Việc lựa chọn dung dịch đệm cần tính đến độ ổn định của mục tiêu, môi trường vi mô liên kết và sự liên kết không đặc hiệu tối thiểu trong kịch bản ứng dụng thực tế. Các protein không liên quan, chất tẩy rửa không ion và nồng độ muối sinh lý có lợi cho việc giảm nhiễu nền. Ngoài ra còn có các điều kiện khác, chẳng hạn như một số mục tiêu có thể yêu cầu bổ sung các cation hóa trị hai hoặc các đồng yếu tố khác vào dung dịch đệm, các đồng yếu tố protein có thể được cố định cùng với mục tiêu, có thể được thêm vào dung dịch đệm phân loại, và thậm chí có thể được sử dụng như một phương tiện để bắt giữ mục tiêu.

Các yếu tố thường được xem xét để tăng áp lực chọn lọc bao gồm nồng độ phân tử mục tiêu, thời gian liên kết, cường độ rửa, v.v. Các kỹ thuật khác để tăng áp lực chọn lọc bao gồm sử dụng chất làm biến tính (như axit, urê và guanidine), dung môi hữu cơ, tăng nhiệt độ hoặc tăng nồng độ các phối tử hoặc mục tiêu cạnh tranh trong dung dịch đệm rửa.
Trong số đó, vòng sàng lọc đầu tiên rất quan trọng. Vòng sàng lọc đầu tiên nhằm mục đích thu thập càng nhiều dòng vô tính dương tính càng tốt từ thư viện đã xây dựng, đồng thời loại bỏ các dòng vô tính không đặc hiệu. Nên sử dụng các mục tiêu phủ xốp hoặc một lượng lớn mục tiêu hòa tan để đảm bảo thu được một lượng lớn phage liên kết, duy trì sự đa dạng của thư viện. Trong các vòng sàng lọc tiếp theo, áp lực chọn lọc nên được tăng lên bằng cách tăng cường quá trình làm giàu, rửa nhiều lần và tăng thời gian rửa, các dòng vô tính có ái lực cao có thể được sàng lọc.

Các thẻ kháng nguyên và vật liệu mang trong quá trình sàng lọc là để kiểm tra tất cả các chất trên các phức hợp kháng nguyên, chẳng hạn như thẻ, protein dung hợp và chất nền hỗ trợ. Việc sàng lọc âm tính các chất không phải mục tiêu có thể hạn chế sự làm giàu các kháng thể khác ngoài kháng nguyên mục tiêu.
Toàn bộ tế bào, liposome, đĩa nano-phospholipid và VLP có thể được sàng lọc âm tính bằng cách sử dụng tế bào được chuyển gen mô phỏng hoặc tế bào không được chuyển gen khi sàng lọc các dòng tế bào được chuyển gen.
Loại bỏ hỗn hợp kháng nguyên phức tạp. Có thể thực hiện sàng lọc âm tính nghiêm ngặt đối với các phân tử mục tiêu chưa biết hoặc phức tạp, chẳng hạn như toàn bộ tế bào hoặc protein không tinh khiết.
Chiến lược sử dụng kháng thể chống lại các vị trí cụ thể của kháng nguyên gồm hai phương pháp: một là tách chiết kháng thể có khả năng cạnh tranh với phối tử bằng cách thêm nồng độ phối tử cao, và phương pháp khác là ngăn chặn kháng thể.

*Việc phát hiện kháng thể ngày càng trở nên quan trọng trong y học hiện đại. Có nhiều phương pháp phát hiện kháng thể khác nhau, nhưng công nghệ hiển thị phage được sử dụng nhiều hơn trong khoa học y tế. Từ năm 1990, nhiều dạng kháng thể khác nhau đã được sử dụng để xây dựng thư viện phage, bao gồm VH, VHH, scFv, diabody và kháng thể Fab.
*Các thư viện peptide thực khuẩn cho phép xác định nhanh chóng trình tự của các epitop protein và đã trở thành một công cụ mạnh mẽ để nghiên cứu sự tương tác giữa các epitop và thụ thể kháng nguyên.
*Các mảnh kháng thể được gắn vào G3P ​​của phage M13, và bằng cách nhân bản một lượng lớn gen mã hóa mảnh kháng thể, có thể tạo ra các thư viện kháng thể hiển thị phage lớn, từ đó có thể chọn lọc ra nhiều loại kháng thể khác nhau.
Hệ thống hiển thị phage T7 có nhiều ưu điểm, bao gồm tính đơn giản, độ an toàn cao, tính ổn định, dễ bảo quản và vận chuyển, do đó hệ thống này được sử dụng trong vắc-xin phòng ngừa và điều trị.
*Hệ thống hiển thị phage T7 có thể phát hiện nhiều loại kháng nguyên khác nhau, chẳng hạn như kháng nguyên bề mặt của vi sinh vật gây bệnh và kháng nguyên ung thư.