Aptamer Geliştirme Platformu

Aptamerler, antikorlar gibi hedef moleküllere spesifik olarak bağlanan, yüksek afinite ve yüksek özgüllük özelliğine sahip tek zincirli oligonükleotidlerdir (DNA, RNA veya XNA) ve biyosensörlerin geliştirilmesi, tanı ve tedavi amacıyla yaygın olarak kullanılırlar.

Alpha Lifetech tarafından sağlanan aptamer platformu iki kategoriden oluşmaktadır: temel olarak SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti ve aptamer (DNA, RNA veya XNA) geliştirme hizmetini içeren aptamer sentez platformu ve proteinler, peptitler, hücreler, küçük moleküller, metal iyonları ve diğer hedef moleküller için SELEX teknolojisine dayalı tarama hizmetleri ile aşağı akış aptamer optimizasyonu ve tanımlama analizi hizmetlerini içeren aptamer tarama platformu.

Aptamer Sentez Platformu

SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti

SELEX aptamer kütüphanesi sentez hizmeti, esas olarak hedef moleküllere göre in vitro kimyasal sentez yoluyla çok sayıda rastgele tek zincirli oligonükleotid dizisi içeren bir kütüphane oluşturmayı içerir. Kütüphane oluşturma, büyük rastgele kütüphaneler oluşturarak sonraki tarama süreci için bol miktarda aday dizi sağlayan ve yüksek afiniteli aptamerlerin taranma olasılığını artıran SELEX teknolojisinin başlangıç noktasıdır.

Kütüphane sentezi temel olarak aşağıdaki adımlara ayrılır:

Adımlar	Teknoloji Detayları
Hedef Molekülleri Belirleyin	Aptamerler açısından taranması gereken hedef molekülleri belirleyin; bunlar proteinler, nükleik asitler, küçük moleküller, metal iyonları vb. olabilir.
Rastgele Dizi Tasarımı	Rastgele dizi uzunluğu, baz bileşimi ve diğer parametreler, hedef moleküllerin özelliklerine ve tarama gereksinimlerine göre tasarlanmıştır. Rastgele diziler genellikle onlarca ila yüzlerce baz uzunluğundadır.
Sabit Dizilerin Sentezi	Her iki ucunda sabit diziler (örneğin PCR primer dizileri) bulunan oligonükleotid parçaları tasarlanır ve sentezlenir; bunlar daha sonraki amplifikasyon ve tarama sürecinde kullanılır.

Sentezlenen kütüphanenin kalite kontrol için daha fazla işlenmesi gerekmektedir. Kütüphanenin konsantrasyonu, sonraki tarama sürecinde uygulanabilirliğini garantilemek için belirlenmiştir. Kütüphanedeki rastgele dizilerin çeşitliliği ve doğruluğu, kütüphanenin kalitesinin tarama gerekliliklerini karşıladığından emin olmak için dizileme ve diğer yöntemlerle doğrulanmıştır.

Yukarıdaki adımlarla, sonraki tarama süreci için bol miktarda aday dizi sağlayabilen, yüksek kaliteli ve oldukça çeşitli bir SELEX aptamer kütüphanesi sentezlenebilir.

Aptamer geliştirme hizmetleri (DNA, RNA veya XNA)

Aptamerler genellikle nükleik asit aptamerlerini ifade eder. Nükleik asit aptamerleri, DNA aptamerlerini, RNA aptamerlerini ve kimyasal olarak modifiye edilmiş nükleik asit aptamerleri olan XNA aptamerlerini içerir. SELEX tekniği, aptamerlerin geliştirilmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Aptamer geliştirme hizmetlerinin temel iş akışı, kütüphane oluşturma, hedef bağlama, izolasyon ve saflaştırma, amplifikasyon, çoklu tarama turları ve dizi tanımlamayı içerir. Uzun yıllardır kütüphane oluşturmaya ve aptamer geliştirme konusunda zengin deneyime odaklandık. Müşterilerimize daha iyi hizmetler sunmaya kararlıyız.

SELEX Teknoloji Süreci

SELEX süreci, her biri aşağıdaki temel adımlardan oluşan birden fazla turdan oluşur:

Kütüphane ve Hedef Ciltleme

Oluşturulan nükleik asit kütüphanesi, spesifik hedef moleküllerle (örneğin proteinler, küçük molekül bileşikleri vb.) karıştırılarak, kütüphanedeki nükleik asit dizilerinin hedef moleküllere bağlanma olanağına sahip olması sağlanır.

