Aptamer Geliştirme Platformu

Aptamerler, antikorlar gibi hedef moleküllere özgül olarak bağlanan, yüksek afinite ve yüksek özgüllük özelliğine sahip tek zincirli oligonükleotidlerdir (DNA, RNA veya XNA) ve biyosensörlerin geliştirilmesi, teşhis ve tedavi amacıyla yaygın olarak kullanılırlar.

Alpha Lifetech tarafından sağlanan aptamer platformu iki kategoriden oluşmaktadır: esas olarak SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti ve aptamer (DNA, RNA veya XNA) geliştirme hizmetini içeren aptamer sentez platformu ve proteinler, peptitler, hücreler, küçük moleküller, metal iyonları ve diğer hedef moleküller için SELEX teknolojisine dayalı tarama hizmetleri ile aşağı akış aptamer optimizasyonu ve tanımlama analizi hizmetlerini içeren aptamer tarama platformu.

Aptamer Sentez Platformu

SELEX aptamer kütüphane sentez hizmeti

SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti esas olarak hedef moleküllere göre in vitro kimyasal sentez yoluyla çok sayıda rastgele tek zincirli oligonükleotid dizisi içeren bir kütüphane oluşturmayı içerir. Kütüphane oluşturma, büyük rastgele kütüphaneler oluşturarak sonraki tarama süreci için bol miktarda aday dizi sağlayan ve yüksek afiniteli aptamerleri tarama olasılığını artıran SELEX teknolojisinin başlangıç noktasıdır.

Kütüphane sentezi temel olarak aşağıdaki adımlara ayrılır:

Adımlar	Teknoloji Detayları
Hedef Molekülleri Belirleyin	Aptamerler açısından taranması gereken hedef molekülleri belirleyin; bunlar proteinler, nükleik asitler, küçük moleküler, metal iyonları vb. olabilir.
Rastgele Sıra Tasarımı	Rastgele dizi uzunluğu, baz bileşimi ve diğer parametreler hedef moleküllerin özelliklerine ve tarama gereksinimlerine göre tasarlanmıştır. Tipik olarak, rastgele diziler onlarca ila yüzlerce baz uzunluğundadır.
Sabit Dizilerin Sentezi	Her iki ucunda sabit diziler (örneğin PCR primer dizileri) bulunan oligonükleotid parçaları tasarlanıp sentezlenir ve bunlar daha sonraki amplifikasyon ve tarama işlemlerinde kullanılır.

Sentezlenen kütüphanenin kalite kontrolü için daha fazla işlenmesi gerekiyor. Kütüphanenin konsantrasyonu, sonraki tarama sürecinde uygulanabilirliğini sağlamak için belirlendi. Kütüphanedeki rastgele dizilerin çeşitliliği ve doğruluğu, kütüphanenin kalitesinin tarama gereksinimlerini karşıladığından emin olmak için dizileme ve diğer yöntemlerle doğrulandı.

Yukarıdaki adımlar sayesinde, sonraki tarama süreci için bol miktarda aday dizi sağlayabilen, yüksek kaliteli ve oldukça çeşitli bir SELEX aptamer kütüphanesi sentezlenebilir.

Aptamer geliştirme hizmetleri (DNA, RNA veya XNA)

Aptamerler genellikle nükleik asit aptamerlerini ifade eder. Nükleik asit aptamerleri, DNA aptamerleri, RNA aptamerleri ve kimyasal olarak modifiye edilmiş nükleik asit aptamerleri olan XNA aptamerlerini içerir. SELEX tekniği aptamerlerin geliştirilmesinde yaygın olarak kullanılır. Aptamer geliştirme hizmetlerinin temel iş akışı, kütüphane oluşturma, hedef bağlama, izolasyon ve saflaştırma, amplifikasyon, çoklu tarama turları ve dizi tanımlamayı içerir. Uzun yıllardır kütüphane oluşturmaya ve aptamer geliştirmede zengin deneyime odaklandık. Müşteriye daha iyi hizmetler sunmaya kararlıyız.

SELEX Teknoloji Süreci

SELEX süreci, her biri aşağıdaki temel adımlardan oluşan birden fazla turdan oluşur:

Kütüphane ve Hedef Bağlama

Oluşturulan nükleik asit kütüphanesi, spesifik hedef moleküllerle (örneğin proteinler, küçük molekül bileşikleri vb.) karıştırılır, böylece kütüphanedeki nükleik asit dizilerinin hedef moleküllere bağlanma fırsatı olur.

