностей. В настоящее время длина случайных последовательностей олигонуклеотидов, обычно используемых в экспериментах SELEX, обычно составляет 30 оснований, а емкость библиотеки может достигать 10^18. Емкость библиотеки имеет решающее значение для селекс-скрининга высокоаффинных лигандов. Однако, поскольку концентрация синтетических библиотек определена, слишком длинные случайные последовательности уменьшат распространенность каждого олигонуклеотида в библиотеках, что снизит вероятность селекс-скрининга для конкретного аптамера. Как правило, емкость библиотеки 10^13~10^15 в первом раунде селекс-скрининга может удовлетворить практические потребности.

Рис.1 Технический процесс SELEX

Преимущества аптамера нуклеиновых кислот

Преимущества	Подробности
Прямой	Избегание традиционного процесса экспериментов на животных и прямой отбор из библиотек in vitro; селекшн-скрининг аптамеров целевых молекул, которые являются неиммуногенными, слабоиммуногенными или даже токсичными.
Широкий спектр применения	Целевыми молекулами могут быть органические красители, аминокислоты, белки, антибиотики, пептиды, витамины, лекарственные препараты, даже клетки, патогены, вирусы, ткани и т. д.
Сильное сродство	Аптамеры демонстрируют высокую специфичность и сродство к скринингу целевых молекул in vitro.
Стабильность	Аптамеры имеют небольшой размер, их легко получить, их можно воспроизводить в синтезе, а их стабильность может быть повышена путем химического синтеза и модификации. Аптамеры химически стабильны, имеют длительный срок хранения и могут транспортироваться при комнатной температуре.

// Применение аптамеров нуклеиновых кислот //

01/

Клиническая медицина: таргетная терапия опухолей, методы диагностики рака

Кредитные отчеты Gladtrust успешно формируются на основе крупнейшей в мире онлайн-базы данных о кредитоспособности предприятий - CreditVision.
База данных своевременно собирает и динамически обновляет информацию из более чем 200 000 источников данных. Процесс обновления и управления информацией может гарантировать ее точность.

02/

Область аналитических испытаний: обнаружение органических загрязнителей, обнаружение низкомолекулярных лекарственных препаратов, обнаружение пищевых патогенов

В этой области технология синтеза аптамеров нуклеиновых кислот будет использоваться совместно с иммунохроматографией с коллоидным золотом, в которой сначала будет подготовлено коллоидное золото и определено его качество, а затем оно будет соединено с аптамером нуклеиновой кислоты, охарактеризовано и распылено на связывающую подложку, а тест-полоски будут подготовлены с использованием поликлонального антитела, подлежащего обнаружению, в качестве линии обнаружения и комплементарной последовательности аптамера нуклеиновой кислоты в качестве линии контроля качества, чтобы проанализировать наличие целевого вещества на основе результатов отрицательных и положительных экспериментов.

03/

Биологическая область: разработка биосенсоров

Сенсоры на основе аптамеров нуклеиновых кислот используют аптамер в качестве элемента распознавания для распознавания целевого вещества и преобразования результата распознавания в сигнал, который может быть измерен. Преобразование сигнала может быть электрохимическим, оптическим, температурным, пьезоэлектрическим, магнитным и микромеханическим или комбинацией этих методов. По сравнению с существующими методами обнаружения сенсоры на основе аптамеров нуклеиновых кислот, как правило, просты в эксплуатации, специфичны, отзывчивы и чувствительны, и эти преимущества облегчают их применение в реальных образцах и имеют хорошие перспективы для развития.

Платформа синтеза аптамеров

Платформа синтеза аптамеров Alpha Lifetech включает в себя службу синтеза библиотеки аптамеров SELEX и службу разработки аптамеров.

Служба синтеза аптамеров SELEX

Услуга Alpha Lifetech по синтезу аптамеров SELEX включает в себя создание библиотеки аптамеров SELEX, оптимизацию SELEX и т. д. Целью Alpha Lifetech является получение аптамеров SELEX с высоким сродством и высокой специфичностью для клиентов посредством процесса скрининга in vitro.

Служба разработки аптамеров нуклеиновых кислот

Услуги по разработке аптамеров нуклеиновых кислот компании Alpha Lifetech в основном основаны на технологии SELEX для скрининга аптамеров SELEX, включая разработку ДНК-аптамеров, РНК-аптамеров и XNA-аптамеров, включая проектирование библиотеки, синтез олигонуклеотидов, создание и проверку библиотеки.

Вернуться на страницу платформы разработки Aptamer

Если у вас возникнут какие-либо вопросы, пожалуйста, обращайтесь к нам в любое время.