Aptamer Geliştirme Platformu

Aptamerler, antikorlar gibi hedef moleküllere özgül olarak bağlanan, yüksek afinite ve yüksek özgüllük özelliğine sahip tek zincirli oligonükleotitlerdir (DNA, RNA veya XNA) ve biyosensörlerin, teşhisin ve tedavinin geliştirilmesinde yaygın olarak kullanılırlar.

Alpha Lifetech tarafından sağlanan aptamer platformu iki kategori içerir: esas olarak SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti ve aptamer (DNA, RNA veya XNA) geliştirme hizmetini içeren aptamer sentez platformu ve proteinler, peptitler, hücreler, küçük moleküller, metal iyonları ve diğer hedef moleküller için SELEX teknolojisine dayalı tarama hizmetlerinin yanı sıra, aptamer optimizasyonu ve tanımlama analizi hizmetlerini de içeren aptamer tarama platformu.

Aptamer Sentez Platformu

SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti

SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti, esas olarak hedef moleküllere göre in vitro kimyasal sentez yoluyla çok sayıda rastgele tek zincirli oligonükleotid dizisi içeren bir kütüphane oluşturmayı içerir. Kütüphane oluşturma, SELEX teknolojisinin başlangıç noktasıdır ve büyük rastgele kütüphaneler oluşturarak sonraki tarama süreci için bol miktarda aday dizi sağlar ve yüksek afiniteli aptamerlerin taranma olasılığını artırır.

Kütüphane sentezi esas olarak aşağıdaki adımlara ayrılır:

Adımlar	Teknoloji Detayları
Hedef Molekülleri Belirleyin	Aptamerler için taranması gereken hedef molekülleri belirleyin; bunlar proteinler, nükleik asitler, küçük moleküller, metal iyonları vb. olabilir.
Rastgele Sıra Tasarımı	Rastgele dizi uzunluğu, baz bileşimi ve diğer parametreler, hedef moleküllerin özelliklerine ve tarama gereksinimlerine göre tasarlanmıştır. Tipik olarak, rastgele diziler onlarca ila yüzlerce baz uzunluğundadır.
Sabit Dizilerin Sentezi	Her iki ucunda da sabit diziler (örneğin PCR primer dizileri) bulunan oligonükleotid parçaları tasarlanır ve sentezlenir; bunlar daha sonraki amplifikasyon ve tarama işleminde kullanılacaktır.

Sentezlenen kütüphanenin kalite kontrolü için daha fazla işlenmesi gerekmektedir. Kütüphanenin konsantrasyonu, sonraki tarama sürecinde uygulanabilirliğini sağlamak için belirlenmiştir. Kütüphanedeki rastgele dizilerin çeşitliliği ve doğruluğu, sıralama ve diğer yöntemlerle doğrulanarak kütüphanenin kalitesinin tarama gereksinimlerini karşıladığından emin olunmuştur.

Yukarıdaki adımlar sayesinde, sonraki tarama işlemi için bol miktarda aday sekans sağlayabilen, yüksek kaliteli ve oldukça çeşitli bir SELEX aptamer kütüphanesi sentezlenebilir.

Aptamer geliştirme hizmetleri (DNA, RNA veya XNA)

Aptamerler genellikle nükleik asit aptamerlerini ifade eder. Nükleik asit aptamerleri arasında DNA aptamerleri, RNA aptamerleri ve kimyasal olarak modifiye edilmiş nükleik asit aptamerleri olan XNA aptamerleri bulunur. SELEX tekniği, aptamer geliştirme için yaygın olarak kullanılmaktadır. Aptamer geliştirme hizmetlerinin temel iş akışı, kütüphane oluşturma, hedef bağlanma, izolasyon ve saflaştırma, amplifikasyon, çoklu tarama turları ve dizi tanımlamayı içerir. Uzun yıllardır kütüphane oluşturmaya odaklandık ve aptamer geliştirme konusunda zengin bir deneyime sahibiz. Müşterilerimize daha iyi hizmetler sunmaya kararlıyız.

SELEX Teknoloji Süreci

SELEX süreci, her biri aşağıdaki temel adımlardan oluşan birden fazla turdan oluşmaktadır:

Kütüphane ve Hedef Bağlama

Oluşturulan nükleik asit kütüphanesi, spesifik hedef moleküllerle (proteinler, küçük molekül bileşikleri vb.) karıştırılır, böylece kütüphanedeki nükleik asit dizilerinin hedef moleküllere bağlanma fırsatı olur.