Bağlanmamış Moleküllerin İzolasyonu

Hedef moleküle bağlı olmayan nükleik asit dizileri, afinite kromatografisi, manyetik boncuk ayırma vb. gibi özel yöntemlerle karışımdan ayrılır.

Bağlayıcı Moleküllerin Amplifikasyonu

Hedef moleküle bağlı nükleik asit dizisi genellikle polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) teknolojisi kullanılarak çoğaltılır. Sonraki tarama aşaması için çoğaltılan diziler başlangıç kütüphanesi olarak kullanılacaktır.

Şekil 1: SELEX tarama süreci

Aptamer Tarama Platformu

Aptamer tarama hizmeti

Alpha Lifetech, farklı molekül tipleriniz için çeşitli SELEX metodolojilerini uygulayan çeşitli uzmanlaşmış aptamer tarama hizmetleri sunmaktadır:

Hedef Türleri	Teknik Detaylar
SELEX Tarafından Protein Aptamer Taraması	Protein aptamer taramasının temel amacı, hedef protein moleküllerine spesifik olarak bağlanabilen aptamerleri taramaktır. Bu aptamerler sentezlenmesi daha basit, daha kararlı ve çevresel faktörlere karşı daha az hassastır.
SELEX Tarafından Peptid Aptamer Taraması	Peptid aptamerleri, hedef maddelere spesifik olarak bağlanabilen ve biyomedikal alanda geniş bir uygulama potansiyeli gösteren, yüksek özgüllük ve afiniteye sahip kısa peptit dizileri sınıfıdır. Spesifik bir tarama süreciyle, hedef moleküllere spesifik olarak bağlanabilen peptit aptamerleri çok sayıda rastgele peptit dizisi kütüphanesinden taranır.
Hücreye özgü Aptamer Tarama (Cell-SELEX)	Hedef hücreler veya hücre yüzeyindeki belirli moleküller hedef olarak hazırlanır. Hedefler tüm hücreler, hücre zarındaki reseptörler, proteinler veya diğer küçük moleküller olabilir.
Capture SELEX ile Küçük Molekül Aptamer Taraması	Capture SELEX, SELEX'in bir çeşidi olan küçük molekül aptamerlerinin taranması için bir in vitro tarama tekniğidir. Capture SELEX, genellikle daha az fonksiyonel gruba sahip olan ve doğrudan katı faz destekleri üzerinde immobilize edilmesi zor olan küçük molekül hedeflerinin aptamer taraması için özellikle uygundur.
Canlı Hayvan bazlı SELEX hizmetleri	Canlı hayvan tabanlı tarama hizmeti, canlı hayvanları deney modelleri olarak kullanarak belirli molekülleri, ilaçları, tedavi edicileri veya biyolojik süreçleri taramak ve değerlendirmek için biyobilim, tıp ve biyoteknoloji alanlarında yaygın olarak kullanılan deneysel bir tekniktir. Hizmetler, insan vücudundaki fizyolojik ortamı simüle etmek, insan vücudundaki deneysel sonuçların etkinliğini ve güvenliğini daha doğru bir şekilde tahmin etmek ve değerlendirmek için tasarlanmıştır.

Aptamer optimizasyon hizmeti

Aptamerlerin hidrofilisitesi, üretim sırasında yüksek afinite kaybı ve hızlı atılımı uygulamalarını sınırlar. Şu anda, aptamerlerin performansını artırmak için çeşitli optimizasyon yöntemleri araştırılmıştır.

Aptameri optimize etmek için kesme, modifikasyon, uygun gruba (tiyol, karboksi, amin, florofor, vb.) konjugasyon gibi çeşitli yollarımız da mevcuttur.

Aptamer karakterizasyon analiz hizmeti

Aptamer karakterizasyon analiz hizmeti, elde edilen aptamerin spesifik bağlanma yeteneği, kararlılık ve özgüllük gereksinimlerini karşıladığından emin olmak için performans değerlendirme yapı çözünürlüğü ve işlevsel doğrulamanın profesyonel hizmetini ifade eder. Esas olarak afinite ve özgüllük analizi, kararlılık değerlendirmesi ve biyolojik işlev doğrulamasını içerir.