Platforma e Zhvillimit Aptamer

Aptamerët janë oligonukleotide me një fije të vetme (ADN, ARN ose XNA) me vetinë e afinitetit të lartë dhe specifikës së lartë që lidhen posaçërisht me molekulat e synuara si antitrupat, dhe përdoren gjerësisht për zhvillimin e biosensorëve, diagnostikimit dhe terapive.

Platforma e aptamerit e ofruar nga Alpha Lifetech përfshin dy kategori: platformën e sintezës së aptamerit, e cila kryesisht përfshin shërbimin e sintezës së bibliotekës së aptamerit SELEX dhe shërbimin e zhvillimit të aptamerit (ADN, ARN ose XNA), dhe platformën e shqyrtimit të aptamerit që përfshin shërbimet e shqyrtimit bazuar në teknologjinë SELEX për proteina, peptide, qeliza, molekula të vogla, jone metalike dhe molekula të tjera të synuara, si dhe shërbimet e analizës së optimizimit dhe identifikimit të aptamerit në rrjedhën e poshtme.

Platforma e Sintezës së Aptamerit

Shërbimi i sintezës së bibliotekës së aptamit SELEX

Shërbimi i sintezës së bibliotekës së aptamerëve SELEX përfshin kryesisht ndërtimin e një biblioteke që përmban një numër të madh sekuencash të rastësishme oligonukleotidesh me një fije të vetme me anë të sintezës kimike in vitro sipas molekulave të synuara. Ndërtimi i bibliotekës është pika fillestare e teknologjisë SELEX, e cila ofron sekuenca të bollshme kandidate për procesin pasues të shqyrtimit duke ndërtuar biblioteka të mëdha të rastësishme dhe rrit mundësinë e shqyrtimit të aptamerëve me afinitet të lartë.

Sinteza e bibliotekës ndahet kryesisht në hapat e mëposhtëm:

Hapat	Detajet e Teknologjisë
Identifikoni Molekulat e Synuara	Identifikoni molekulat e synuara që duhet të shqyrtohen për aptamerë, të cilët mund të jenë proteina, acide nukleike, molekula të vogla, jone metalike, etj.
Dizajni i Sekuencës së Rastësishme	Gjatësia e sekuencës së rastësishme, përbërja e bazave dhe parametra të tjerë u hartuan sipas karakteristikave të molekulave të synuara dhe kërkesave të shqyrtimit. Në mënyrë tipike, sekuencat e rastësishme janë midis dhjetëra dhe qindra bazave në gjatësi.
Sinteza e Sekuencave Fikse	Fragmente oligonukleotidesh me sekuenca të fiksuara (si sekuencat e prajmerëve PCR) në të dy skajet projektohen dhe sintetizohen, të cilat do të përdoren në procesin pasues të amplifikimit dhe shqyrtimit.

Biblioteka e sintetizuar duhet të përpunohet më tej për kontrollin e cilësisë. Përqendrimi i bibliotekës u përcaktua për të siguruar zbatueshmërinë e saj në procesin pasues të shqyrtimit. Diversiteti dhe saktësia e sekuencave të rastësishme në bibliotekë u verifikuan me anë të sekuencimit dhe metodave të tjera për të siguruar që cilësia e bibliotekës përmbushte kërkesat e shqyrtimit.

Përmes hapave të mësipërm, mund të sintetizohet një bibliotekë aptamerësh SELEX me cilësi të lartë dhe shumë të larmishme, e cila mund të ofrojë sekuenca të bollshme kandidate për procesin pasues të shqyrtimit.

Shërbimet e zhvillimit të Aptamerit (ADN, ARN ose XNA)

Aptamerët zakonisht i referohen aptamerëve të acidit nukleik. Aptamerët e acidit nukleik përfshijnë aptamerët e ADN-së, aptamerët e ARN-së dhe aptamerët XNA, të cilët janë aptamerë të acidit nukleik të modifikuar kimikisht. Teknika SELEX përdoret gjerësisht për zhvillimin e aptamerëve. Fluksi bazë i punës së shërbimeve të zhvillimit të aptamerëve përfshin ndërtimin e bibliotekës, lidhjen e objektivit, izolimin dhe pastrimin, amplifikimin, raundet e shumëfishta të shqyrtimit dhe identifikimin e sekuencave. Për shumë vite, ne jemi përqendruar në ndërtimin e bibliotekës dhe kemi përvojë të pasur në zhvillimin e aptamerëve. Ne jemi të përkushtuar t'u ofrojmë klientëve shërbime më të mira.

Procesi i Teknologjisë SELEX

Procesi SELEX përbëhet nga disa raunde, secili prej të cilave përbëhet nga hapat kryesorë të mëposhtëm:

Lidhja e Bibliotekës dhe Targetit

Biblioteka e ndërtuar e acideve nukleike është e përzier me molekula specifike të synuara (siç janë proteinat, komponimet e molekulave të vogla, etj.), në mënyrë që sekuencat e acideve nukleike në bibliotekë të kenë mundësinë të lidhen me molekulat e synuara.

