Plataporma ng Pagpapaunlad ng Aptamer

Ang mga aptamer ay single-stranded oligonucleotide (DNA, RNA o XNA) na may katangiang mataas ang affinity at mataas ang specificity na partikular na nagbibigkis sa mga target na molekula tulad ng mga antibodies, at malawakan itong ginagamit para sa pagbuo ng mga biosensor, diagnosis, at therapeutics.

Ang plataporma ng aptamer na ibinibigay ng Alpha Lifetech ay may kasamang dalawang kategorya: plataporma ng aptamer synthesis, na pangunahing kinabibilangan ng serbisyo ng synthesis ng aptamer library ng SELEX at serbisyo sa pagbuo ng aptamer (DNA, RNA o XNA), at plataporma ng screening ng aptamer kabilang ang mga serbisyo ng screening batay sa teknolohiya ng SELEX para sa mga protina, peptide, selula, maliliit na molekula, metal ion at iba pang target na molekula, pati na rin ang mga serbisyo ng downstream na pag-optimize at pagsusuri ng pagkakakilanlan ng aptamer.

Plataporma ng Sintesis ng Aptamer

Serbisyo ng sintesis ng library ng aptamer ng SELEX

Ang serbisyo ng synthesis ng SELEX aptamer library ay pangunahing nagsasangkot sa pagbuo ng isang library na naglalaman ng malaking bilang ng mga random na single-stranded oligonucleotide sequences sa pamamagitan ng in vitro chemical synthesis ayon sa target moleculars. Ang pagbuo ng library ang panimulang punto ng teknolohiya ng SELEX, na nagbibigay ng masaganang kandidatong sequences para sa kasunod na proseso ng screening sa pamamagitan ng pagbuo ng malalaking random na library at nagpapataas ng posibilidad ng screening ng mga high-affinity aptamer.

Ang sintesis ng aklatan ay pangunahing nahahati sa mga sumusunod na hakbang:

Mga Hakbang	Mga Detalye ng Teknolohiya
Tukuyin ang mga Target na Molekyul	Tukuyin ang mga target na molekula na kailangang i-screen para sa mga aptamer, na maaaring mga protina, nucleic acid, small molecular, metal ions, atbp.
Disenyo ng Random na Pagkakasunod-sunod	Ang haba ng random na sequence, komposisyon ng base, at iba pang mga parametro ay dinisenyo ayon sa mga katangian ng mga target na molekula at mga kinakailangan sa screening. Kadalasan, ang mga random na sequence ay nasa pagitan ng sampu-sampu at daan-daang base ang haba.
Sintesis ng mga Nakapirming Pagkakasunod-sunod	Ang mga fragment ng oligonucleotide na may mga nakapirming sequence (tulad ng mga sequence ng PCR primer) sa magkabilang dulo ay dinisenyo at sinisintetiko, na gagamitin sa kasunod na proseso ng amplification at screening.

Ang na-synthesize na library ay kailangan pang iproseso para sa quality control. Ang konsentrasyon ng library ay natukoy upang matiyak ang kakayahang magamit nito sa kasunod na proseso ng screening. Ang pagkakaiba-iba at katumpakan ng mga random sequence sa library ay napatunayan sa pamamagitan ng sequencing at iba pang mga pamamaraan upang matiyak na ang kalidad ng library ay nakakatugon sa mga kinakailangan sa screening.

Sa pamamagitan ng mga hakbang sa itaas, maaaring mabuo ang isang mataas na kalidad at lubos na magkakaibang SELEX aptamer library, na maaaring magbigay ng masaganang kandidatong mga sequence para sa kasunod na proseso ng screening.

Mga serbisyo sa pagbuo ng Aptamer (DNA, RNA o XNA)

Ang mga aptamer ay karaniwang tumutukoy sa mga nucleic acid aptamer. Kasama sa mga nucleic acid aptamer ang mga DNA aptamer, RNA aptamer, at XNA aptamer na mga chemically modified nucleic acid aptamer. Ang pamamaraan ng SELEX ay malawakang ginagamit para sa pagbuo ng mga aptamer. Ang pangunahing daloy ng trabaho ng mga serbisyo sa pagbuo ng aptamer ay kinabibilangan ng pagbuo ng library, target binding, isolation at purification, amplification, maraming round ng screening, at sequence identification. Sa loob ng maraming taon, nakatuon kami sa pagbuo ng library at mayaman sa karanasan sa pagbuo ng aptamer. Nakatuon kami sa pagbibigay sa mga customer ng mas mahusay na serbisyo.

Proseso ng Teknolohiya ng SELEX

Ang proseso ng SELEX ay binubuo ng maraming round, na ang bawat isa ay binubuo ng mga sumusunod na pangunahing hakbang:

Library at Target Binding

Ang itinayong aklatan ng nucleic acid ay hinahalo sa mga partikular na target na molekula (tulad ng mga protina, maliliit na compound ng molekula, atbp.), upang ang mga sekwensyon ng nucleic acid sa aklatan ay magkaroon ng pagkakataong magbigkis sa mga target na molekula.