Bağlı Olmayan Moleküllerin İzolasyonu

Hedef moleküle bağlı olmayan nükleik asit dizileri, afinite kromatografisi, manyetik boncuk ayırma vb. gibi özel yöntemlerle karışımdan ayrılır.

Bağlayıcı Moleküllerin Amplifikasyonu

Hedef moleküle bağlı nükleik asit dizisi, genellikle polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) teknolojisi kullanılarak çoğaltılır. Sonraki tarama aşamasında, çoğaltılan diziler başlangıç kütüphanesi olarak kullanılacaktır.

Şekil 1: SELEX tarama süreci

Aptamer Tarama Platformu

Aptamer tarama hizmeti

Alpha Lifetech, farklı molekül tipleriniz için çeşitli SELEX metodolojilerini uygulayan çeşitli özel aptamer tarama hizmetleri sunmaktadır:

Hedef Türleri	Teknik Detaylar
SELEX ile Protein Aptamer Taraması	Protein aptamer taramasının temel amacı, hedef protein moleküllerine spesifik olarak bağlanabilen aptamerleri taramaktır. Bu aptamerlerin sentezlenmesi daha kolaydır, daha kararlıdır ve çevresel faktörlere daha az duyarlıdır.
SELEX ile Peptid Aptamer Taraması	Peptit aptamerleri, hedef maddelere spesifik olarak bağlanabilen ve biyomedikal alanda geniş bir uygulama potansiyeli sunan, yüksek özgüllük ve afiniteye sahip kısa peptit dizileri sınıfıdır. Spesifik bir tarama süreciyle, hedef moleküllere spesifik olarak bağlanabilen peptit aptamerleri çok sayıda rastgele peptit dizisi kütüphanesinden taranır.
Hücreye özgü Aptamer Tarama (Cell-SELEX)	Hedef hücreler veya hücre yüzeyindeki belirli moleküller hedef olarak hazırlanır. Hedefler, tüm hücreler, hücre zarındaki reseptörler, proteinler veya diğer küçük moleküller olabilir.
Capture SELEX ile Küçük Molekül Aptamer Taraması	Capture SELEX, SELEX'in bir çeşidi olan küçük molekül aptamerlerinin taranması için bir in vitro tarama tekniğidir. Capture SELEX, genellikle daha az fonksiyonel gruba sahip olan ve doğrudan katı faz desteklerine sabitlenmesi zor olan küçük molekül hedeflerinin aptamer taraması için özellikle uygundur.
Canlı Hayvan bazlı SELEX hizmetleri	Canlı hayvan bazlı tarama hizmeti, biyoloji, tıp ve biyoteknoloji alanlarında yaygın olarak kullanılan, canlı hayvanları deneysel model olarak kullanarak belirli molekülleri, ilaçları, tedavileri veya biyolojik süreçleri taramak ve değerlendirmek için kullanılan deneysel bir tekniktir. Bu hizmetler, insan vücudundaki fizyolojik ortamı simüle ederek, deneysel sonuçların insan vücudundaki etkinliğini ve güvenliğini daha doğru bir şekilde tahmin etmek ve değerlendirmek üzere tasarlanmıştır.

Aptamer optimizasyon hizmeti

Aptamerlerin hidrofilisitesi, üretim sırasında yüksek afinite kaybı ve hızlı atılımı, uygulamalarını sınırlamaktadır. Günümüzde, aptamerlerin performansını artırmak için çeşitli optimizasyon yöntemleri araştırılmaktadır.

Aptameri optimize etmek için kesme, modifikasyon, uygun gruba (tiyol, karboksi, amin, florofor, vb.) konjugasyon gibi çeşitli yollarımız da mevcuttur.

Aptamer karakterizasyon analiz hizmeti

Aptamer karakterizasyon analiz hizmeti, elde edilen aptamerin spesifik bağlanma kabiliyeti, kararlılık ve özgüllük gerekliliklerini karşıladığından emin olmak için performans değerlendirmesi, yapı çözünürlüğü ve işlevsel doğrulamasını içeren profesyonel bir hizmeti ifade eder. Bu hizmet esas olarak afinite ve özgüllük analizi, kararlılık değerlendirmesi ve biyolojik fonksiyon doğrulamasını içerir.