Leave Your Message
Новости| Кластеризация областей, определяющих комплементарность, может вызывать дисфункцию CAR-T-клеток

Новости

Новости| Кластеризация областей, определяющих комплементарность, может вызывать дисфункцию CAR-T-клеток

2025-01-09
Категории новостей
Избранные новости
рекомендуемая услуга
быстрые ссылки
В исследовании, опубликованном 13 августа 2023 года в журнале Nature Communications, группа исследователей выявила, что петля области определения комплементарности (CDR) в одноцепочечном вариабельном фрагменте (scFv) может приводить к агрегации CAR, что может привести к отказу химерного антигенного рецептора (CAR) - Т-клетки, гибели клетки и снижению реактивности опухолевых клеток к экспрессии целевого антигена, что приводит к антиген-независимой активации и потенциальному функциональному нарушению.

Предыстория и методологияФОН

Терапия CAR-T-клетками высокоэффективна для лечения рака крови, и в этой клеточной терапии дизайн CAR еще более важен. В этом исследовании внеклеточный домен рецептора интерлейкина-13 альфа 2 человека (IL13R альфа 2) был коэкспрессирован с биотинлигазой BirA с использованием системы экспрессии multiBac. После серии оптимизированной экспрессии рецепторного белка были проведены очистка и валидация белка. Синтетическая библиотека scFv человека использовалась для скрининга фагового дисплея, и соответствующие антитела scFv были отобраны для производства с помощью твердофазного скрининга и анализа связывания. Подходящие антитела были отобраны для конструирования и упаковки лентивирусного вектора с помощью анализов SPR и ELISA. Исследователи далее трансдуцировали и культивировали Т-клетки, а затем исследовали CAR в этих клетках с помощью конфокальной микроскопии. Распределение сверху. Для анализа поведения клеток CAR-T исследователи оценили связывание клеток CAR-T с рекомбинантным IL13R α 2, окрашенными маркерами поверхности Т-клеток и изучили экспрессию CAR на поверхности и внутри клеток. Кроме того, они также исследовали пролиферацию клеток CAR-T и секрецию цитокинов, а также проанализировали экспрессию генов в различных конструкциях CAR-T, подчеркивая их различия. Эксперименты in vivo включают имплантацию опухолевых клеток in situ мышам с последующей терапией CAR-T и мониторингом роста опухоли с помощью систем визуализации in vivo (IVIS). Проведите статистический анализ с использованием GraphPad Prism и стандартных маркеров значимости.

ЗаключениеЗАКЛЮЧЕНИЕ

В текущем исследовании исследователи оценили структуру конструкции CAR, ее внеклеточный scFv, линкер и дополнительные домены, чтобы понять их влияние на производительность CAR-T-клеток. Было установлено, что петля CDR в scFv отвечает за распознавание антигена, а определенные каркасы в scFv могут непреднамеренно активировать сигнализацию CAR, потенциально нарушая функцию Т-клеток. Взаимодействия в петле CDR могут дополнительно влиять на стабильность CAR. Небольшие различия в петле CDR могут значительно изменить эффективность CAR-T-клеток, и был предложен новый метод быстрого скрининга поведения CAR.

Подробное введение в содержание

Введение в CAR-T

Ключ к терапии CAR T-клеток (терапия химерными антигенными рецепторами T-клеток) заключается в том, чтобы помочь координировать иммунный ответ T-клеток, модифицировать T-клетки, вставлять гены CAR и экспрессировать их на поверхности T-клеток в качестве белков химерных антигенных рецепторов CAR. CAR может напрямую распознавать антигены на поверхности раковых клеток, тем самым достигая определенного терапевтического метода для идентификации и уничтожения раковых клеток в собственном организме пациента. С 2017 года FDA одобрило шесть методов терапии CAR-T-клеток для лечения рака крови, такого как лимфома. Однако все еще существуют трудности в лечении солидных опухолей, поскольку окружающие медиаторы могут помешать CAR распознавать антигены на поверхности опухоли. Кроме того, солидные опухоли обладают гетерогенностью, что затрудняет достижение терапевтических эффектов из-за различий в одном и том же типе рака в организме.
CAR-T
Рис. 1: Одобренные FDA CAR-T-терапии. Источник рисунка:CAR-T-клетки.

Введение вантитело scFv

scFv — небольшой фрагмент антитела, состоящий из тяжелой цепи (VH) и легкой цепи (VL), соединенных коротким гибким пептидом, размером около 25 кДа, и является наиболее часто используемым типом рекомбинантного антитела. scFv имеет небольшой размер, специфичен, может быть получен в больших масштабах в прокариотической системе экспрессии и имеет неповрежденный антигенсвязывающий сайт, что широко используется в диагностике и лечении заболеваний.
антитело scFv-Alpha Lifetech
Рис. 2: антитело scFv

Введение в CDR

Области определения комплементарности (CDR) — это пептидные фрагменты вариабельных областей антител, которые могут связываться с антигенами через CDR, также известные как сайты связывания антигенов. Молекула антитела содержит два рецептора антигенов, а один рецептор антигенов содержит шесть CDR. CDR отражают активность связывания антигенов с антителами.

