При выборе буферов следует учитывать стабильность мишени, микросреду связывания и минимальное неспецифическое связывание в реальном сценарии применения. Неродственные белки, неионные детергенты и физиологические концентрации солей способствуют снижению фона. Существуют также другие условия, например, некоторые мишени могут потребовать добавления двухвалентных катионов или других кофакторов в буфер, кофакторы белков могут быть совместно зафиксированы с мишенью, могут быть добавлены в сортировочный буфер и даже могут использоваться в качестве средства захвата мишени.

К общим факторам давления отбора относятся концентрация целевых молекул, время связывания, интенсивность промывки и т. д. Другие методы повышения давления отбора включают использование денатурирующих агентов (таких как кислоты, мочевина и гуанидин), органических растворителей, повышение температуры или увеличение концентрации конкурирующих лигандов или мишеней в промывочном буфере.
Среди них важен первый раунд скрининга. Первый раунд скрининга заключается в захвате как можно большего количества положительных клонов из сконструированной библиотеки, при этом удаляя неспецифические клоны. Следует использовать мишени с пористым покрытием или большое количество растворимых мишеней, чтобы обеспечить захват большого количества связанных фагов для поддержания разнообразия библиотеки. В последующих раундах скрининга давление отбора должно быть увеличено с увеличением обогащения, многократной промывки и увеличения времени промывки, клоны с высоким сродством могут быть скринингованы.

Антигенные метки и материалы-носители процесс скрининга заключается в скрининге всех веществ на конъюгатах антигена, таких как метки, белки слияния и поддерживающие субстраты. Отрицательный скрининг нецелевых веществ может ограничить обогащение антител, отличных от целевого антигена.
Целые клетки, липосомы, нанофосфолипидные диски и вирусоподобные частицы можно подвергнуть отрицательному скринингу с использованием моделированных трансфицированных клеток или нетрансфицированных клеток при скрининге трансфицированных клеточных линий.
Удаление сложных смесей антигенов. Строгий отрицательный скрининг может быть выполнен для неизвестных или сложных целевых молекул, таких как целые клетки или неочищенные белки.
Стратегия антител против определенных участков антигенов заключается в том, чтобы элюировать антитело, которое может конкурировать с лигандом, путем добавления высокой концентрации лигандов, а другая — в блокировании антитела.

*Открытие антител становится все более важным в современной медицине. Существуют различные подходы к открытию антител, но технология фагового дисплея больше используется в медицинской науке. С 1990 года для создания фаговых библиотек использовались различные форматы антител, включая VH, VHH, scFv, диатела и Fab-антитела.
*Библиотеки фаговых пептидов позволяют быстро определять последовательность белковых эпитопов и стали мощным инструментом для исследования взаимодействия между эпитопами и антигенными рецепторами.
*Фрагменты антител сливаются с G3P фага M13, и путем клонирования большого количества генов, кодирующих фрагмент антитела, можно создать большие библиотеки фаговых дисплеев антител, из которых можно выбрать множество разнообразных антител.
*Система фагового дисплея Т7 имеет много преимуществ, включая простоту, высокую безопасность, стабильность, удобство хранения и транспортировки, поэтому ее используют в профилактических и терапевтических вакцинах.
*Система фагового дисплея Т7 может обнаруживать различные антигены, такие как поверхностные антигены патогенных микроорганизмов и раковые антигены.