Bağlanmamış Moleküllerin İzolasyonu

Hedef moleküle bağlanmayan nükleik asit dizileri, afinite kromatografisi, manyetik boncuk ayırma vb. özel yöntemlerle karışımdan ayrılır.

Bağlayıcı Moleküllerin Amplifikasyonu

Hedef moleküle bağlı nükleik asit dizisi, genellikle polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) teknolojisi kullanılarak çoğaltılır. Sonraki tarama aşamasında, çoğaltılan diziler başlangıç kütüphanesi olarak kullanılacaktır.

Şekil 1: SELEX tarama süreci

Aptamer Tarama Platformu

Aptamer tarama hizmeti

Alpha Lifetech, farklı molekül türleriniz için çeşitli SELEX yöntemlerini uygulayarak, çok çeşitli uzmanlaşmış aptamer tarama hizmetleri sunmaktadır:

Hedef Türleri	Teknik Detaylar
SELEX Yöntemiyle Protein Aptamer Taraması	Protein aptamer taramasının temel amacı, hedef protein moleküllerine özgül olarak bağlanabilen aptamerleri taramaktır. Bu aptamerlerin sentezi daha basittir, daha kararlıdır ve çevresel faktörlere karşı daha az hassastır.
SELEX Yöntemiyle Peptit Aptamer Taraması	Peptit aptamerler, yüksek özgüllük ve afiniteye sahip, hedef maddelere özgül olarak bağlanabilen ve biyomedikal alanda geniş bir uygulama potansiyeli gösteren kısa peptit dizileri sınıfıdır. Belirli bir tarama işlemiyle, çok sayıda rastgele peptit dizisi kütüphanesinden hedef moleküllere özgül olarak bağlanabilen peptit aptamerler seçilir.
Hücreye Özgü Aptamer Taraması (Hücre-SELEX)	Hedef hücreler veya hücre yüzeyindeki belirli moleküller hedef olarak hazırlanır. Hedefler, hücrelerin tamamı, hücre zarındaki reseptörler, proteinler veya diğer küçük moleküller olabilir.
Yakalama Yöntemiyle Küçük Molekül Aptamer Taraması (SELEX)	Capture SELEX, küçük molekül aptamerlerinin taranması için kullanılan bir in vitro tarama tekniğidir ve SELEX'in bir varyantıdır. Capture SELEX, özellikle daha az fonksiyonel gruba sahip olan ve doğrudan katı faz desteklerine immobilize edilmesi zor olan küçük molekül hedeflerinin aptamer taraması için oldukça uygundur.
Canlı Hayvan Bazlı SELEX Hizmetleri	Canlı hayvan bazlı tarama hizmeti, biyobilim, tıp ve biyoteknoloji alanlarında yaygın olarak kullanılan deneysel bir tekniktir; bu teknik, belirli molekülleri, ilaçları, terapötikleri veya biyolojik süreçleri taramak ve değerlendirmek için canlı hayvanları deneysel model olarak kullanır. Bu hizmetler, insan vücudundaki fizyolojik ortamı simüle ederek, deneysel sonuçların insan vücudundaki etkinliğini ve güvenliğini daha doğru bir şekilde tahmin etmek ve değerlendirmek için tasarlanmıştır.

Aptamer optimizasyon hizmeti

Aptamerlerin hidrofilikliği, üretim sırasında yüksek afinite kaybı ve hızlı atılımı, uygulamalarını sınırlamaktadır. Şu anda, aptamerlerin performansını artırmak için çeşitli optimizasyon yöntemleri araştırılmaktadır.

Aptameri optimize etmek için, kısaltma, modifikasyon ve uygun gruba (tiyol, karboksil, amin, florofor vb.) bağlanma gibi çeşitli yöntemlerimiz de mevcuttur.

Aptamer karakterizasyon analiz hizmeti

Aptamer karakterizasyon analiz hizmeti, elde edilen aptamerin spesifik bağlanma yeteneği, stabilitesi ve özgüllük gereksinimlerini karşıladığından emin olmak için performans değerlendirmesi, yapı çözünürlüğü ve fonksiyonel doğrulaması yapan profesyonel bir hizmettir. Başlıca afinite ve özgüllük analizi, stabilite değerlendirmesi ve biyolojik fonksiyon doğrulamasını içerir.