Технология, которая используется

Система экспрессии насекомых

Система экспрессии клеток насекомых бакуловируса стала одной из наиболее широко используемых систем для рутинного производства рекомбинантных белков. Система клеток насекомых бакуловируса успешно экспрессировала рецепторы, сопряженные с G-белком (GPCR), производила VLP и производила векторы инфекционного гонадального ассоциированного вируса (AAV) типа 2. Ярким примером применения этой технологии является разработка вакцин на основе VLP ВПЧ. Клинические испытания показали, что VLP, состоящие из структурных белков L1 ВПЧ 16/18, произведенных в клетках насекомых, инфицированных палочковидными вирусами, могут эффективно предотвращать инфекции шейки матки ВПЧ-16 и ВПЧ-18, а также связанные с ними клеточные аномалии и поражения.
система экспрессии насекомых
Рис 3: Производственный процесс. Источник рисунка:Бакуловирусы как универсальные векторы для экспрессии белков в клетках насекомых и млекопитающих.

Технология фагового дисплея

Технология фагового дисплея родилась в 1985 году, когда Джордж Смит сообщил, что чужеродный пептид может быть отображен на поверхности нитевидного бактериофага. Вставляя чужеродную ДНК в геном фагов, белки слияния отображаются на поверхности фагов. Этот метод стал эффективным методом для получения больших количеств пептидов, белков и антител, позволяя создавать библиотеки, содержащие до 10^10 различных вариантов, и может использоваться для аффинного скрининга пептидных библиотек для изучения взаимодействий лигандов белков, участков связывания антигенов и антител, а также для получения антител scFv, антител Fab, нанотел.
Технология отображения фагов - Alpha Lifetech
Рис. 4: Технология фагового дисплея

Библиотека синтезированных человеческих антител scFv

Синтетическая библиотека антител, также известная как библиотека de novo, представляет собой синтетический метод, который использует такие методы, как синтез ДНК или фаговый дисплей, для проектирования и синтеза полных вариабельных областей антител, включая каркасные области и CDR, не полагаясь на естественные библиотеки антител. Синтезируйте синтетические ДНК, кодирующие последовательности антител, включая каркасные области и CDR, с помощью химических или ферментативных методов. Синтезированные фрагменты ДНК собираются в векторы экспрессии антител с использованием таких методов, как ПЦР, а затем вводятся в системы экспрессии, такие как бактерии, дрожжи или клетки млекопитающих, для производства антител. Высокопроизводительные методы скрининга могут использоваться для скрининга антител с желаемыми характеристиками в библиотеках антител, включая технологии фагового дисплея, дрожжевого дисплея или рибосомного дисплея. Синтетическая библиотека антител имеет следующие преимущества: (1) увеличивается случайность библиотеки, а емкость библиотеки велика; (2) некоторые сложные антитела можно скринировать без иммунизации животных; (3) по сравнению с наивными библиотеками антител дизайн синтетических библиотек антител разнообразен.

Измерение сродства SPR

Поверхностный плазмонный резонанс (SPR) можно использовать для анализа аффинности связывания и кинетических параметров между лигандами и аналитами. Измерение SPR основано на изменениях показателя преломления вблизи поверхности сенсора, где аналит непрерывно течет и измеряется вдоль поверхности сенсора. SPR используется для определения относительной аффинности белок-белковых взаимодействий, такой как аффинность антител к целевым антигенам. SPR можно применять для обнаружения молекулярной адсорбции, иммуноанализов SPR, характеристики материалов, анализа данных и биосенсоров.
СПР
Рис 5: Поверхностный плазмонный резонанс (ППР). Источник рисунка:Саббан, Сари (2011) Разработка модельной системы in vitro для изучения взаимодействия IgE Equus caballus с его высокоаффинным рецептором FcεRI (докторская диссертация), Университет Шеффилда, CC BY-SA 3.0

Лентивирусное конструирование и производство

Лентивирусные векторы обладают способностью высокой упаковки, широкой направленности, уникальной универсальностью и стабильностью, что делает их идеальной системой доставки генов. Лентивирус — это вид вируса, который может вызывать такие заболевания, как СПИД. Они заражаются путем вставки ДНК в геном клетки-хозяина. Лентивирусный вектор — это ретровирус с одноцепочечным РНК-геномом и обратной транскриптазой, который может вставлять и изменять гены в организме.
ВИЧ
Рис. 6. Структура ВИЧ, лентивируса. Источник рисунка:википедия

СсылкаССЫЛКА

[1] Сарен Т., Саронио Г., Марти Торрелл П. и др. Кластеризация областей, определяющих комплементарность, может вызывать дисфункцию CAR-T-клеток. Национальная коммуна 14, 4732 (2023). https://doi.org/10.1038/s41467-023-40303-z
[2] Кост, Т., Кондри, Дж. и Джарвис, Д. Бакуловирусы как универсальные векторы для экспрессии белков в клетках насекомых и млекопитающих. Nat Biotechnol 23, 567–575 (2005). https://doi.org/10.1038/nbt1095.
[3] Спаркс РП, Дженкинс ДЖЛ, Фратти Р. Использование поверхностного плазмонного резонанса (ППР) для определения сродства связывания и кинетических параметров между компонентами, важными в машинах слияния. Методы Mol Biol. 2019;1860:199-210. doi: 10.1007/978-1-4939-8760-3_12. PMID: 30317506; PMCID: PMC8489108.
[4] https://en.wikipedia.org/wiki/Lentivirus.
[5] https://www.cancer.gov/about-cancer/treatment/research/car-t-cells.