Layanan Optimasi Aptamer

Aptamer nyaéta oligonukleotida ranté tunggal anu tiasa ngabeungkeut sacara khusus kana molekul target. Éta ngabentuk struktur tilu diménsi anu khusus saatos tilepan adaptif ngalangkungan rupa-rupa gaya interaksi sapertos pasangan komplementer basa nukléotida, beungkeutan hidrogén, susun π-π, gaya éléktrostatik, jsb. Struktur ieu ngabeungkeut sacara khusus kana molekul target ngalangkungan gaya antarmolekul. Aptamer biasana dihasilkeun ku panyaringan SELEX. Métode optimasi aptamer utamina museur kana ningkatkeun afinitas, selektivitas sareng stabilitas aptamer.

Alpha Lifetech berkomitmen pikeun nyayogikeun jasa panyaringan sareng optimasi aptamer asam nukléat anu akurat sareng efisien pikeun para nasabah. Prosés panyaringan sareng optimasi henteu ngan ukur léngkah konci pikeun kéngingkeun aptamer anu kualitasna luhur, tapi ogé pondasi anu penting pikeun ngamajukeun aplikasi ieu. Alpha Lifetech teras ngenalkeun téknologi canggih sareng ngaoptimalkeun prosés jasa pikeun mastikeun yén jasa kami salawasna aya di garis payun industri sareng mawa pangalaman jasa panyaringan sareng optimasi aptamer asam nukléat anu langkung efisien pikeun para nasabah.

Pilihan Aptamer SELEX

Alpha Lifetech parantos fokus kana pamekaran aptamer asam nukléat salami mangtaun-taun, utamina dibagi kana desain aptamer asam nukléat, konstruksi perpustakaan aptamer asam nukléat, panyaringan aptamer asam nukléat sareng sintésis aptamer asam nukléat.

Téhnik panyaringan SELEX nyaéta métode utama pikeun nyaring aptamer. Alpha Lifetech teu ngan ukur tiasa nyayogikeun pamilihan aptamer SELEX, tapi ogé métode sanés anu dumasar kana téknologi SELEX, sapertos Cell-SELEX, CE-SELEX, Capture-SELEX, jsb. Ngaliwatan panyaringan aptamer in vitro, aptamer anu sacara khusus tiasa ngaidentipikasi molekul target sareng gaduh afinitas anu luhur kana molekul target diala, teras sekuensing throughput anu luhur dilaksanakeun dina aptamer anu disaring, sareng pamustunganana aptamer disintésis ngalangkungan sintésis kimia in vitro. Salaku tambahan, Alpha Lifetech tiasa ngaoptimalkeun aptamer anu dipilih sareng mastikeun fungsi aptamer anu dioptimalkeun.

Bubuka kana Optimasi Aptamer

Sanaos aptamer asam nukléat anu disaring ku téknologi SELEX gaduh afinitas anu kuat pikeun molekul target, dina aplikasi praktis, aptamer masih kedah dioptimalkeun pikeun langkung ningkatkeun spésifisitas aptamer, afinitas aptamer, sareng stabilitas aptamer pikeun minuhan kabutuhan skénario aplikasi khusus.

Métode optimasi aptamer utama ngawengku aspék-aspék ieu:

Motong struktur

Pangurangan: Ku cara miceun bagian tina runtuyan aptamer anu henteu mangaruhan atanapi kirang mangaruhan kamampuan ngabeungkeut molekul target, ngajaga daérah pangakuan inti, panjang aptamer tiasa disingget, sareng efisiensi sintésis sareng stabilitas aptamer tiasa ningkat.

Dumasar kana simulasi struktur sekundér sareng uji coba sareng kasalahan empiris, struktur lokal anu langkung luhur tina aptamer (sapertos cincin batang, pseudojunction, G-quadruplet, jsb.) ditetepkeun sacara jieunan, ranté tunggal anu teu kabentuk atanapi dipasangkeun dicabut, batangna dipondokkeun, cincin konveks alit dicabut, cincin dikirangan, jsb. Téhnologi docking molekuler dianggo pikeun ngaduga struktur tilu diménsi tina aptamer sareng molekul target pikeun panyusunan anu langkung akurat.

Ngawanohkeun mutasi

Mutasi acakNgagunakeun téknik mutagenesis (sapertos mutagenesis PCR) pikeun ngenalkeun mutasi acak kana runtuyan aptamer, sareng panyaringan ulang ku téknologi SELEX tiasa kéngingkeun mutan anu gaduh afinitas sareng selektivitas anu langkung luhur. Métode ieu tiasa ngajalajah rupa-rupa runtuyan aptamer sareng mendakan pola pangiket énggal sareng arah optimasi.

Mutasi spésifik situsDumasar kana analisis struktural sareng prediksi situs pangiket, situs mutasi anu mungkin dipilih pikeun substitusi basa tunggal atanapi multi-basa pikeun nalungtik pangaruh tina runtuyan anu béda kana kinerja aptamer. Mutasi khusus situs tiasa ngontrol parobahan struktural aptamer sacara tepat pikeun ngaoptimalkeun kinerjana.

Modifikasi kimiawi

Aptamer dirobah sacara kimiawi, sareng gugus modifikasi diwanohkeun dina posisi aptamer anu béda (sapertos basa, cincin gula, gugus fosfat, jsb.) pikeun ningkatkeun stabilitas, kamampuan anti-nuklease sareng afinitas aptamer.

Gambar 1 Modifikasi umum tina aptamer. (Sumber rujukan:Buku "Asam Nukléat", Bab "Aptamer Asam Nukléat"

Modifikasi umum kalebet 2 '-fluororibosa, 2' -amino ribosa, 2 '-o-metilribosa, LNA (asam nukléat nu dikonci), sareng asam nukléat purin nu teu dimetilasi (UNA). Modifikasi ieu tiasa ngirangan pangakuan nuklease, ningkatkeun kamampuan aptamer pikeun nolak degradasi, atanapi ngarobih sipat ngabeungkeutna kana molekul target.

Ngawanohkeun Area Fungsi

Aptamer dibéré fungsi-fungsi anyar, sapertos aktivitas énzim sareng kamampuan ngalaporkeun fluoresensi. Daérah pangiket ligan digabungkeun sareng daérah katalitik pikeun ngahasilkeun aptamer kalayan aktivitas énzim. Salaku conto, nambihan daérah anu ngabeungkeut kana molekul anu ngaluarkeun fluoresensi nyiptakeun aptamer anu ngalaporkeun diri anu ngaluarkeun sinyal fluoresensi saatos pangiket target anu suksés.