Paghihiwalay ng mga Hindi Nakagapos na Molekyul

Ang mga sekwensya ng nucleic acid na hindi nakatali sa target na molekula ay pinaghihiwalay mula sa pinaghalong gamit ang mga partikular na pamamaraan tulad ng affinity chromatography, magnetic bead separation, atbp.

Pagpapalawak ng mga Nagbubuklod na Molekula

Ang sekwensya ng nucleic acid na nakagapos sa isang target na molekula ay pinapalakas, karaniwang gamit ang teknolohiyang polymerase chain reaction (PCR). Para sa kasunod na yugto ng screening, ang mga pinalakas na sekwensya ay gagamitin bilang panimulang aklatan.

Larawan 1: Proseso ng screening ng SELEX

Plataporma ng Pagsusuri ng Aptamer

Serbisyo sa screening ng Aptamer

Nag-aalok ang Alpha Lifetech ng iba't ibang uri ng mga espesyalisadong serbisyo sa screening ng aptamer na gumagamit ng iba't ibang metodolohiya ng SELEX para sa iba't ibang uri ng iyong mga molekula:

Mga Uri ng Target	Mga Detalye ng Teknikal
Pagsusuri ng Protein Aptamer ng SELEX	Ang pangunahing layunin ng screening ng protein aptamer ay upang suriin ang mga aptamer na maaaring partikular na magbigkis sa mga target na molekula ng protina. Ang mga aptamer na ito ay mas madaling i-synthesize, mas matatag at hindi gaanong madaling kapitan ng mga salik sa kapaligiran.
Pagsusuri ng Peptide Aptamer ng SELEX	Ang mga peptide aptamer ay isang klase ng maiikling peptide sequence na may mataas na specificity at affinity, na maaaring partikular na magbigkis sa mga target na substance at magpakita ng malawak na hanay ng potensyal na aplikasyon sa larangan ng biomedical. Sa pamamagitan ng isang partikular na proseso ng screening, ang mga peptide aptamer na maaaring partikular na magbigkis sa mga target na molecule ay sinusuri mula sa isang malaking bilang ng mga random na peptide sequence libraries.
Pagsusuri ng Aptamer na Espesipiko sa Cell (Cell-SELEX)	Ang mga target na selula o mga partikular na molekula sa ibabaw ng selula ay inihahanda bilang mga target. Ang mga target ay maaaring buong selula, receptor sa lamad ng selula, protina, o iba pang maliliit na molekula.
Pagsusuri ng Maliit na Molecule Aptamer sa pamamagitan ng Capture SELEX	Ang Capture SELEX ay isang in vitro screening technique para sa screening ng mga small molecule aptamer, na isang variant ng SELEX. Ang Capture SELEX ay partikular na angkop para sa aptamer screening ng mga small molecule target, na karaniwang may mas kaunting functional groups at mahirap i-immobilize nang direkta sa mga solid phase support.
Mga serbisyo ng SELEX na nakabase sa Live na Hayop	Ang serbisyo ng screening na nakabase sa buhay na hayop ay isang eksperimental na pamamaraan na malawakang ginagamit sa mga larangan ng bioscience, medisina, at biotechnology, na gumagamit ng mga buhay na hayop bilang mga modelo ng eksperimento upang i-screen at suriin ang mga partikular na molekula, manggagamot, therapeutics, o mga prosesong biyolohikal. Ang mga serbisyong ito ay idinisenyo upang gayahin ang pisyolohikal na kapaligiran sa katawan ng tao upang mas tumpak na mahulaan at masuri ang bisa at kaligtasan ng mga resulta ng eksperimento sa katawan ng tao.

Serbisyo sa pag-optimize ng Aptamer

Ang hydrophilicity, mataas na affinity loss habang ginagawa, at mabilis na paglabas ng mga aptamer ay naglilimita sa kanilang aplikasyon. Sa kasalukuyan, iba't ibang paraan ng pag-optimize ang napag-aralan upang mapahusay ang pagganap ng mga aptamer.

Mayroon din tayong iba't ibang paraan upang ma-optimize ang aptamer na binubuo ng truncation, modifications, conjugation sa naaangkop na grupo (thiol, carboxy, amine, fluorophore, atbp.).

Serbisyo sa pagsusuri ng karakterisasyon ng Aptamer

Ang serbisyo sa pagsusuri ng katangian ng Aptamer ay tumutukoy sa propesyonal na serbisyo ng paglutas ng istruktura ng pagsusuri ng pagganap at pag-verify ng paggana ng nakuha na aptamer upang matiyak na natutugunan ng aptamer ang mga partikular na kinakailangan sa kakayahang magbigkis, katatagan, at espesipisidad. Pangunahin nitong kinabibilangan ang pagsusuri ng affinity at espesipisidad, pagsusuri ng katatagan, at pag-verify ng biyolohikal na tungkulin.