Izolimi i Molekulave të Palidhura

Sekuencat e acideve nukleike që nuk janë të lidhura me molekulën e synuar ndahen nga përzierja me anë të metodave specifike si kromatografia e afinitetit, ndarja e sferave magnetike, etj.

Amplifikimi i Molekulave Lidhëse

Sekuenca e acidit nukleik e lidhur me një molekulë të synuar amplifikohet, zakonisht duke përdorur teknologjinë e reaksionit zinxhir të polimerazës (PCR). Për fazën pasuese të shqyrtimit, sekuencat e amplifikuara do të përdoren si biblioteka fillestare.

Fig. 1: Procesi i shqyrtimit SELEX

Platforma e Shqyrtimit të Aptamerit

Shërbimi i shqyrtimit të Aptamerit

Alpha Lifetech ofron një gamë të larmishme shërbimesh të specializuara për shqyrtimin e aptameve duke aplikuar metodologji të ndryshme SELEX për lloje të ndryshme të molekulave tuaja:

Llojet e objektivave	Detajet Teknike
Shqyrtimi i Aptamerit të Proteinës nga SELEX	Qëllimi kryesor i shqyrtimit të aptamerëve të proteinave është të shqyrtojë aptamerët që mund të lidhen posaçërisht me molekulat e proteinave të synuara. Këta aptamerë janë më të thjeshtë për t'u sintetizuar, më të qëndrueshëm dhe më pak të ndjeshëm ndaj faktorëve mjedisorë.
Shqyrtimi i Peptideve Aptamer nga SELEX	Aptamerët peptidë janë një klasë e sekuencave të shkurtra peptide me specifikë dhe afinitet të lartë, të cilat mund të lidhen posaçërisht me substancat e synuara dhe tregojnë një gamë të gjerë potencialesh aplikimi në fushën biomjekësore. Përmes një procesi specifik të shqyrtimit, aptamerët peptidë që mund të lidhen posaçërisht me molekulat e synuara shqyrtohen nga një numër i madh bibliotekash të sekuencave peptide të rastësishme.
Shqyrtimi i Aptamerëve specifikë për qelizat (Cell-SELEX)	Qelizat shënjestër ose molekulat specifike në sipërfaqen e qelizës përgatiten si shënjestra. Shënjestrat mund të jenë qeliza të tëra, receptorë në membranën qelizore, proteina ose molekula të tjera të vogla.
Shqyrtimi i Aptamerit të Molekulave të Vogla nga Capture SELEX	Kapja e SELEX është një teknikë shqyrtimi in vitro për shqyrtimin e aptamerëve të molekulave të vogla, e cila është një variant i SELEX. Kapja e SELEX është veçanërisht e përshtatshme për shqyrtimin e aptameve të molekulave të vogla objektiva, të cilat zakonisht kanë më pak grupe funksionale dhe janë të vështira për t'u imobilizuar direkt në mbështetëse të fazës së ngurtë.
Shërbimet SELEX të bazuara në kafshë të gjalla	Shërbimi i shqyrtimit të bazuar në kafshë të gjalla është një teknikë eksperimentale e përdorur gjerësisht në fushat e bioshkencës, mjekësisë dhe bioteknologjisë, e cila përdor kafshë të gjalla si modele eksperimentale për të shqyrtuar dhe vlerësuar molekula, ilaçe, terapi ose procese biologjike specifike. Shërbimet janë të dizajnuara për të simuluar mjedisin fiziologjik në trupin e njeriut për të parashikuar dhe vlerësuar më saktë efikasitetin dhe sigurinë e rezultateve eksperimentale në trupin e njeriut.

Shërbimi i optimizimit të Aptamer

Hidrofiliteti, humbja e lartë e afinitetit gjatë prodhimit dhe sekretimi i shpejtë i aptamerëve kufizojnë zbatimin e tyre. Aktualisht, janë eksploruar një sërë metodash optimizimi për të përmirësuar performancën e aptamerëve.

Ne gjithashtu kemi një sërë mënyrash për të optimizuar aptamerin që përbëhen nga shkurtimi, modifikimet, konjugimi me grupin e duhur (tiol, karboksi, aminë, fluorofor, etj.).

Shërbimi i analizës së karakterizimit të Aptamerit

Shërbimi i analizës së karakterizimit të Aptamerit i referohet shërbimit profesional të vlerësimit të performancës, zgjidhjes së strukturës dhe verifikimit funksional të aptamerit të përftuar për të siguruar që aptameri përmbush kërkesat e aftësisë specifike të lidhjes, stabilitetit dhe specifikës. Ai përfshin kryesisht analizën e afinitetit dhe specifikës, vlerësimin e stabilitetit dhe verifikimin e funksionit biologjik.