Aptamer utvecklingsplattform

Aptamerer är enkelsträngade oligonukleotider (DNA, RNA eller XNA) med egenskapen hög affinitet och hög specificitet som specifikt binder till målmolekyler som antikroppar, och de används i stor utsträckning för utveckling av biosensorer, diagnos och terapi.

Den aptamer-plattform som tillhandahålls av Alpha Lifetech inkluderar två kategorier: aptamer-syntesplattform, som huvudsakligen involverar SELEX aptamer-biblioteksyntestjänst och aptamer (DNA, RNA eller XNA) utvecklingstjänst, och aptamer-screeningsplattform inklusive screeningtjänster baserade på SELEX-teknologi för proteiner, peptider, celler, små molekyler och andra nedströmsmetaller, molekyler och molekyler, nedströms och molekyler, optimerings- och identifieringsanalystjänster.

Aptamer Synthesis Platform

SELEX aptamer-bibliotekssyntestjänst

SELEX aptamer bibliotekssyntestjänst innebär huvudsakligen att konstruera ett bibliotek som innehåller ett stort antal slumpmässiga enkelsträngade oligonukleotidsekvenser genom in vitro kemisk syntes enligt målmolekylerna. Bibliotekskonstruktion är utgångspunkten för SELEX-teknologin, som ger rikliga kandidatsekvenser för den efterföljande screeningsprocessen genom att konstruera enorma slumpmässiga bibliotek och ökar möjligheten att screena aptamerer med hög affinitet.

Bibliotekssyntes är huvudsakligen uppdelad i följande steg:

Steg	Tekniska detaljer
Identifiera målmolekyler	Identifiera målmolekylerna som behöver screenas för aptamerer, som kan vara proteiner, nukleinsyror, småmolekylära, metalljoner, etc.
Slumpmässig sekvensdesign	Slumpmässig sekvenslängd, bassammansättning och andra parametrar utformades i enlighet med egenskaperna hos målmolekyler och screeningskrav. Vanligtvis är slumpmässiga sekvenser mellan tiotals och hundratals baser långa.
Syntes av fasta sekvenser	Oligonukleotidfragment med fixerade sekvenser (såsom PCR-primersekvenser) i båda ändar designas och syntetiseras, vilka kommer att användas i den efterföljande amplifierings- och screeningprocessen.

Det syntetiserade biblioteket behöver fortfarande bearbetas ytterligare för kvalitetskontroll. Koncentrationen av biblioteket bestämdes för att säkerställa dess tillämpbarhet i den efterföljande screeningprocessen. Mångfalden och noggrannheten hos slumpmässiga sekvenser i biblioteket verifierades genom sekvensering och andra metoder för att säkerställa att kvaliteten på biblioteket uppfyllde screeningskraven.

Genom stegen ovan kan ett högkvalitativt och mycket mångsidigt SELEX aptamer-bibliotek syntetiseras, vilket kan ge rikliga kandidatsekvenser för den efterföljande screeningsprocessen.

Aptamer-utvecklingstjänster (DNA, RNA eller XNA)

Aptamerer hänvisar vanligtvis till nukleinsyraaptamerer. Nukleinsyraaptamerer inkluderar DNA-aptamerer, RNA-aptamerer och XNA-aptamerer som är kemiskt modifierade nukleinsyraaptamerer. SELEX-tekniken används i stor utsträckning för utveckling av aptamerer. Det grundläggande arbetsflödet för aptamer-utvecklingstjänster inkluderar bibliotekskonstruktion, målbindning, isolering och rening, amplifiering, flera omgångar av screening och sekvensidentifiering. Under många år har vi fokuserat på biblioteksbyggande och rik erfarenhet av aptamerutveckling. Vi är fast beslutna att ge kunderna bättre tjänster.

SELEX Technology Process

SELEX-processen består av flera omgångar, som var och en består av följande nyckelsteg:

Bibliotek och målbindning

Det konstruerade nukleinsyrabiblioteket blandas med specifika målmolekyler (såsom proteiner, småmolekylära föreningar etc.), så att nukleinsyrasekvenserna i biblioteket har möjlighet att binda till målmolekylerna.

Isolering av obundna molekyler

Nukleinsyrasekvenser som inte är bundna till målmolekylen separeras från blandningen med specifika metoder såsom affinitetskromatografi, magnetisk pärlseparation, etc.

Amplifiering av bindande molekyler

Nukleinsyrasekvensen bunden till en målmolekyl amplifieras, vanligen med användning av polymeraskedjereaktion (PCR)-teknologi. För den efterföljande screeningsfasen kommer de amplifierade sekvenserna att användas som startbibliotek.

Fig 1: SELEX screeningprocess

Aptamer Screening Platform

Aptamer screeningtjänst

Alpha Lifetech erbjuder ett brett utbud av specialiserade aptamer-screeningstjänster som använder olika SELEX-metoder för olika typer av dina molekyler:

Måltyper	Tekniska detaljer
Protein Aptamer Screening av SELEX	Huvudsyftet med screening av proteinaptamer är att screena aptamerer som specifikt kan binda till målproteinmolekyler. Dessa aptamerer är enklare att syntetisera, mer stabila och mindre mottagliga för miljöfaktorer.
Peptid Aptamer Screening av SELEX	Peptidaptamerer är en klass av korta peptidsekvenser med hög specificitet och affinitet, som specifikt kan binda till målsubstanser och uppvisa ett brett användningsområde inom det biomedicinska området. Genom en specifik screeningsprocess screenas peptidaptamerer som specifikt kan binda till målmolekyler från ett stort antal slumpmässiga peptidsekvensbibliotek.
Cellspecifik Aptamer-screening (Cell-SELEX)	Målceller eller specifika molekyler på cellytan framställs som mål. Mål kan vara hela celler, receptorer på cellmembranet, proteiner eller andra små molekyler.
Small Molecule Aptamer Screening av Capture SELEX	Capture SELEX är en in vitro-screeningsteknik för screening av småmolekylära aptamerer, som är en variant av SELEX. Capture SELEX är särskilt väl lämpad för aptamerscreening av små molekylmål, som vanligtvis har färre funktionella grupper och är svåra att immobilisera direkt på fastfasunderlag.
Live Animal-baserade SELEX-tjänster	Levande djurbaserad screeningtjänst är en experimentell teknik som ofta används inom biovetenskap, medicin och bioteknik, som använder levande djur som experimentella modeller för att screena och utvärdera specifika molekyler, läkare, terapeutiska eller biologiska processer. Tjänsterna är utformade för att simulera den fysiologiska miljön i människokroppen för att mer exakt förutsäga och utvärdera effektiviteten och säkerheten av experimentella resultat i människokroppen.

Aptamer optimeringstjänst

Hydrofilicitet, hög affinitetsförlust under produktion och snabb utsöndring av aptamerer begränsar deras användning. För närvarande har en mängd olika optimeringsmetoder undersökts för att förbättra prestandan hos aptamerer.

Vi har också en mängd olika sätt att optimera aptamer bestående av trunkering, modifieringar, konjugering till lämplig grupp (tiol, karboxi, amin, fluorofor, etc.).

Aptamer-karakteriseringsanalystjänst

Aptamer-karakteriseringsanalystjänst hänvisar till den professionella tjänsten för prestandautvärderingsstrukturupplösning och funktionell verifiering av den erhållna aptameren för att säkerställa att aptameren uppfyller de specifika bindningsförmåga, stabilitet och specificitetskrav. Det inkluderar främst affinitets- och specificitetsanalys, stabilitetsutvärdering och biologisk funktionsverifiering.