РНК аптамери су синтетичке, једноланчане РНК секвенце, обично дужине између 56 и 120 база. РНК аптамери које обезбеђује Alpha Lifetech су одабрани SELEX технологијом, која може да формира специфичне тродимензионалне просторне конфигурације и да интерагује са циљним молекулима са високим афинитетом и специфичношћу.
РНК аптамери у односу на ДНК аптамере
По хемијском саставу и структури, РНК аптамери су састављени од рибонуклеотида са рибозом као скелетом од пет угљеникових атома шећера у својој структури. РНК аптамери су често способни да се савијају у сложене тродимензионалне структуре, а ова структурна разноликост им омогућава да се вежу за циљне молекуле (као што су протеини, пептиди, олигосахариди итд.) на различите начине. Везивање РНК аптамера за циљне молекуле углавном зависи од комплементарног облика и силе интеракције између њих. Ове интеракције укључују водоничне везе, јонске везе, хидрофобне интеракције и ван дер Валсове силе.
ДНК аптамери су састављени од дезоксирибонуклеотида који садрже дезоксирибозу као скелет шећера са пет угљеникових атома у својој структури. ДНК аптамери су такође способни да формирају специфичне конформације за везивање за циљни молекул, али њихова структурна стабилност може бити нешто мања од оне код РНК аптамера јер су фосфодиестарске везе у ДНК стабилније од оних у РНК.
У поређењу са ДНК аптамерима, РНК аптамери могу показати већу хемијску стабилност и биолошку активност под одређеним условима због своје јединствене хемијске структуре.
РНК аптамери обично имају већу ћелијску пенетрацију, што им омогућава да лакше уђу у унутрашњост ћелије и вежу се за циљни протеин или други молекул. Ово својство је посебно важно у интрацелуларној терапији и дијагностичким применама, јер омогућава аптамеру да функционише директно унутар ћелије без потребе за додатним векторима или технологијама које би помогле његовом уласку у ћелију.
РНК и ДНК аптамери су тестирани и оптимизовани in vitro како би показали високу специфичност везивања за циљ. Међутим, пошто РНК аптамери имају сложеније структуре и више функционалних група, у неким случајевима могу показати већу специфичност.
Развој РНК аптамера
Развој РНК аптамера које испоручује Алфа Лајфтех је сложен и деликатан процес који се углавном ослања на напредну биотехнологију и методе хемијске синтезе. Његов процес развоја генерално укључује следеће кораке:
Одређивање циља
Прво идентификујте циљне молекуле које треба везати, као што су протеини, ћелије, јони итд.
Дизајн библиотеке
Према карактеристикама циљног молекула, дизајн и синтеза РНК библиотека које садрже велики број случајних секвенци. Ове библиотеке обично садрже милионе различитих варијанти секвенци како би се осигурала покривеност потенцијалних секвенци које се везују за циљни молекул.
Селекција РНК аптамера
Коришћењем систематске еволуције лиганда експоненцијалним обогаћивањем (SELEX) или сличних техника, секвенце РНК аптамера, такође назване аптамери РНК библиотеке, које се везују за циљне молекуле са високим афинитетом, скринира се из библиотеке кроз вишеструке процесе скрининга. У процесу скрининга, невезане секвенце се уклањају, а везане секвенце се обогаћују, и коначно се добијају аптамери РНК библиотеке са високом специфичношћу и афинитетом.
Оптимизација секвенце
Секвенца аптамера РНК библиотеке добијена скринингом је додатно оптимизована како би се побољшала њена стабилност, специфичност и афинитет. Капацитет везивања РНК аптамера обично укључује модификацију секвенце, скраћивање, мутацију итд.

Сл.1 SELEX дијаграм РНК аптамера
Примена РНК аптамера
| Област | Примена |
| Биомедицински домен
| Дијагноза болести |
| Детекција биомаркера: РНК аптамери могу се везати за биомаркере повезане са болешћу са високом специфичношћу, пружајући важну основу за рану дијагнозу болести. Детекција патогена: У дијагнози заразних болести, РНК аптамери се могу користити за детекцију патогена, као што су вируси, бактерије итд., са предностима високе осетљивости и јаке специфичности. |
| Циљана терапија |
| Достава лекова: РНК аптамери се могу везати за молекуле лекова како би формирали комплексе аптамер-лек, постижући циљану испоруку лекова путем специфичног препознавања и везивања за циљне ћелије, побољшавајући ефикасност лечења и смањујући нежељене ефекте. Генска терапија: У генској терапији, РНК аптамери се могу користити као носачи за испоруку терапеутских гена специфичним ћелијама или ткивима ради прецизног лечења. |
| Биосензор |
| РНК аптамерни биосензори имају високу осетљивост и специфичност и могу се користити за детекцију штетних супстанци и биомаркера у окружењу, пружајући снажну подршку за праћење животне средине и безбедности хране. |
| Област биотехнологије | Снимање живих ћелија |
| Флуоресцентни РНК аптамери постижу праћење и снимање специфичних РНК молекула у живим ћелијама у реалном времену везивањем за нефлуоресцентне молекуле боје и стимулисањем истих да производе флуоресценцију. Ова техника пружа важно средство за дубинско разумевање процеса ћелијског живота и механизма настанка болести. |
| Нанотехнологија |
| РНК аптамери могу модификовати површину наночестица и променити њихова физичка и хемијска својства, чиме се проширује примена наночестица у биомедицини и другим областима. На пример, наночестице модификоване РНК аптамерима могу се користити као носачи лекова за постизање циљане испоруке лекова. |
| Други | Синтетичка биологија |
| У синтетичкој биологији, РНК аптамери се могу користити као градивни блокови за учешће у дизајну и изградњи синтетичких биолошких система. На пример, РНК аптамери се користе за постизање прецизне регулације експресије гена и прецизне контроле преноса сигнала. |