Nền tảng phát triển Aptamer

Aptamer là các oligonucleotide mạch đơn (DNA, RNA hoặc XNA) có đặc tính ái lực cao và tính đặc hiệu cao, liên kết đặc hiệu với các phân tử mục tiêu như kháng thể, và được sử dụng rộng rãi trong việc phát triển cảm biến sinh học, chẩn đoán và điều trị.

Nền tảng aptamer do Alpha Lifetech cung cấp bao gồm hai loại: nền tảng tổng hợp aptamer, chủ yếu bao gồm dịch vụ tổng hợp thư viện aptamer SELEX và dịch vụ phát triển aptamer (DNA, RNA hoặc XNA), và nền tảng sàng lọc aptamer bao gồm các dịch vụ sàng lọc dựa trên công nghệ SELEX đối với protein, peptide, tế bào, phân tử nhỏ, ion kim loại và các phân tử mục tiêu khác, cũng như các dịch vụ tối ưu hóa aptamer và phân tích nhận dạng tiếp theo.

Nền tảng tổng hợp Aptamer

Dịch vụ tổng hợp thư viện aptamer SELEX

Dịch vụ tổng hợp thư viện aptamer SELEX chủ yếu bao gồm việc xây dựng một thư viện chứa một lượng lớn các chuỗi oligonucleotide đơn sợi ngẫu nhiên bằng phương pháp tổng hợp hóa học trong ống nghiệm dựa trên các phân tử mục tiêu. Việc xây dựng thư viện là điểm khởi đầu của công nghệ SELEX, cung cấp nhiều chuỗi ứng viên cho quá trình sàng lọc tiếp theo bằng cách xây dựng các thư viện ngẫu nhiên khổng lồ và tăng khả năng sàng lọc các aptamer có ái lực cao.

Quá trình tổng hợp thư viện chủ yếu được chia thành các bước sau:

Các bước	Chi tiết công nghệ
Xác định các phân tử mục tiêu	Xác định các phân tử mục tiêu cần được sàng lọc để tìm aptamer, đó có thể là protein, axit nucleic, phân tử nhỏ, ion kim loại, v.v.
Thiết kế chuỗi ngẫu nhiên	Độ dài chuỗi ngẫu nhiên, thành phần bazơ và các thông số khác được thiết kế dựa trên đặc điểm của các phân tử mục tiêu và yêu cầu sàng lọc. Thông thường, các chuỗi ngẫu nhiên có độ dài từ vài chục đến vài trăm bazơ.
Tổng hợp các chuỗi cố định	Các đoạn oligonucleotide có trình tự cố định (như trình tự mồi PCR) ở cả hai đầu được thiết kế và tổng hợp, sau đó sẽ được sử dụng trong quá trình khuếch đại và sàng lọc tiếp theo.

Thư viện tổng hợp vẫn cần được xử lý thêm để kiểm soát chất lượng. Nồng độ của thư viện được xác định để đảm bảo tính ứng dụng của nó trong quá trình sàng lọc tiếp theo. Tính đa dạng và độ chính xác của các chuỗi ngẫu nhiên trong thư viện đã được xác minh bằng phương pháp giải trình tự và các phương pháp khác để đảm bảo chất lượng của thư viện đáp ứng các yêu cầu sàng lọc.

Thông qua các bước trên, có thể tổng hợp được thư viện aptamer SELEX chất lượng cao và đa dạng, cung cấp nhiều trình tự ứng viên cho quá trình sàng lọc tiếp theo.

Dịch vụ phát triển aptamer (DNA, RNA hoặc XNA)

Aptamer thường dùng để chỉ các aptamer axit nucleic. Aptamer axit nucleic bao gồm aptamer DNA, aptamer RNA và aptamer XNA (aptamer axit nucleic được biến đổi hóa học). Kỹ thuật SELEX được sử dụng rộng rãi trong việc phát triển aptamer. Quy trình cơ bản của dịch vụ phát triển aptamer bao gồm xây dựng thư viện, liên kết mục tiêu, phân lập và tinh chế, khuếch đại, sàng lọc nhiều vòng và xác định trình tự. Trong nhiều năm, chúng tôi đã tập trung vào xây dựng thư viện và có nhiều kinh nghiệm trong phát triển aptamer. Chúng tôi cam kết cung cấp cho khách hàng những dịch vụ tốt hơn.

Quy trình công nghệ SELEX

Quy trình SELEX bao gồm nhiều vòng, mỗi vòng gồm các bước chính sau:

Liên kết thư viện và mục tiêu

Thư viện axit nucleic được tạo ra sẽ được trộn với các phân tử mục tiêu cụ thể (như protein, các hợp chất phân tử nhỏ, v.v.), để các chuỗi axit nucleic trong thư viện có cơ hội liên kết với các phân tử mục tiêu.

Phân lập các phân tử không liên kết

Các chuỗi axit nucleic không liên kết với phân tử mục tiêu được tách ra khỏi hỗn hợp bằng các phương pháp đặc hiệu như sắc ký ái lực, tách bằng hạt từ tính, v.v.

Khuếch đại các phân tử liên kết

Trình tự axit nucleic liên kết với phân tử mục tiêu được khuếch đại, thường bằng công nghệ phản ứng chuỗi polymerase (PCR). Đối với giai đoạn sàng lọc tiếp theo, các trình tự được khuếch đại sẽ được sử dụng làm thư viện ban đầu.

Hình 1: Quy trình sàng lọc SELEX

Nền tảng sàng lọc Aptamer

Dịch vụ sàng lọc Aptamer

Alpha Lifetech cung cấp nhiều dịch vụ sàng lọc aptamer chuyên biệt, áp dụng các phương pháp SELEX khác nhau cho các loại phân tử khác nhau của bạn:

Các loại mục tiêu	Thông tin kỹ thuật chi tiết
Sàng lọc Aptamer Protein bằng SELEX	Mục đích chính của sàng lọc aptamer protein là tìm ra các aptamer có khả năng liên kết đặc hiệu với các phân tử protein mục tiêu. Các aptamer này dễ tổng hợp hơn, ổn định hơn và ít bị ảnh hưởng bởi các yếu tố môi trường.
Sàng lọc aptamer peptide bằng phương pháp SELEX	Aptamer peptide là một loại chuỗi peptide ngắn có tính đặc hiệu và ái lực cao, có khả năng liên kết đặc hiệu với các chất mục tiêu và thể hiện tiềm năng ứng dụng rộng rãi trong lĩnh vực y sinh học. Thông qua một quy trình sàng lọc cụ thể, các aptamer peptide có khả năng liên kết đặc hiệu với các phân tử mục tiêu được chọn lọc từ một lượng lớn thư viện chuỗi peptide ngẫu nhiên.
Sàng lọc Aptamer đặc hiệu tế bào (Cell-SELEX)	Các tế bào đích hoặc các phân tử cụ thể trên bề mặt tế bào được chuẩn bị làm mục tiêu. Mục tiêu có thể là toàn bộ tế bào, thụ thể trên màng tế bào, protein hoặc các phân tử nhỏ khác.
Sàng lọc aptamer phân tử nhỏ bằng phương pháp SELEX bắt giữ	Capture SELEX là một kỹ thuật sàng lọc trong ống nghiệm để sàng lọc các aptamer phân tử nhỏ, là một biến thể của SELEX. Capture SELEX đặc biệt phù hợp cho việc sàng lọc aptamer của các mục tiêu phân tử nhỏ, thường có ít nhóm chức và khó cố định trực tiếp trên các chất nền pha rắn.
Dịch vụ SELEX dựa trên động vật sống	Dịch vụ sàng lọc dựa trên động vật sống là một kỹ thuật thử nghiệm được sử dụng rộng rãi trong các lĩnh vực khoa học sinh học, y học và công nghệ sinh học, sử dụng động vật sống làm mô hình thử nghiệm để sàng lọc và đánh giá các phân tử, thuốc, liệu pháp hoặc quá trình sinh học cụ thể. Các dịch vụ này được thiết kế để mô phỏng môi trường sinh lý trong cơ thể người nhằm dự đoán và đánh giá chính xác hơn hiệu quả và độ an toàn của kết quả thử nghiệm trên cơ thể người.

Dịch vụ tối ưu hóa Aptamer

Tính ưa nước, sự suy giảm ái lực cao trong quá trình sản xuất và sự đào thải nhanh chóng của aptamer đã hạn chế ứng dụng của chúng. Hiện nay, nhiều phương pháp tối ưu hóa đã được nghiên cứu để nâng cao hiệu suất của aptamer.

Chúng tôi cũng có nhiều phương pháp để tối ưu hóa aptamer bao gồm cắt ngắn, sửa đổi, liên kết với nhóm thích hợp (thiol, carboxyl, amin, chất phát huỳnh quang, v.v.).

Dịch vụ phân tích đặc tính aptamer

Dịch vụ phân tích đặc tính aptamer đề cập đến dịch vụ chuyên nghiệp đánh giá hiệu năng, phân giải cấu trúc và xác minh chức năng của aptamer thu được để đảm bảo aptamer đáp ứng các yêu cầu về khả năng liên kết đặc hiệu, độ ổn định và tính đặc hiệu. Nó chủ yếu bao gồm phân tích ái lực và tính đặc hiệu, đánh giá độ ổn định và xác minh chức năng sinh học.